| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,914,100 | C→A | 13.1% | A2A (GCG→GCT) | gudX ← | glucarate dehydratase‑related protein, substrate unknown |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,914,100 | 0 | C | A | 13.1% | 540.0 / 41.0 | 167 | A2A (GCG→GCT) | gudX | glucarate dehydratase‑related protein, substrate unknown |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/77); new base A (14/8); total (82/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TGCCGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGATATA > CP009273/2913955‑2914244 | tGCCGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGc > 2:2174558/1‑148 (MQ=255) cGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCAt < 2:23854/148‑1 (MQ=255) cGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCAt < 1:152059/148‑1 (MQ=255) cGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCAt < 1:285364/148‑1 (MQ=255) cGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCAt < 2:1700382/148‑1 (MQ=255) ggTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATc < 2:2686355/148‑1 (MQ=255) gTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCt < 1:2121075/148‑1 (MQ=255) gTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCt < 1:1548966/148‑1 (MQ=255) aTGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTa > 2:3115157/1‑148 (MQ=255) aTGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTa > 2:3115031/1‑148 (MQ=255) ttATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCa < 1:766436/148‑1 (MQ=255) aTCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAAc < 1:332331/148‑1 (MQ=255) aTCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAAc < 1:995268/148‑1 (MQ=255) tCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCACCa > 2:2534574/1‑148 (MQ=255) cGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAg > 1:531340/1‑148 (MQ=255) gTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGt < 2:2729351/148‑1 (MQ=255) tACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCaa > 2:1833097/1‑148 (MQ=255) tACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCaa < 1:1020937/148‑1 (MQ=255) ccACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACt > 1:2335967/1‑148 (MQ=255) caATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGa < 2:1901722/148‑1 (MQ=255) caATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGa < 2:1901724/148‑1 (MQ=255) aaTATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGAt < 1:2208251/148‑1 (MQ=255) atatTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATa > 2:3249193/1‑148 (MQ=255) tatTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACAAACATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATAc > 1:453797/1‑148 (MQ=255) ttGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGc < 2:968216/148‑1 (MQ=255) gCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCtt < 1:2508834/148‑1 (MQ=255) gCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCtt < 1:2508909/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTg < 2:2398241/148‑1 (MQ=255) gTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGata > 1:1956367/1‑148 (MQ=255) tGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGatat > 2:2835391/1‑148 (MQ=255) gAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATc > 1:1694760/1‑148 (MQ=255) gAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATc > 1:3113597/1‑148 (MQ=255) aaaTATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCg < 2:3042084/148‑1 (MQ=255) atatGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGcc < 1:1394672/148‑1 (MQ=255) atatGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGcc > 1:3229360/1‑148 (MQ=255) tGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCccac > 2:2556096/1‑148 (MQ=255) gCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCccacc > 2:1968986/1‑148 (MQ=255) gCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCccacc > 2:2016434/1‑148 (MQ=255) gCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCccacc > 1:1641028/1‑148 (MQ=255) aTGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAAAAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCcaccagcac > 2:1568238/1‑148 (MQ=255) tgtgCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCCCCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCcaccagcacc > 2:104402/1‑148 (MQ=255) tgtgCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCcaccagcacc > 1:884592/1‑148 (MQ=255) ccccACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGt > 2:495129/1‑148 (MQ=255) ccaccaATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAg < 1:1658390/148‑1 (MQ=255) caccaATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGc < 2:235870/148‑1 (MQ=255) accaATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCt < 2:838995/148‑1 (MQ=255) caATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCa > 1:3278163/1‑148 (MQ=255) atatTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGt > 2:753689/1‑148 (MQ=255) atatTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGt > 1:2593484/1‑148 (MQ=255) tAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACcg < 2:921138/148‑1 (MQ=255) aGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACcgcg > 1:2277904/1‑148 (MQ=255) gCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGa > 1:398291/1‑148 (MQ=255) aCATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTa < 1:768898/148‑1 (MQ=255) aCATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTa < 2:309659/148‑1 (MQ=255) cTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCa < 1:2215800/148‑1 (MQ=255) cTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCa < 1:1355424/148‑1 (MQ=255) gTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATg > 1:2989735/1‑148 (MQ=255) gTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATg < 1:1033432/148‑1 (MQ=255) tCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGa > 1:2330683/1‑148 (MQ=255) tCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGa < 1:3286310/148‑1 (MQ=255) tGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAaca < 2:2911805/148‑1 (MQ=255) ccGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGTTTAAGGCATGAACACCa < 2:2698621/148‑1 (MQ=255) ccGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCa < 2:2988190/148‑1 (MQ=255) ccGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCa < 2:2988014/148‑1 (MQ=255) ggCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAAc < 1:2807736/148‑1 (MQ=255) ccACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACAt < 1:1724942/148‑1 (MQ=255) cACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATa > 2:866960/1‑148 (MQ=255) cctgAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATaaa < 1:694613/145‑1 (MQ=255) ccGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATAGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATaaa > 2:590126/1‑148 (MQ=255) cGGAATGACTTTCATGTCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAAt < 2:33498/148‑1 (MQ=255) cGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAAt < 2:2796494/148‑1 (MQ=255) cGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAAt < 1:640351/148‑1 (MQ=255) gAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCa < 2:82922/148‑1 (MQ=255) aTGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAgc > 1:1137324/1‑148 (MQ=255) tGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAgcg > 1:1249804/1‑148 (MQ=255) gACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAgcgc > 1:2086133/1‑148 (MQ=255) aCTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGcc > 2:381430/1‑148 (MQ=255) aCTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGcc > 1:781374/1‑148 (MQ=255) cTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGccc > 1:1410418/1‑148 (MQ=255) ttCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCa > 1:1198111/1‑148 (MQ=255) tCATCTCAGTAATAACATGACTGGAGTGTGTCGCCATCTTATTGACCCGCAACAGTTTTCAAATCGATACGCTTGATATCTCCCACCAGCACCAGGTACATCAGTACCGCGATTAATAAATGAACAACAACATAAATCAGCGCCCCAt > 2:51298/1‑148 (MQ=255) tatCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTaa > 1:981024/1‑148 (MQ=255) tatCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTaa > 1:9094/1‑148 (MQ=255) atCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTaaa > 2:1389140/1‑148 (MQ=255) cAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACg < 1:2008485/148‑1 (MQ=255) aGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGa < 1:495129/148‑1 (MQ=255) taataaCAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGc > 1:2505586/1‑148 (MQ=255) taataaCAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGc > 2:519733/1‑148 (MQ=255) aataaCAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGcc > 1:918599/1‑148 (MQ=255) aataaCAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGcc > 1:1948952/1‑148 (MQ=255) ataaCAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACAAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCa < 1:1454496/148‑1 (MQ=255) taaCAGGACTGGATTGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAg > 2:2966465/1‑148 (MQ=255) aaCAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGt < 2:2062662/148‑1 (MQ=255) aCAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTc > 2:3248450/1‑148 (MQ=255) gATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACg > 1:1517396/1‑148 (MQ=255) aTTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGa > 1:3165642/1‑148 (MQ=255) aTTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGa < 1:766763/148‑1 (MQ=255) ttGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGat > 2:8196/1‑148 (MQ=255) ttGTGTAGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGat > 2:8612/1‑148 (MQ=255) tgtgTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGata > 1:745231/1‑148 (MQ=255) | TGCCGGTATGCCCGGCGTTATCGGTGAGTACCACAATATTGCGGGTGAAATATGCGTTATGTGCCCCACCAATATTAAGCAACATGCTGTCATGCCCGGCCACCGGAATGACTTTCATATCAGTAATAACAGGACTGGATTGTGTCGCCATCTTATTGCCCCGCAACAGGTTTCAACTCGATACGCTTGATATCGCCCACCAGCACCAGGTAGCTCAGTACCGCGATTAAGGCATGAACACCAACATAAATCAGCGCCCCATTAAACGAGCCAGTCGTGCCAACGATATA > CP009273/2913955‑2914244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |