| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,422,726 | G→T | 88.4% | V44V (GTG→GTT) | yrdA → | bacterial transferase hexapeptide domain protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,422,726 | 0 | G | T | 88.4% | 528.6 / 62.5 | 214 | V44V (GTG→GTT) | yrdA | bacterial transferase hexapeptide domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (11/14); new base T (77/112); total (88/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TATTGCTGAGGTAAGTATGTCTGATGTTTTACGCCCATACCGCGATCTTTTTCCACAAATCGGTCAGCGCGTAATGATCGACGATAGCAGTGTCGTGATTGGTGACGTTCGTCTGGCTGATGATGTGGGGATCTGGCCGCTCGTTGTGATTCGTGGAGATGTACATTATGTACAGATCGGAGCACGCACCAATATCCAGGATGGCAGTATGTTGCATGTCACTCATAAATCCTCGTACAACCCAGATGGCAACCCATTAACCATTGGCGAAGATGTCACTGTTGGTCACAAG > CP009273/3422579‑3422870 | tATTGCTGAGGTAAGTATGTCTGATGTTTTACGCCCATACCGCGATCTTTTTCCACAAATCGGTCAGCGCGTAATGATCGACGATAGCAGTGTCGTGATTGGTGACGTTCGTCTGGCTGATGATGTGGGGATCTGGCCGCTCGTtgtg > 1:547612/1‑148 (MQ=255) tGCTGAGGTAAGTATGTCTGATGTTTTACGCCCATACCGCGATCTTTTTCCACAAATCGGTCAGCGCGTAATGATCGACGATAGCAGTGTCGTGATTGGTGACGTTCGTCTGGCTGATGATGTGGGGATCTGGCCGCTCGTTGTTAtt < 1:1588080/148‑1 (MQ=255) tGCTGAGGTAAGTATGTCTGATGTTTTACGCCCATACCGCGATCTTTTTCCACAAATCGGTCAGCGCGTAATGATCGACGATAGCAGTGTCGTGATTGGTGACGTTCGTCTGGCTGATGATGTGGGGATCTGGCCGCTCGTTGTTAtt < 1:85419/148‑1 (MQ=255) gCTGAGGTAAGTATGTCTGATGTTTTACGCCCATACCGCGATCTTTTTCCACAAATCGGTCAGCGCGTAATGATCGACGATAGCAGTGTCGTGATTGGTGACGTTCGTCTGGCTGATGATGTGGGGATCTGGCCGCTCGTTGTTAtta > 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tgttATTCGTGGAGATGTACATTATGTACAGATCGGAGCACGCACCAATATCCAGGATGGCAGTATGTTGCATGTCACTCATAAATCCTCGTACAACCCAGATGGCAACCCATTAACCATTGGCGAAGATGTCACTGTTGGTCACAAg > 1:1944781/1‑148 (MQ=255) | TATTGCTGAGGTAAGTATGTCTGATGTTTTACGCCCATACCGCGATCTTTTTCCACAAATCGGTCAGCGCGTAATGATCGACGATAGCAGTGTCGTGATTGGTGACGTTCGTCTGGCTGATGATGTGGGGATCTGGCCGCTCGTTGTGATTCGTGGAGATGTACATTATGTACAGATCGGAGCACGCACCAATATCCAGGATGGCAGTATGTTGCATGTCACTCATAAATCCTCGTACAACCCAGATGGCAACCCATTAACCATTGGCGAAGATGTCACTGTTGGTCACAAG > CP009273/3422579‑3422870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |