| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 108,648 | Δ1 bp | 100% | coding (439/744 nt) | zapD ← | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 108,648 | 0 | G | . | 94.6% | 806.6 / 36.9 | 167 | coding (439/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/8); new base . (61/97); total (62/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
CACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCC > CP009273/108501‑108791 | cACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTg < 1:2508095/148‑1 (MQ=255) aCCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgg > 1:1755468/1‑148 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg > 2:1957801/1‑148 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg < 1:107754/148‑1 (MQ=255) aTCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGAt > 2:1185784/1‑148 (MQ=255) aTCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGAt > 2:1185757/1‑148 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGc > 2:2440112/1‑148 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGc > 2:2343672/1‑148 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCACTGCGCCT‑GGGTAGATGc < 1:2164923/148‑1 (MQ=255) tGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAg < 1:1361580/148‑1 (MQ=255) tGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAg < 1:1361625/148‑1 (MQ=255) aTAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGcc > 1:2964665/1‑148 (MQ=255) tAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCa > 1:98971/1‑148 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCTCCATGGTACGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaaa < 2:1067168/148‑1 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaaa < 2:701328/148‑1 (MQ=255) aaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAt > 1:3032121/1‑148 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg > 2:1694606/1‑148 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 1:3200141/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 2:1285345/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 1:713837/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 1:172473/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 1:1640843/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 1:1640756/148‑1 (MQ=255) aCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtgt < 1:2204882/148‑1 (MQ=255) cATTCTGGCTGGTTTGTTTTCGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGc < 2:3172165/148‑1 (MQ=255) aTTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCa > 1:2734011/1‑148 (MQ=255) aTTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCa < 2:727569/148‑1 (MQ=255) tCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAAt > 2:1942430/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAAt < 1:1221096/148‑1 (MQ=255) aGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGt < 2:2483152/148‑1 (MQ=255) ggCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGNATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGNAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCNCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTa < 1:1031308/148‑1 (MQ=255) gCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAg < 2:904127/148‑1 (MQ=255) gCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAg > 1:1345728/1‑148 (MQ=255) gCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAg < 1:1972269/148‑1 (MQ=255) gCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAg > 2:429612/1‑148 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa < 1:854462/148‑1 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa < 2:1520758/148‑1 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa < 2:2177416/148‑1 (MQ=255) tttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaaa > 1:962995/1‑148 (MQ=255) ttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAAt < 2:2185725/148‑1 (MQ=255) ttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAAt < 2:522610/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 2:3256095/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 2:3256067/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 2:19691/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 1:1577826/148‑1 (MQ=255) ttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaaa < 2:401704/148‑1 (MQ=255) tACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAg < 2:1037639/148‑1 (MQ=255) aaGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCa < 1:1165599/148‑1 (MQ=255) ggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACa > 1:1871104/1‑148 (MQ=255) ggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACa > 2:1353902/1‑148 (MQ=255) ggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACa > 1:1868674/1‑148 (MQ=255) aCTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCt < 2:621659/148‑1 (MQ=255) cTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTg < 1:2541756/148‑1 (MQ=255) ggCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTggg < 1:2435733/148‑1 (MQ=255) gCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTggg < 2:2597274/148‑1 (MQ=255) gCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGa > 1:694382/1‑148 (MQ=255) gAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATg < 1:1961011/148‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATg > 1:1802368/1‑148 (MQ=255) aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGc < 2:2740739/148‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGc > 1:90498/1‑148 (MQ=255) aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGc > 1:90217/1‑148 (MQ=255) aTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCt < 1:1527289/148‑1 (MQ=255) tAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCa > 2:432114/1‑148 (MQ=255) aaTCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGt < 2:2751888/148‑1 (MQ=255) 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tGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaa < 2:3036021/148‑1 (MQ=255) tGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaa < 2:1822331/148‑1 (MQ=255) tGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaa < 2:1755468/148‑1 (MQ=255) tGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGa < 2:3196394/148‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCAGGCTGTCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGAt < 1:1130175/148‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGa < 1:2053873/148‑1 (MQ=255) cGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCtt < 1:2069358/148‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCa < 1:2345660/148‑1 (MQ=255) tCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACg < 1:455695/148‑1 (MQ=255) tCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGc > 1:2394628/1‑148 (MQ=255) 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cgcCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTcc < 1:1035810/148‑1 (MQ=255) | CACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCC > CP009273/108501‑108791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |