| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,194,342 | 0 | T | G | 11.1% | 513.2 / 60.9 | 207 | intergenic (‑18/‑224) | ygiF/ygiM | inorganic triphosphatase/SH3 domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/102); new base G (11/12); total (93/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.26e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GCGTTTCGTAGTAAATATTCAGCAACTGCACGGGGTCATGGTGCTCGCCGCCCAGCGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTTGACGGGCGTAAAAGTTTGAAGCAGTGGCAAGACCTGACACAGAGGATTCCGAT > CP009273/3194195‑3194489 | gCGTTTCGTAGTAAATATTCAGCAACTGCACGGGGTCATGGTGCTCGCCGCCCAGCGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGtt < 1:700044/148‑1 (MQ=255)gCGTTTCGTAGTAAATATTCAGCAACTGCACGGGGTCATGGTGCTCGCCGCCCAGCGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGtt < 1:700166/148‑1 (MQ=255)gCGTTTCGTAGTAAATATTCAGCAACTGCACGGGGTCATGGTGCTCGCCGCCCAGCGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGtt < 2:1947550/148‑1 (MQ=255) tttCGTAGTAAATATTCAGCAACTGCACGGGGTCATGGTGCTCGCCGCCCAGCGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATg < 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ttATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTTGACGGGCGTAAAAGTTTGAAGCAGTGGCAAGACCTGACACAGAGGATTCCGa < 1:1381211/148‑1 (MQ=255) | GCGTTTCGTAGTAAATATTCAGCAACTGCACGGGGTCATGGTGCTCGCCGCCCAGCGTATTGAGATGGTCACGCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTTGCGCCAAATTGCCATGCAACGGGCAATTTGACGGGCGTAAAAGTTTGAAGCAGTGGCAAGACCTGACACAGAGGATTCCGAT > CP009273/3194195‑3194489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |