| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,416,376 | G→T | 8.9% | A194A (GCG→GCT) | yhdZ → | putative amino‑acid transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,416,376 | 0 | G | T | 8.9% | 621.0 / 23.9 | 176 | A194A (GCG→GCT) | yhdZ | putative amino‑acid transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/88); new base T (8/8); total (79/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
CGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGT > CP009273/3416229‑3416520 | cGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCACCGCGTTGCCATTGCGCGGTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGgcg < 2:1763186/148‑1 (MQ=255) ggACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGgcgc < 2:959818/148‑1 (MQ=255) aCAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAg < 1:100620/148‑1 (MQ=255) aGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTc < 1:1469913/148‑1 (MQ=255) tttCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCTCAGTCggg > 1:2138993/1‑148 (MQ=255) ttCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGt > 1:1945959/1‑148 (MQ=255) tCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTa < 2:2309697/148‑1 (MQ=255) tCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTa > 1:1577576/1‑148 (MQ=255) cAGGTGGTCAGCAGCCACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTAt < 2:3005311/148‑1 (MQ=255) aGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATg < 2:2795145/148‑1 (MQ=255) ggtggtCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGa < 1:3064027/148‑1 (MQ=255) ggtCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCTCAGTCGGGTATGACaa < 1:1900887/148‑1 (MQ=255) ggtCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACaa < 2:2103113/148‑1 (MQ=255) ggtCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACaa > 1:1731450/1‑148 (MQ=255) gtCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAAt > 2:470624/1‑148 (MQ=255) tCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAAtg < 2:3068760/148‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAAtg < 2:1425914/148‑1 (MQ=255) cagcagCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAAtgt < 2:2801730/148‑1 (MQ=255) cagcaACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAAtgttgt > 2:3270362/1‑148 (MQ=255) agcaACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTtgtg < 1:1419428/148‑1 (MQ=255) gcaACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTtgtgt < 2:1635757/148‑1 (MQ=255) caACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTtgtgtg > 2:1210898/1‑148 (MQ=255) caACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTtgtgtg < 2:1077299/148‑1 (MQ=255) caACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGAGGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTtgtgtg > 2:1845364/1‑148 (MQ=255) gcgTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAac < 2:2862235/148‑1 (MQ=255) gcgTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAac < 2:35914/148‑1 (MQ=255) cgTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAaca < 2:2355155/148‑1 (MQ=255) ttGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAAcaca > 1:2891800/1‑148 (MQ=255) tGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACAt > 2:1291130/1‑148 (MQ=255) tGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATg < 2:1953011/148‑1 (MQ=255) cgcgTTCGATGTTTATGAAGCAGAAAATTATGTTGATTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATggg < 2:3015213/148‑1 (MQ=255) gcgTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATgggg < 1:661351/148‑1 (MQ=255) gcgTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATgggg < 1:2323151/148‑1 (MQ=255) gcgTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATgggg < 2:318211/148‑1 (MQ=255) cgTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGt < 2:626546/148‑1 (MQ=255) cgTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGt < 2:2173956/148‑1 (MQ=255) tCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTg < 1:3038736/148‑1 (MQ=255) gCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCa < 2:3068548/148‑1 (MQ=255) gtATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAAc > 1:363462/1‑148 (MQ=255) gAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTc > 2:2367945/1‑148 (MQ=255) aaGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCg > 2:3196458/1‑148 (MQ=255) aaGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCg < 1:2378226/148‑1 (MQ=255) gCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCt > 2:1563020/1‑148 (MQ=255) aTTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCggg > 1:1288820/1‑148 (MQ=255) aTTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCggg > 2:149914/1‑148 (MQ=255) tATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTa > 2:1782100/1‑148 (MQ=255) gttgttTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCTCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAAtt > 2:1280218/1‑148 (MQ=255) gttgttTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCTCAGTCGGGTATGACAAAGTTGTGTTTAACACATGAGAGGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAAtt > 2:1791321/1‑148 (MQ=255) gttgttTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAAtt > 2:2689346/1‑148 (MQ=255) ttgttTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAAttt > 2:1239755/1‑148 (MQ=255) ttgttTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAAttt < 1:962467/148‑1 (MQ=255) gttTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAAttttt < 2:3039969/148‑1 (MQ=255) tttGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTa < 1:2516457/148‑1 (MQ=255) ttGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTAt < 2:1755368/148‑1 (MQ=255) atgaGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACAGGAGTGGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGa > 1:843917/1‑148 (MQ=255) tgaGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGAt < 2:1257552/148‑1 (MQ=255) aGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCTCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCg < 2:739959/148‑1 (MQ=255) cAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTgg < 1:1747700/148‑1 (MQ=255) cAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTgg < 2:565063/148‑1 (MQ=255) cGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGa > 1:1110472/1‑148 (MQ=255) cGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGa > 2:895566/1‑148 (MQ=255) tCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGaaa > 2:2015396/1‑148 (MQ=255) cGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAAt > 2:794388/1‑148 (MQ=255) cGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAAt > 2:794385/1‑148 (MQ=255) gcTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTg < 1:1722463/148‑1 (MQ=255) cTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTgg < 2:2981758/148‑1 (MQ=255) cTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTgg > 1:1240031/1‑148 (MQ=255) cTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTgg < 1:572536/148‑1 (MQ=255) aTCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCa > 2:3146032/1‑148 (MQ=255) aTCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCa < 1:759423/148‑1 (MQ=255) aTCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCa < 1:2419801/148‑1 (MQ=255) tCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCaa > 1:2279533/1‑148 (MQ=255) tCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCaa > 2:2526847/1‑148 (MQ=255) tCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCaa > 2:871347/1‑148 (MQ=255) aTGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCAc > 2:1162757/1‑148 (MQ=255) aTGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCAc < 1:468157/148‑1 (MQ=255) gTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCtg > 2:2795911/1‑148 (MQ=255) gTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCtg < 2:311076/148‑1 (MQ=255) tGACAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCtga < 1:2086054/148‑1 (MQ=255) aaaGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCtgatg > 2:2714168/1‑148 (MQ=255) gagGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAAt < 2:2650370/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAAttt < 2:1180149/148‑1 (MQ=255) gTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCTCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAAtttt < 2:1163541/148‑1 (MQ=255) gATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTgcgc < 2:119282/148‑1 (MQ=255) tACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCAt > 2:289056/1‑148 (MQ=255) tACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCAt < 1:2015396/148‑1 (MQ=255) tACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCAt > 2:1224292/1‑148 (MQ=255) tACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCAt > 2:1957261/1‑148 (MQ=255) aCGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATc > 2:2255794/1‑148 (MQ=255) tgatTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTaa < 1:2800463/148‑1 (MQ=255) gatTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTaaa > 2:3189819/1‑148 (MQ=255) ttGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATc > 1:2984413/1‑148 (MQ=255) ttGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATc > 2:471440/1‑148 (MQ=255) gggCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCag < 2:1733724/148‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCaga < 1:1070444/148‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCagag < 1:2713518/148‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCagag < 1:2712335/148‑1 (MQ=255) ggCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGt < 2:1548096/148‑1 (MQ=255) ggCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGt > 1:3220075/1‑148 (MQ=255) ggCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGt > 1:1528693/1‑148 (MQ=255) | CGGACAGATTTCAGGTGGTCAGCAGCAACGCGTTGCCATTGCGCGTTCGCTGTGTATGAAGCCGAAAATTATGTTGTTTGATGAGCCAACGTCGGCGCTCGATCCTGAGATGGTGAAAGAGGTGCTGGATACGATGATTGGGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGT > CP009273/3416229‑3416520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |