| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,525,950 | 0 | C | T | 8.5% | 761.6 / 40.7 | 223 | intergenic (‑152/‑227) | yhgE/pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (101/103); new base T (11/8); total (112/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |