| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009273 | 3744959 = | 186 (0.990) | 1276 (6.800) | 239/274 | NT | 87.7% | coding (270/741 nt) | yiaT | putative outer membrane protein |
| ? | CP009273 | = 3752673 | 171 (0.910) | coding (549/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor | |||||
Only 100 of 1570 total aligned reads displayed.
CCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCTTCGTATTTTCA > CP009273/3744812‑3745106 | ttggcggtttctgttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccacgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtag > 1:3278775‑M1/148‑148 (MQ=255) tggcggtttctgttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtagg < 2:141206‑M1/2‑1 (MQ=255) tggcggtttctgttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtagg < 1:225126‑M1/2‑1 (MQ=255) tttctgttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGt < 1:3223566‑M1/8‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGTCATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCaa < 2:2329998/148‑1 (MQ=255) gttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAAt > 1:1892593‑M1/136‑148 (MQ=255) ttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAAtt < 2:2000988‑M1/14‑1 (MQ=255) ttggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAAtt < 1:2651360‑M1/14‑1 (MQ=255) ggctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTcc > 2:3100729‑M1/133‑148 (MQ=255) gctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCa < 2:1591093‑M1/17‑1 (MQ=255) gctggttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCa > 1:932754‑M1/132‑148 (MQ=255) ttttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGc < 2:1850611‑M1/22‑1 (MQ=255) tttgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCa > 2:1364708‑M1/126‑148 (MQ=255) tgcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATc > 2:1258336‑M1/124‑148 (MQ=255) gcgcatgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATcc > 1:992524‑M1/123‑148 (MQ=255) aGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATcc < 2:252402/148‑1 (MQ=255) gAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCa > 1:1405728/1‑148 (MQ=255) catgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAgg < 2:1533376‑M1/29‑1 (MQ=255) catgcagcgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAgg > 1:1055649‑M1/120‑148 (MQ=255) cgcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGt > 1:2934642‑M1/113‑148 (MQ=255) gcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTc > 1:1541457‑M1/112‑148 (MQ=255) gcacgtacacgcatcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTc > 2:3230449‑M1/112‑148 (MQ=255) aGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTc < 2:2283899/148‑1 (MQ=255) 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catcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTc < 2:387322‑M1/48‑1 (MQ=255) tttCACGGGTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCa < 2:2879333/148‑1 (MQ=255) tcggtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAt < 2:2468346‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt < 1:144119‑M1/53‑1 (MQ=255) gtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt < 1:2984532‑M1/53‑1 (MQ=255) gtttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt > 1:3040392‑M1/96‑148 (MQ=255) tttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttt < 1:2013614‑M1/54‑1 (MQ=255) tttatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttt < 2:266670‑M1/54‑1 (MQ=255) ttatttacaccagtcagccagagagaatcgcctaccatcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagccaggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCATCGGCATCCAGGATGAGGTCAGGCTAAGTTCAtttttt < 1:548391‑M1/55‑1 (MQ=255) tatttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttttttt < 1:283023‑M1/56‑1 (MQ=255) atttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGTGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTc > 1:872760‑M1/92‑148 (MQ=255) ttacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacgtccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCAc > 2:1307483‑M1/90‑148 (MQ=255) ccccAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCAc > 2:2237506/1‑148 (MQ=255) tacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGTATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACt > 1:2086010‑M1/89‑148 (MQ=255) tacaccagtcagccagagtgaatcgcctaccttcacttccccgcttaacgccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACt > 2:2765881‑M1/89‑148 (MQ=255) 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ccgtaccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCAc < 1:1724353‑M1/110‑1 (MQ=255) taccggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCtt > 2:2722674‑M1/36‑148 (MQ=255) ggtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATa > 1:737085‑M1/32‑148 (MQ=255) gtgacgaccagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATaa > 1:158050‑M1/31‑148 (MQ=255) gTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAAt < 1:3099029/148‑1 (MQ=255) accagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATc > 1:2687219‑M1/25‑148 (MQ=255) accagcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATc < 2:3040769‑M1/124‑1 (MQ=255) gcccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCg < 2:880364‑M1/128‑1 (MQ=255) cccggcaccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCgg < 2:3288558‑M1/129‑1 (MQ=255) ccggctccttttactgtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATTAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGa > 2:633889‑M1/19‑148 (MQ=255) accttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGc < 2:1225543‑M1/135‑1 (MQ=255) accttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGc > 1:672488‑M1/14‑148 (MQ=255) ccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGcc < 2:1678409‑M1/136‑1 (MQ=255) ccttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGcc < 1:2159760‑M1/136‑1 (MQ=255) cttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCt > 1:1157001‑M1/12‑148 (MQ=255) cttttacggtaGGTAGGGTCAAAGTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCt < 2:29459‑M1/137‑1 (MQ=255) ttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCtt < 2:1746098‑M1/138‑1 (MQ=255) ttttacggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCtt < 2:57624‑M1/138‑1 (MQ=255) acggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCTTCGTa < 2:1790386‑M1/142‑1 (MQ=255) acggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCTTCGTa > 1:349111‑M1/7‑148 (MQ=255) ttATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCTTCGTAt < 2:1966392/148‑1 (MQ=255) ggtaGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCTTCGTAtt > 1:45276‑M1/5‑148 (MQ=255) | CCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAACGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAACGCTCGTGGTGATACCAGGCAACCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGGTCTGACGAACATAAAAAGTATCACCTTCATAACTAATCAGCGGAATTGCCTTCGTATTTTCA > CP009273/3744812‑3745106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |