| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,024,983 | C→G | 100% | G86G (GGC→GGG) | uacT → | uric acid permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,024,983 | 0 | C | G | 99.5% | 782.9 / ‑5.4 | 192 | G86G (GGC→GGG) | uacT | uric acid permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (95/96); minor base T (0/1); total (95/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > CP009273/3024838‑3025127 | ccTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGgcgc < 2:1987037/148‑1 (MQ=255) ccTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGgcgc < 2:319832/148‑1 (MQ=255) tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCttt < 1:1793417/148‑1 (MQ=255) tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCttt < 1:1537699/148‑1 (MQ=255) gTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTa < 1:2847938/148‑1 (MQ=255) tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTGCTGTTATTATTTGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTAATTCGATGCTCATTATCTCGGCTCTCTTTTTCTGCGGGATCGTGACAATATTGGAATGTATAGGTATCGGGCGCTTTAt > 2:313134/1‑148 (MQ=255) aTGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgg < 2:3272194/148‑1 (MQ=255) gTACGCCGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgggg < 2:1954797/148‑1 (MQ=255) gTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACGGGGCCTCTCAAAAGAAGCTAGTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgggg < 2:1954310/148‑1 (MQ=255) tACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGa < 1:1714858/148‑1 (MQ=255) aCGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGAt < 1:1651731/148‑1 (MQ=255) aCGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCAATAGCTCGGAGCTGTTTTGGTGCGGGATCGTCACCGTATTGCAATGGATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGAt > 2:943147/1‑148 (MQ=255) cGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATc < 1:2680950/148‑1 (MQ=255) cGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATc < 1:1026984/148‑1 (MQ=255) gCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGc < 2:1625609/148‑1 (MQ=255) aGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCg < 2:2523930/148‑1 (MQ=255) tCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt > 1:789164/1‑148 (MQ=255) gCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGa < 2:2103668/148‑1 (MQ=255) cTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTNTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATACGCCTGACGGTGAt > 1:1677814/1‑148 (MQ=255) cTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGAt > 1:1166367/1‑148 (MQ=255) gTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTa > 1:1458870/1‑148 (MQ=255) ttCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTAt > 2:2049517/1‑148 (MQ=255) ccTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGt < 1:1827925/148‑1 (MQ=255) ctctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTc < 1:374335/148‑1 (MQ=255) ctctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTc < 1:354768/148‑1 (MQ=255) ctgaTGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCgg < 2:1048505/145‑1 (MQ=255) gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAcc < 2:2071387/148‑1 (MQ=255) gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAcc < 1:633698/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCt < 1:2653190/148‑1 (MQ=255) ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 1:313177/148‑1 (MQ=255) aCCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtgctgc < 2:2167641/148‑1 (MQ=255) aCTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGCTCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTa > 2:1992572/1‑148 (MQ=255) aCTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTa > 1:39836/1‑148 (MQ=255) ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAacac > 2:163309/1‑148 (MQ=255) gCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGAACTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAcc > 2:518607/1‑148 (MQ=255) ccTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCa > 2:2902875/1‑148 (MQ=255) ccTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCa < 1:2382/148‑1 (MQ=255) tctcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAt < 1:1425304/148‑1 (MQ=255) tctcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAt < 1:3179327/148‑1 (MQ=255) ctcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATg > 2:3164234/1‑148 (MQ=255) ctcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATg < 2:1041949/148‑1 (MQ=255) cAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGAt > 2:2527522/1‑148 (MQ=255) cAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGAt < 1:1087953/148‑1 (MQ=255) aaaGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAg > 1:2162113/1‑148 (MQ=255) aaaGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAg < 1:821850/148‑1 (MQ=255) aagaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGc < 2:2602914/148‑1 (MQ=255) aagaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGc > 1:902583/1‑148 (MQ=255) gaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCa > 2:2240140/1‑148 (MQ=255) aagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCAt < 1:727177/148‑1 (MQ=255) aagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCAt < 1:135401/148‑1 (MQ=255) cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTgg > 1:2041281/1‑148 (MQ=255) cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTgg > 2:1862324/1‑148 (MQ=255) tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTggg < 2:2299156/148‑1 (MQ=255) aTTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGa > 2:3044838/1‑148 (MQ=255) aTTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGa > 1:2559458/1‑148 (MQ=255) aTTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGa > 1:2834468/1‑148 (MQ=255) ttGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt > 2:272377/1‑148 (MQ=255) cGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGaa < 2:356123/148‑1 (MQ=255) tGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgggg > 2:679626/1‑77 (MQ=255) gCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCg > 1:2798551/1‑148 (MQ=255) tCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGa > 2:1284501/1‑148 (MQ=255) gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg > 1:1029862/1‑148 (MQ=255) gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg > 2:2400459/1‑148 (MQ=255) gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg > 2:2400265/1‑148 (MQ=255) gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg > 1:3082122/1‑148 (MQ=255) tCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGcc < 2:262158/148‑1 (MQ=255) tCGGATCTCTTGTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGcc < 2:466840/148‑1 (MQ=255) cGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCct > 1:2067036/1‑148 (MQ=255) ggATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctg < 1:3036817/148‑1 (MQ=255) tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCAGCCGGTGATTATGGCGGGGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATAGCGGGctgcgg > 2:2153701/1‑146 (MQ=255) ttttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGa > 1:1944608/1‑148 (MQ=255) gctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCGTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATAtt > 1:2774171/1‑148 (MQ=255) cGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGt < 1:2923315/148‑1 (MQ=255) gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 2:2158243/1‑148 (MQ=255) gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 2:1783406/1‑148 (MQ=255) gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 1:2576623/1‑148 (MQ=255) aTCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCa > 2:462093/1‑148 (MQ=255) aTCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCa > 2:1425959/1‑148 (MQ=255) aTCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCa > 1:2462601/1‑148 (MQ=255) cGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACt < 2:2559570/148‑1 (MQ=255) tCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTAt < 1:1306880/148‑1 (MQ=255) cacaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATc > 1:417642/1‑148 (MQ=255) acaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcg > 2:605461/1‑148 (MQ=255) caTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGTGATATTTGGTGCCACTATcgc > 2:1541951/1‑148 (MQ=255) ttattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGCTATTTGGTGCCACTATcgccg > 2:421145/1‑148 (MQ=255) tattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 1:2367473/1‑148 (MQ=255) ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg > 2:187682/1‑148 (MQ=255) ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg > 2:187925/1‑148 (MQ=255) gCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGt < 2:2478309/148‑1 (MQ=255) cAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGTCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtt > 2:2977010/1‑148 (MQ=255) aTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtttt > 2:2475891/1‑148 (MQ=255) aTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACAATCGCCGCGGGtttt > 1:2509951/1‑148 (MQ=255) tGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTa > 2:1476254/1‑148 (MQ=255) tatcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATc < 2:1142817/148‑1 (MQ=255) atcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATca > 2:1582795/1‑148 (MQ=255) cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc < 1:1186818/148‑1 (MQ=255) cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc > 1:1045223/1‑148 (MQ=255) ggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacca > 1:2846206/1‑148 (MQ=255) cggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACatta < 2:1451225/148‑1 (MQ=255) cggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACatta < 2:2288253/148‑1 (MQ=255) | TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > CP009273/3024838‑3025127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |