| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1463497 | NA (NA) | 7 (0.040) | 6/274 | NT | 3.1% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | CP009273 | 1520976 = | 217 (1.160) | coding (473/618 nt) | yncG | glutathione S‑transferase homolog | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAG > CP009273/1520829‑1521122 | tCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGa < 2:1803009/148‑1 (MQ=255) tCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGa < 2:2045172/148‑1 (MQ=255) tCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGa < 2:377274/148‑1 (MQ=255) cGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTgg > 1:583458/1‑147 (MQ=255) gATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGtt < 2:592254/148‑1 (MQ=255) ttACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTAt > 1:786337/1‑148 (MQ=255) aCCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCt > 1:1978682/1‑148 (MQ=255) cTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTg > 2:1453667/1‑148 (MQ=255) tGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGc < 1:613778/148‑1 (MQ=255) gCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACt < 2:3111699/148‑1 (MQ=255) cGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTa > 2:758042/1‑148 (MQ=255) cGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTa < 2:1256814/148‑1 (MQ=255) ttGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATg > 2:335355/1‑148 (MQ=255) ggCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATgcgc > 2:2124829/1‑148 (MQ=255) gCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGca > 2:1958326/1‑148 (MQ=255) gCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGca > 2:232328/1‑148 (MQ=255) tGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATgg < 1:2832963/148‑1 (MQ=255) cGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATggggg < 1:3206565/148‑1 (MQ=255) cGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATggggg > 1:1504542/1‑148 (MQ=255) cGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATggggg > 1:1186806/1‑148 (MQ=255) aCCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGTGGGCCt < 2:1001961/148‑1 (MQ=255) aCCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCt < 1:1143400/148‑1 (MQ=255) ccTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTg < 2:3066593/148‑1 (MQ=255) ccTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTg < 2:3032468/148‑1 (MQ=255) ccTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTg < 1:1896198/148‑1 (MQ=255) aaCAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCa < 1:1344112/148‑1 (MQ=255) cAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATg > 1:1593313/1‑148 (MQ=255) aGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGa > 2:1196099/1‑148 (MQ=255) ttAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAAt < 1:1726931/148‑1 (MQ=255) tAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATg < 1:25469/148‑1 (MQ=255) aaaGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATgg > 2:2959755/1‑148 (MQ=255) agaagaATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGACTGGtt > 2:2677533/1‑148 (MQ=255) gaagaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGttt < 2:26495/148‑1 (MQ=255) gaagaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGttt < 1:3110363/148‑1 (MQ=255) aagaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTc < 1:3153746/148‑1 (MQ=255) agaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCa > 1:1289077/1‑148 (MQ=255) agaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCa < 2:1846060/148‑1 (MQ=255) agaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCa > 2:2508086/1‑148 (MQ=255) agaaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCa > 1:2909497/1‑148 (MQ=255) aaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAgg < 2:786337/148‑1 (MQ=255) aaTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAgg < 2:2444201/148‑1 (MQ=255) aTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGa > 1:1080154/1‑148 (MQ=255) aTGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGa < 1:2379652/148‑1 (MQ=255) ttATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATaa > 1:2610924/1‑148 (MQ=255) tATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAAt > 2:946749/1‑148 (MQ=255) tATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAAt > 1:3270459/1‑148 (MQ=255) aTTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATg > 1:2679987/1‑148 (MQ=255) aTTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATg > 1:1026697/1‑148 (MQ=255) ttGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGc < 2:429591/148‑1 (MQ=255) tGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGcc < 1:1676197/148‑1 (MQ=255) tGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGcc > 2:3163811/1‑148 (MQ=255) aaTATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCAc > 1:3110844/1‑148 (MQ=255) aaTATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCAc > 1:2797396/1‑148 (MQ=255) aaTATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCAc > 1:2459583/1‑148 (MQ=255) tatCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGa < 2:1596967/148‑1 (MQ=255) cGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAata < 1:1464250/148‑1 (MQ=255) gAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAatat < 1:1930814/148‑1 (MQ=255) aaaaTCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATc < 2:1928036/148‑1 (MQ=255) aaaTCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCa < 1:1907462/148‑1 (MQ=255) aaTCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAg > 1:1453554/1‑148 (MQ=255) aTCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGt > 2:3183479/1‑148 (MQ=255) aTCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGt < 1:1698554/148‑1 (MQ=255) tCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTg > 1:2162801/1‑148 (MQ=255) tCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTg > 2:2937824/1‑148 (MQ=255) tCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGAAACTAACGATGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACAGGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTg > 1:442032/1‑148 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGAt < 2:1129346‑M2/82‑1 (MQ=255) tatCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCt > 1:2298913/1‑148 (MQ=255) atCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTg > 2:933791/1‑148 (MQ=255) atCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTg > 1:2034366/1‑148 (MQ=255) tGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATg < 1:1375258/148‑1 (MQ=255) gTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCt > 2:504109/1‑148 (MQ=255) ttGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTg < 2:699839/148‑1 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGTCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATg < 2:75332‑M2/97‑1 (MQ=255) ttCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGt < 1:1400186/148‑1 (MQ=255) ttCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGt > 1:1987076/1‑148 (MQ=255) tCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTc > 2:517873/1‑148 (MQ=255) tCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGGTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTc > 2:1461473/1‑148 (MQ=255) cAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGt > 1:1578667/1‑148 (MQ=255) cAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGt > 2:2844995/1‑148 (MQ=255) gCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTa < 2:734242/148‑1 (MQ=255) cTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTAc < 2:1884332/148‑1 (MQ=255) tCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTAcc > 1:360014/1‑148 (MQ=255) aCTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGa > 1:805977/1‑148 (MQ=255) tgctgAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGaaa < 2:2601534/148‑1 (MQ=255) tgctgAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGaaa < 1:758042/148‑1 (MQ=255) gAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTAc > 1:1017051/1‑148 (MQ=255) gAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCA‑GATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACa < 1:3024916/148‑1 (MQ=255) aaCCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACa < 2:1080154/148‑1 (MQ=255) aTGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGt < 2:1334508/148‑1 (MQ=255) gCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTAt < 1:2061034/148‑1 (MQ=255) tttGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTaa > 2:1759179/1‑148 (MQ=255) gagattcagggggccagtctaTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTaaa < 2:3132041‑M2/127‑1 (MQ=255) aCTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGaa < 2:167186/148‑1 (MQ=255) cTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGaaa > 2:1712209/1‑148 (MQ=255) aCGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAatta > 2:2161569/1‑148 (MQ=255) cGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAattat > 1:2472453/1‑148 (MQ=255) cGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAattat > 1:1961380/1‑148 (MQ=255) cGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAattat < 2:2804520/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAattatt < 2:1504542/148‑1 (MQ=255) ggtggACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGa > 1:1764165/1‑148 (MQ=255) | CTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAG > CP009273/1520829‑1521122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |