| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 301,998 | T→A | 15.3% | T177T (ACA→ACT) | ecpD ← | polymerized tip adhesin of ECP fibers |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 301,998 | 0 | T | A | 15.3% | 540.8 / 80.5 | 196 | T177T (ACA→ACT) | ecpD | polymerized tip adhesin of ECP fibers |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/76); new base A (19/11); total (109/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GCGAGTGGGTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTG > CP009273/301853‑302145 | gCGAGTGGGTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGt > 1:389991/1‑148 (MQ=255) aGTGGGTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTaaa < 1:2299746/148‑1 (MQ=255) gTGGGTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAg < 1:1468493/148‑1 (MQ=255) tGGGTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAgc < 2:50513/148‑1 (MQ=255) ggTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAgctg < 1:1038230/148‑1 (MQ=255) ggTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAgctg < 1:1197626/148‑1 (MQ=255) gTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAgctgc < 1:2850864/148‑1 (MQ=255) gTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAgctgc < 1:642380/148‑1 (MQ=255) tATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAgctgct > 1:331145/1‑148 (MQ=255) aTTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGctgctg > 2:2470968/1‑148 (MQ=255) aTTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGctgctg > 1:263367/1‑148 (MQ=255) aTCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGa > 2:2886231/1‑148 (MQ=255) aCCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACggg < 2:2999405/148‑1 (MQ=255) ccGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGc > 1:727339/1‑148 (MQ=255) cGTAGATTTGCTGCTTTCGTAGGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCa < 2:1243351/148‑1 (MQ=255) gTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCAt < 1:1075019/148‑1 (MQ=255) tAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCAtt > 2:820878/1‑148 (MQ=255) gATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATttg < 2:2924711/148‑1 (MQ=255) aTTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATttgt < 2:2306206/148‑1 (MQ=255) aTTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATttgt < 2:2086867/148‑1 (MQ=255) aTTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATttgt > 2:1619934/1‑148 (MQ=255) ctgctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCat < 1:2185769/148‑1 (MQ=255) ctgctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCat > 2:1886658/1‑148 (MQ=255) tgctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCata > 1:1065824/1‑148 (MQ=255) tgctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCata < 2:3211281/148‑1 (MQ=255) gctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCatat > 2:3115446/1‑148 (MQ=255) ctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGTTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACTGGCATTTGTTGCAaata > 1:853489/1‑148 (MQ=255) ctTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCAtata < 2:2044887/148‑1 (MQ=255) tCGTATGGGTGACGGTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTg < 1:161177/148‑1 (MQ=255) tCGTAGGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTg < 2:2884048/148‑1 (MQ=255) tATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTa > 2:506284/1‑148 (MQ=255) aTGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTaa > 1:3129022/1‑148 (MQ=255) tGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTaaa < 1:1146174/148‑1 (MQ=255) gggTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTaaaa < 2:3195652/148‑1 (MQ=255) gggTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTaaaa < 1:1996509/148‑1 (MQ=255) ggTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAAc > 2:2466899/1‑148 (MQ=255) aCGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGt > 1:1030954/1‑148 (MQ=255) ttGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTg < 1:3088993/148‑1 (MQ=255) tGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGa < 1:1379634/148‑1 (MQ=255) aCATACGAGTTGCCGGAGGACTGATGCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTTGCAGGCATTGATGGTCATTGTTAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGacaaca < 2:1920232/148‑1 (MQ=255) aCATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGacaaca < 2:2425036/148‑1 (MQ=255) aCATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGacaaca < 1:3067679/148‑1 (MQ=255) aCATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGacaaca > 1:3198716/1‑148 (MQ=255) cATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACAt > 1:1015344/1‑148 (MQ=255) tACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGc > 1:244329/1‑148 (MQ=255) tACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGc < 1:590378/148‑1 (MQ=255) aCCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGcc > 2:526299/1‑148 (MQ=255) ccAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCg > 2:1294822/1‑148 (MQ=255) ccAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCAGTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCg > 2:2947587/1‑148 (MQ=255) aGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTg > 2:326539/1‑148 (MQ=255) gTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGc > 2:1187655/1‑148 (MQ=255) ttGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCa > 2:2860552/1‑148 (MQ=255) tGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCAt < 1:1214380/148‑1 (MQ=255) tGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCAt < 1:2662060/148‑1 (MQ=255) ggAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCAc < 1:407265/148‑1 (MQ=255) aGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACtt > 2:855777/1‑148 (MQ=255) aGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACtt > 2:854531/1‑148 (MQ=255) ggCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTACAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTc > 1:487989/1‑148 (MQ=255) ggCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTc > 2:1842587/1‑148 (MQ=255) ggCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTc > 1:2150168/1‑148 (MQ=255) gCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTcg < 2:3081423/148‑1 (MQ=255) ccTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTcgc > 2:1982612/1‑148 (MQ=255) ccTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTcgc > 2:2732545/1‑148 (MQ=255) tGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCa < 2:1358551/140‑1 (MQ=255) cTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGcgccgccg < 2:1065824/148‑1 (MQ=255) cGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCa < 2:2131469/148‑1 (MQ=255) tGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCAcc < 2:2620947/148‑1 (MQ=255) ccgcTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTcg > 1:913888/1‑148 (MQ=255) ccgcTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTcg > 1:1766419/1‑148 (MQ=255) ctgctgGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCgcgc > 1:1412459/1‑148 (MQ=255) ctgctgGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCgcgc > 1:3057211/1‑148 (MQ=255) gCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATaaa > 2:2920867/1‑148 (MQ=255) gCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATaaa > 2:2921048/1‑148 (MQ=255) tCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATc > 1:2578196/1‑148 (MQ=255) aTAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGAGGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCa < 2:356174/148‑1 (MQ=255) aTAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCa < 2:1814477/148‑1 (MQ=255) aTAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACGTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCa < 2:356171/148‑1 (MQ=255) tAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCAc < 1:2256610/148‑1 (MQ=255) tAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCAc > 1:2942816/1‑148 (MQ=255) gTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTg > 2:2416933/1‑148 (MQ=255) ttCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTgg > 1:2780110/1‑148 (MQ=255) caGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTc > 1:612356/1‑148 (MQ=255) agagGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCg > 2:551099/1‑148 (MQ=255) gagGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCgg < 1:2698626/148‑1 (MQ=255) agGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCggt > 1:1403039/1‑148 (MQ=255) ggTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCggtg < 1:1911880/148‑1 (MQ=255) ggTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCggtg < 1:820878/148‑1 (MQ=255) ggTCTGGCAGGCATTGATGGTCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCggtg > 2:1083967/1‑148 (MQ=255) cTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGtt < 2:1434514/148‑1 (MQ=255) ggcaggcaTTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTg < 2:3077492/148‑1 (MQ=255) ggcaggcaTTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTg < 2:920444/148‑1 (MQ=255) gcaggcaTTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGc > 1:2395422/1‑148 (MQ=255) caggcaTTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCg > 1:2026203/1‑148 (MQ=255) aTTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAgg > 1:1685377/1‑148 (MQ=255) ttGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGa > 1:2924928/1‑148 (MQ=255) tGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAg < 1:854535/148‑1 (MQ=255) tGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAg < 1:855777/148‑1 (MQ=255) tCATAGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACt > 1:15315/1‑148 (MQ=255) ttGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACtggt < 2:623167/148‑1 (MQ=255) tGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACtggtg < 2:2498731/148‑1 (MQ=255) | GCGAGTGGGTATTTATCAACCGTAGATTTGCTGCTTTCGTATGGGTGACGTTGCGAACATACCAGTTGCCGGAGGCCTGATCCTTACAGCGTGCGCCGCTGCTGGCGTCATAGTTCACAGAGGTCTGGCAGGCATTGATGGTCATTGTAAAGCTGCTGCCGACGGGCATTTGTTGCATATACTGGTAAAACGCGTCTGACAACATGCCGTGCATCCACTTCGCGCCGCCGCTGGTCACCGTCGCGCCATAAAATCCACTGGCGTCGGTGGTTTGCGGCAGGATAAGACTGGTG > CP009273/301853‑302145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |