Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,812,077 | T→G | 15.0% | intergenic (+133/‑157) | dinD → / → yicG | DNA damage‑inducible protein/UPF0126 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,812,077 | 0 | T | G | 15.0% | 420.6 / 83.5 | 193 | intergenic (+133/‑157) | dinD/yicG | DNA damage‑inducible protein/UPF0126 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (89/75); new base G (13/16); total (102/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
ACAGAGAAGAAATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGATTTTTAGG > CP009273/3811930‑3812224 | aCAGAGAAGAAATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCAtt < 1:1674930/148‑1 (MQ=255) aCAGAGAAGAAATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCAtt < 1:1674698/148‑1 (MQ=255) agagAAGAAATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCAtttt < 2:659398/148‑1 (MQ=255) agaagaAATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTtct > 2:3159532/1‑148 (MQ=255) aagaaATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCa > 1:149754/1‑148 (MQ=255) gaaATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGa > 1:2770479/1‑148 (MQ=255) aaaTAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGAc < 2:2607863/148‑1 (MQ=255) aaaTAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGAc < 1:2724008/148‑1 (MQ=255) aaTAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACa > 1:1631477/1‑148 (MQ=255) aGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACaaga < 2:2360932/148‑1 (MQ=255) gCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACACTGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACaagaa > 1:2174648/1‑148 (MQ=255) gCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACaagaa < 1:1315928/148‑1 (MQ=255) gCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACaagaa > 1:779231/1‑148 (MQ=255) gCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTCCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATTCATTTTCTCAGACaagaa < 1:1834936/148‑1 (MQ=255) aGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGt < 1:788004/148‑1 (MQ=255) aGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGt < 1:2379276/148‑1 (MQ=255) gAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTc < 2:2056091/148‑1 (MQ=255) gAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTc < 1:608975/148‑1 (MQ=255) aaaCTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCa > 2:1258457/1‑148 (MQ=255) aaaCTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCa > 2:1739168/1‑148 (MQ=255) aCTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCaga > 1:453043/1‑148 (MQ=255) aaaaaCTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCagaaga < 2:3297166/148‑1 (MQ=255) aaaaCTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAgaagaa > 2:1819842/1‑148 (MQ=255) aaaCTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAAt > 2:1383476/1‑148 (MQ=255) aCTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGc > 1:3208573/1‑148 (MQ=255) ctctTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCa > 1:574743/1‑148 (MQ=255) tctTTTTGTTGAGTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCAt < 2:3228459/148‑1 (MQ=255) ctTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCAtc > 2:1569231/1‑148 (MQ=255) ctTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCAtc > 2:798471/1‑148 (MQ=255) ctTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCAtc > 1:1302630/1‑148 (MQ=255) ttgaGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGa < 2:2445091/148‑1 (MQ=255) agaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTTCAGTTAACACAATTGCTAAATATTGAACCGTTCTTTTCCCCCTAAGTTTTAACCTATTTGTTATTATGCATTTTCTCAGACTAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACCGaaaa < 2:2379480/148‑1 (MQ=255) agaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGaaaa < 1:2586280/148‑1 (MQ=255) agaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGaaaa < 1:976496/148‑1 (MQ=255) gaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAAt < 2:2024901/148‑1 (MQ=255) gaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAAt < 2:2664375/148‑1 (MQ=255) gaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAAt < 2:358677/148‑1 (MQ=255) gaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAAt > 2:390356/1‑148 (MQ=255) gaCACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAAt > 2:390449/1‑148 (MQ=255) ccGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGa > 2:2095502/1‑148 (MQ=255) ccGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGa > 2:339630/1‑148 (MQ=255) ccGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGa > 2:2095529/1‑148 (MQ=255) gCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAAc > 2:2461653/1‑148 (MQ=255) gTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAg < 1:1259136/148‑1 (MQ=255) tCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGt > 2:2582604/1‑148 (MQ=255) ccAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGtt < 2:3086017/148‑1 (MQ=255) ccAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGtt < 2:1301574/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTa < 2:705871/148‑1 (MQ=255) aGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTAt < 1:1659207/148‑1 (MQ=255) gTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCa > 1:2912811/1‑148 (MQ=255) tGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCaa < 2:3131161/148‑1 (MQ=255) gCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAAt < 2:2192151/148‑1 (MQ=255) aGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAAttt < 2:574743/148‑1 (MQ=255) gAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtccc < 2:1160253/148‑1 (MQ=255) cacaATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtcccctc > 2:1048494/1‑148 (MQ=255) cacaATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtcccctc > 2:2700459/1‑148 (MQ=255) acaATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtcccctcc < 1:1455766/148‑1 (MQ=255) caATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtcccctccc > 2:665507/1‑148 (MQ=255) caATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtcccctccc < 2:1294240/148‑1 (MQ=255) caATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTGTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTtcccctccc < 2:1911514/148‑1 (MQ=255) tGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCtt > 1:1079806/1‑148 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa > 1:1823107/1‑148 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa > 1:2685902/1‑148 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa > 2:1102875/1‑148 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa < 1:126030/148‑1 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa > 1:1388958/1‑148 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa < 1:2615628/148‑1 (MQ=255) aaaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGAATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaa > 1:150993/1‑148 (MQ=255) aaTATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTaaaaaa > 2:3204387/1‑148 (MQ=255) tatTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTTCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCACCTCCCCATAAAAAAtc > 1:921937/1‑148 (MQ=255) atTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAAtct > 2:713364/1‑148 (MQ=255) cACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAAt < 2:1219501/148‑1 (MQ=255) ccTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCg > 1:2466114/1‑148 (MQ=255) ctttctttTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGt < 1:2700459/148‑1 (MQ=255) ctttctttTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGt < 1:1048494/148‑1 (MQ=255) tttctttTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTg > 1:2143932/1‑148 (MQ=255) ttctttTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGa > 2:1004438/1‑148 (MQ=255) tctttTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCACCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGAc > 2:3074209/1‑148 (MQ=255) tCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATgc > 2:3011491/1‑148 (MQ=255) ccccTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATgcgc > 2:776079/1‑148 (MQ=255) ccTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGcac > 2:2842885/1‑148 (MQ=255) tCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATATCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACaa > 1:2542333/1‑148 (MQ=255) tCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACaa < 2:2514661/148‑1 (MQ=255) cAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACaaa > 1:1597547/1‑148 (MQ=255) cAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACaaa > 1:3036143/1‑148 (MQ=255) gTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATc > 2:1314432/1‑148 (MQ=255) gTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATc > 2:2914168/1‑148 (MQ=255) gTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATc > 2:2912287/1‑148 (MQ=255) tAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTa > 2:2744530/1‑148 (MQ=255) tATTTTTTCTTATGCATGTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTg > 2:2422871/1‑148 (MQ=255) tCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCcagaca < 1:1569231/148‑1 (MQ=255) tATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGAt > 1:2419818/1‑148 (MQ=255) tATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGAt > 2:1029680/1‑148 (MQ=255) tGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGAttt < 1:329888/148‑1 (MQ=255) tGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGAttt > 2:160749/1‑148 (MQ=255) aTTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGATTTTTa < 2:1929480/148‑1 (MQ=255) tttCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGATTTTTAgg > 1:2561458/1‑148 (MQ=255) tttCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGATTTTTAgg < 1:2671910/148‑1 (MQ=255) tttCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGATTTTTAgg < 2:2281309/148‑1 (MQ=255) tttCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCATAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGAGTTTTAgg > 2:2609871/1‑148 (MQ=255) | ACAGAGAAGAAATAGCAGAAACTAAAAACTCTTTTTGTTGATTGAGACACCCGATGCGTAAGCCAAGGTCCAGGTGCAGTGAACACAATGGCTAAATATTGCACCTTTCTTTTCCCCCTCAGTTTTAACCTATTTTTTCTTATGCATTTTCTCAGACAAGAAGTCAGAAGAATGCATCTCTGCTACAGAAAATAGCGATTTCACATAACTACAAGTTATCAATTTCCCCTCCCCTTAAAAAATCTCAATCGTGACAATGCGCACAAATCGCTACCCTGCCAGACAGATTTTTAGG > CP009273/3811930‑3812224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |