| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 344,337 | 0 | A | G | 8.6% | 645.2 / 41.8 | 209 | intergenic (‑183/‑56) | prpR/prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (105/86); new base G (6/12); total (111/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.88e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |