| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,869,780 | G→A | 93.0% | intergenic (‑92/‑160) | cysD ← / → iap | sulfate adenylyltransferase, subunit 2/aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,869,780 | 0 | G | A | 93.0% | 697.9 / 32.4 | 227 | intergenic (‑92/‑160) | cysD/iap | sulfate adenylyltransferase, subunit 2/aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/13); new base A (92/119); total (95/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TGGATGCTTTCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATGAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGCATGGTA > CP009273/2869636‑2869925 | tGCTTTCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGtt > 1:1639982/1‑148 (MQ=255) cTTTCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTcc < 1:2536412/148‑1 (MQ=255) cTTTCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTcc > 2:2275049/1‑148 (MQ=255) cTTTCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTcc < 1:882117/148‑1 (MQ=255) tCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTa < 2:1142001/148‑1 (MQ=255) tCCGCCTACAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCTTATTTGATCCATAACCGTTACTTTGCAATACAGCTATTTTCTTGCCATCATATGTTTCGACTATAGGTAGCGTAAGAGAAAGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTATTTCCTTa < 2:2794149/148‑1 (MQ=255) ccGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTaa > 1:2659769/1‑148 (MQ=255) cGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAAc < 2:2022316/148‑1 (MQ=255) cTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGa < 1:358892/148‑1 (MQ=255) cTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGa < 1:3093904/148‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGaa > 1:1616606/1‑148 (MQ=255) tCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGaa > 1:1863942/1‑148 (MQ=255) cAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATa < 2:2872167/148‑1 (MQ=255) aGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATaa > 1:1746104/1‑148 (MQ=255) ttGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACg > 2:2225322/1‑148 (MQ=255) ttGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATATGATCCATAACCGATCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGGCCTCAGATGTTTCGACGATAGGGAGCGTAAGAGAACCAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCATAACGGAATaaag > 2:1805725/1‑146 (MQ=255) tGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCTTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGTGATCGTAAGAGAACGAATGAAATGACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGa < 1:222655/148‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGa < 1:3050689/148‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGa < 1:222687/148‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGa < 1:1407643/148‑1 (MQ=255) aGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGc > 2:2950213/1‑148 (MQ=255) gTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCt > 1:2789637/1‑148 (MQ=255) gTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCt > 1:1713167/1‑148 (MQ=255) tAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTa < 2:1547842/148‑1 (MQ=255) tAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTa < 1:3176500/148‑1 (MQ=255) aaGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTaa < 2:1432345/148‑1 (MQ=255) aaGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTaa < 2:2574504/148‑1 (MQ=255) aGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAat < 1:2549534/148‑1 (MQ=255) tCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAatat > 1:2614953/1‑148 (MQ=255) tCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAatat > 1:396183/1‑148 (MQ=255) tATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCaa > 1:1787215/1‑148 (MQ=255) tATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCaa > 1:2065797/1‑148 (MQ=255) tATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCaa > 2:2157121/1‑148 (MQ=255) aTTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCaaa < 2:1179493/148‑1 (MQ=255) aTTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCaaa < 2:2830349/148‑1 (MQ=255) ttGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCaaaaa > 1:720490/1‑148 (MQ=255) tGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAg < 1:2324502/148‑1 (MQ=255) aTCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATGAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTg < 1:407657/148‑1 (MQ=255) aTCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTg < 1:652090/148‑1 (MQ=255) ccATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCGTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCt > 2:169824/1‑148 (MQ=255) aaCCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAg > 2:1874291/1‑148 (MQ=255) ccGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGc < 1:763844/148‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCa > 2:1688623/1‑148 (MQ=255) cGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCa < 1:2332986/148‑1 (MQ=255) cGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCa < 2:146191/148‑1 (MQ=255) gTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCAc < 1:135684/148‑1 (MQ=255) ttCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCAcc > 2:1467855/1‑148 (MQ=255) ttCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTAAACGGAATAACGATTTGGCAACGCTAATATCAAAAAGAGCTTAAGGCAcc > 2:2044317/1‑148 (MQ=255) ccTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCgg < 1:934648/148‑1 (MQ=255) ccTTTGCAAGACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCgg < 1:2925648/148‑1 (MQ=255) tGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGAttt < 2:1220757/148‑1 (MQ=255) cAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCg < 2:1369079/148‑1 (MQ=255) aCCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCg < 1:2403588/148‑1 (MQ=255) cGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGtt < 1:2661437/148‑1 (MQ=255) cTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGACAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTa < 1:3128577/148‑1 (MQ=255) cTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGAt < 2:1292353/148‑1 (MQ=255) aTCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGaaa < 2:2520045/148‑1 (MQ=255) aTCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGaaa > 1:1919175/1‑148 (MQ=255) tCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAAt < 1:2700844/148‑1 (MQ=255) cAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAAtt > 2:1858813/1‑148 (MQ=255) cAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAAtt > 2:1525648/1‑148 (MQ=255) gATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATGAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGt < 2:2985113/148‑1 (MQ=255) aTGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGtt > 1:2910173/1‑148 (MQ=255) aTGTTTCGACTATAGGGAGCGTAACAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGtt > 2:23726/1‑148 (MQ=255) gTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGtttt > 1:1166828/1‑148 (MQ=255) cGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAgcg < 2:3251032/148‑1 (MQ=255) gACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAgcgc < 2:3032361/148‑1 (MQ=255) tataGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACTGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGGTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTATCGCAga > 2:2916246/1‑147 (MQ=255) gggAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCa < 2:2557965/148‑1 (MQ=255) gggAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCa < 1:2275049/148‑1 (MQ=255) ggAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGACTAATTAGTTCCTAAACGGAATAACGAATTGGCAAAGATAATATCAAAAAGTGCTTAAGTCACAGGATTTCGGGCTGTGAGGAAGAGTTGAAATAGTTTTAGAGCAGCGGCAg > 2:1494707/1‑148 (MQ=255) cGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTc < 2:1639836/148‑1 (MQ=255) gTAAGATAACGAATGAAATTAACAATTAGAATAAGTAGTTACTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATAAATAAGTGCTTATTGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCa < 1:834324/148‑1 (MQ=255) gTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCa < 1:36571/148‑1 (MQ=255) aaGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATa > 1:2986847/1‑148 (MQ=255) agaACGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTa < 2:47254/148‑1 (MQ=255) agaACCAATGAAATTACCACTTAGAATAAGTACTTCCTTAACGGAATAACGATATGGCAAAGCTAATATCATAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTa < 2:1723565/148‑1 (MQ=255) aaCGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATg < 2:2338644/148‑1 (MQ=255) aaCGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATg < 2:478432/148‑1 (MQ=255) aaCGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATg > 1:115302/1‑148 (MQ=255) cGAATGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGc < 1:3262267/148‑1 (MQ=255) aaTGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAAAGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCgg < 1:380008/148‑1 (MQ=255) aaTGAAATTAACAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAATCTAATATCAAAAAGTGCTTAATGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCgg < 1:124861/148‑1 (MQ=255) aTGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGt < 2:1616606/148‑1 (MQ=255) aTGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGt < 1:277530/148‑1 (MQ=255) aTGAAATTACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGt > 2:1888776/1‑148 (MQ=255) aaaTTACCAATTAGAATGAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTaaa < 1:2564304/148‑1 (MQ=255) ttACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTaaaaaa > 1:2091678/1‑148 (MQ=255) tACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTaaaaaaa < 2:2087036/148‑1 (MQ=255) tACCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTaaaaaaa > 1:1373391/1‑148 (MQ=255) aCCAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAAt < 2:3126707/148‑1 (MQ=255) ccAATTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAAtt < 2:2753232/148‑1 (MQ=255) aaTTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTg > 1:904809/1‑148 (MQ=255) aTTAGAATAAGTATTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGc < 2:776102/148‑1 (MQ=255) aTTAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGc > 1:1064093/1‑148 (MQ=255) tAGAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGCAt < 1:2158179/148‑1 (MQ=255) gAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGTCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGCATgg < 2:2783324/148‑1 (MQ=255) gAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGCATgg > 2:2327511/1‑148 (MQ=255) gAATAAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGCATgg > 2:2160434/1‑148 (MQ=255) ttGAGTTGGTCCTTAACGTAATAAAGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGTGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCTCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAATAAAATTTGCATGGTa < 2:2749739/147‑1 (MQ=255) | TGGATGCTTTCCGCCTCCAGTTGCCGCAGGTGAGTAAGTCGTATTTGATCCATAACCGTTCCTTTGCAATACCGCTATTTTCTTGCCATCAGATGTTTCGACTATAGGGAGCGTAAGAGAACGAATGAAATTACCAATTAGAATGAGTAGTTCCTTAACGGAATAACGATTTGGCAAAGCTAATATCAAAAAGTGCTTAAGGCACCGGATTTCGGGCGTTTAGGAAGATTTGAAATTGTTTTAGCGCAGCGGCAGTTTCATACTATGGCGGTAAAAAAATTTGCATGGTA > CP009273/2869636‑2869925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |