Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,334,464 | C→A | 88.3% | S277R (AGC→AGA) | yrbG → | putative calcium/sodium:proton antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,334,464 | 0 | C | A | 88.3% | 451.6 / 61.0 | 188 | S277R (AGC→AGA) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/10); new base A (91/75); total (103/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-01 |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TAGCGGGGGTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGAATA > CP009273/3334319‑3334610 | tAGCGGGGGTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGt > 1:2411410/1‑148 (MQ=255) tAGCGGGGGTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGt > 2:1322916/1‑148 (MQ=255) gCGGGGGTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGa > 2:2045381/1‑148 (MQ=255) gggggTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATg < 1:614955/148‑1 (MQ=255) ggggTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGt > 1:1061562/1‑148 (MQ=255) ggggTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGt < 2:861023/148‑1 (MQ=255) gCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTAGAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGt < 1:2965802/148‑1 (MQ=255) gCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGt < 1:1083740/148‑1 (MQ=255) aaGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAg < 2:3104382/148‑1 (MQ=255) aaGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAg > 2:1382467/1‑148 (MQ=255) ggTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCa > 1:460883/1‑148 (MQ=255) ggTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCa < 1:2520334/148‑1 (MQ=255) ggTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCa < 1:2517005/148‑1 (MQ=255) ggTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTAGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCa > 2:516279/1‑148 (MQ=255) gTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCat > 2:1731487/1‑148 (MQ=255) tGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCatt < 2:1172317/148‑1 (MQ=255) tGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCatt < 2:1171995/148‑1 (MQ=255) gAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCatta < 1:2647185/148‑1 (MQ=255) aacaCGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCattat < 2:654866/145‑1 (MQ=255) aaaaCGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCattat < 2:1496916/148‑1 (MQ=255) aaaaCGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCattat < 2:939914/148‑1 (MQ=255) aaaaCGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCattat < 2:2592848/148‑1 (MQ=255) gACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTg < 1:3051625/148‑1 (MQ=255) aCATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGc > 1:1042776/1‑148 (MQ=255) cATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCg < 1:2414328/148‑1 (MQ=255) aTTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGt > 1:1268633/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTtgc < 2:570431/148‑1 (MQ=255) tGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTtgctg > 2:411911/1‑148 (MQ=255) cGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTtgctgtgc < 1:516110/148‑1 (MQ=255) cGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTtgctgtgc > 1:913808/1‑148 (MQ=255) cGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTtgctgtgc < 1:2864054/148‑1 (MQ=255) aaTATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTggc > 1:826898/1‑148 (MQ=255) tatCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGATTGATGTTTCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTggcgg > 1:1410812/1‑148 (MQ=255) atCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTggcggc > 2:3183841/1‑148 (MQ=255) atCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTggcggc > 1:2086535/1‑148 (MQ=255) cATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGgcgc > 2:2953325/1‑148 (MQ=255) ttGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTc > 2:2988693/1‑148 (MQ=255) tGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTcc < 1:1480901/148‑1 (MQ=255) tGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTcc < 1:676055/148‑1 (MQ=255) cAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCCGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCa > 2:1621099/1‑148 (MQ=255) cAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCa > 2:2215999/1‑148 (MQ=255) cATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCg > 1:2436052/1‑148 (MQ=255) cATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCg > 2:2298204/1‑148 (MQ=255) aTTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCgg > 2:1845841/1‑148 (MQ=255) tttttAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTTCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCggg > 1:1936574/1‑148 (MQ=255) tttttAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCggg > 1:1936587/1‑148 (MQ=255) ttttAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGc > 1:231570/1‑148 (MQ=255) tatTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCgtggt > 1:1332623/1‑148 (MQ=255) tatTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCgtggt > 1:11803/1‑148 (MQ=255) tatTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCgtggt > 1:3177045/1‑148 (MQ=255) tGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTa > 2:1712184/1‑148 (MQ=255) tGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTa > 2:1712114/1‑148 (MQ=255) aTCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAgggg < 2:2378248/148‑1 (MQ=255) cGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGta > 2:507105/1‑148 (MQ=255) tgtTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGtatt > 1:2786023/1‑148 (MQ=255) gtTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGtatta > 2:180937/1‑148 (MQ=255) gtTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGtatta < 2:3278295/148‑1 (MQ=255) ttGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGtattat > 2:461755/1‑148 (MQ=255) gggTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTAttatta < 2:1098769/148‑1 (MQ=255) ggTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTaa < 1:1558879/148‑1 (MQ=255) gTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAAc < 1:365515/148‑1 (MQ=255) tttACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACt > 2:329250/1‑148 (MQ=255) ttACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTg < 2:1268443/148‑1 (MQ=255) ccGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCgg < 2:410733/148‑1 (MQ=255) cgcgCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGa < 1:2002613/148‑1 (MQ=255) gcgcTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGAt < 1:3075849/148‑1 (MQ=255) gcgcTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGAt < 1:1857051/148‑1 (MQ=255) gcTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGAttt < 2:1806008/148‑1 (MQ=255) cTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTa < 2:3118572/148‑1 (MQ=255) aTAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCg > 2:2125875/1‑148 (MQ=255) tAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGt < 2:999489/148‑1 (MQ=255) tAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGt > 2:1856669/1‑148 (MQ=255) aaCGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTa > 2:1921285/1‑148 (MQ=255) aCGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGTCGGATTTATCGTAt > 2:2578873/1‑148 (MQ=255) gCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTAtgg < 2:2496669/148‑1 (MQ=255) ggAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTAtggctgg > 2:494894/1‑148 (MQ=255) ggAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTAtggctgg > 1:738152/1‑148 (MQ=255) agagaTTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATTTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCg > 1:721461/1‑148 (MQ=255) gaTTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGAtg < 1:1673540/148‑1 (MQ=255) tGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGAtgttg > 2:2620088/1‑148 (MQ=255) gATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGAtgttgt < 2:1061562/148‑1 (MQ=255) aTCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTa < 1:405342/148‑1 (MQ=255) ccACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACt < 2:2143068/148‑1 (MQ=255) ccACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCGGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACt < 2:930338/148‑1 (MQ=255) cACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTg < 2:1415310/148‑1 (MQ=255) cACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGGTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTg < 2:3058576/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTgg < 1:663516/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGTACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTgg < 1:522100/148‑1 (MQ=255) tACAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGc < 1:173371/148‑1 (MQ=255) aCAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGGATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGcc > 1:1225759/1‑148 (MQ=255) cAGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCa > 1:477525/1‑148 (MQ=255) aGTCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCaa > 2:3065403/1‑148 (MQ=255) tCGTGACTACAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATa > 2:2571110/1‑148 (MQ=255) aCTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGt < 2:2436026/148‑1 (MQ=255) aCAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGa > 1:1824326/1‑148 (MQ=255) aCAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGa > 1:3179153/1‑148 (MQ=255) aCAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGa > 1:161775/1‑148 (MQ=255) aCAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGa < 1:1389926/148‑1 (MQ=255) aCAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGa > 1:2167571/1‑148 (MQ=255) cAGAGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGaa > 2:2030012/1‑148 (MQ=255) | TAGCGGGGGTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAACGCCAGGAGAGATTGATCCACTGGCGTACAGTCGTGACTACAGCGTGATGTTGCTGGTGAGCATTATTTTTGCGTTGCTGTGCTGGCGGCGCTCCCCGCAACCGGGCCGTGGTGTAGGGGTATTATTAACTGGCGGATTTATCGTATGGCTGGCGATGTTGTACTGGTTATCGCCAATACTCGTTGAATA > CP009273/3334319‑3334610 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |