Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,245,537 | G→T | 100% | N286K (AAC→AAA) | plsB ← | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,245,537 | 0 | G | T | 96.0% | 555.9 / 12.3 | 188 | N286K (AAC→AAA) | plsB | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/6); new base T (80/99); total (83/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GGTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAT > CP009273/4245392‑4245680 | ggTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCttt < 1:2091381/148‑1 (MQ=255) gTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTa < 1:3052703/148‑1 (MQ=255) ttGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTAt < 1:616567/148‑1 (MQ=255) ttGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTAt < 1:732898/148‑1 (MQ=255) ttGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTAt < 1:1012010/148‑1 (MQ=255) tGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATg > 2:3007876/1‑148 (MQ=255) tGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATg > 2:1107225/1‑148 (MQ=255) gATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATgg < 2:1213423/148‑1 (MQ=255) cccGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACg > 2:1458253/1‑148 (MQ=255) ccGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGATCGCGCTCAGCTTTATGGACGt < 1:2827332/148‑1 (MQ=255) cggcggCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGtt < 2:1032695/148‑1 (MQ=255) ggcggcGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTg < 1:122095/148‑1 (MQ=255) gcggcgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGa > 2:1507044/1‑148 (MQ=255) cgATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGcc < 1:601759/148‑1 (MQ=255) gATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGccc < 1:1127503/148‑1 (MQ=255) gATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGccc < 1:78402/148‑1 (MQ=255) tGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGt < 2:1827642/148‑1 (MQ=255) tGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGt < 2:168250/148‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt < 1:2121770/148‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt > 1:3156653/1‑148 (MQ=255) ccAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt > 1:2751009/1‑148 (MQ=255) ccAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt > 1:1515125/1‑148 (MQ=255) cAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTc > 1:220370/1‑148 (MQ=255) cAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTc < 1:2972291/148‑1 (MQ=255) cAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTc < 1:2887046/148‑1 (MQ=255) cccTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAgg < 1:2349216/148‑1 (MQ=255) cTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTg > 2:2686187/1‑148 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGa < 2:172998/148‑1 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGa > 1:1763679/1‑148 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGa > 2:762650/1‑148 (MQ=255) ggTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGaa > 2:3193179/1‑148 (MQ=255) aTACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGccc > 2:21364/1‑148 (MQ=255) aCAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAg > 2:503178/1‑148 (MQ=255) cACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATa > 1:1627453/1‑148 (MQ=255) tAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgt > 2:2916803/1‑148 (MQ=255) tAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgt > 2:3159486/1‑148 (MQ=255) aaaGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagt > 2:207941/1‑148 (MQ=255) aaGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtc > 2:2340459/1‑148 (MQ=255) aaGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtc > 2:2340481/1‑148 (MQ=255) agcagcAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:3058221/1‑148 (MQ=255) agcagcAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 1:789554/1‑148 (MQ=255) agcagcAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcagtca > 2:2913488/1‑148 (MQ=255) gcagcaGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGtcagtcag > 1:2596729/1‑148 (MQ=255) gcagcaGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGtcagtcag > 2:2505652/1‑148 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGa > 1:1263180/1‑148 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGa < 1:2922048/148‑1 (MQ=255) gTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatc > 1:1227907/1‑148 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat < 1:528325/148‑1 (MQ=255) aGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat < 1:528339/148‑1 (MQ=255) gTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcatc > 1:792462/1‑148 (MQ=255) tCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTCAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCAtct > 2:2021561/1‑148 (MQ=255) tCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCAtct < 2:1786314/148‑1 (MQ=255) ccATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCAtctc < 2:1809972/148‑1 (MQ=255) ccATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCAtctc < 2:3060045/148‑1 (MQ=255) gtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTaa > 1:3193196/1‑148 (MQ=255) gtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTaa > 1:2883127/1‑148 (MQ=255) gtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTaa > 1:1160704/1‑148 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaa < 2:1075148/148‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaa < 1:1063042/148‑1 (MQ=255) gCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGaaa < 1:1170134/148‑1 (MQ=255) cGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAt < 2:1820660/148‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCTAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATTCGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTct < 2:616335/148‑2 (MQ=255) tGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcg < 2:2278664/148‑1 (MQ=255) ggCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgc > 1:769206/1‑148 (MQ=255) cAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgccg > 1:3150202/1‑148 (MQ=255) gCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAt < 2:881486/148‑1 (MQ=255) cacaTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtc < 1:2913436/148‑1 (MQ=255) cacaTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtc < 1:2913668/148‑1 (MQ=255) acaTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtct < 1:2835512/148‑1 (MQ=255) atatACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATctct > 1:3224062/1‑148 (MQ=255) atatACCAGCTCATGACAGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATctct > 1:1739712/1‑148 (MQ=255) ataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc < 2:353313/148‑1 (MQ=255) aCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCGTCCa < 1:2848794/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCAt > 1:2909504/1‑148 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATc > 2:1457689/1‑148 (MQ=255) aGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCa > 1:891330/1‑148 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGTTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 1:1107225/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 1:8339/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 1:1685549/148‑1 (MQ=255) tGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCaa < 2:3242776/148‑1 (MQ=255) cgtcgtGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATcgc < 2:2564230/148‑1 (MQ=255) tGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTTGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTct > 1:2133542/1‑148 (MQ=255) tGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTTGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTct > 1:2135401/1‑148 (MQ=255) gggCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctg < 2:170322/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctgc < 1:3007876/148‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctgct > 2:1291434/1‑148 (MQ=255) ccAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctgctg < 2:2901815/148‑1 (MQ=255) ccAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTctgctg < 2:3088890/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcg > 2:25976/1‑148 (MQ=255) gCTGGCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTgcgc < 1:902434/148‑1 (MQ=255) ggCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCttt < 2:2766471/148‑1 (MQ=255) gCGAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCtttt < 1:1458253/148‑1 (MQ=255) gAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTc < 1:2653224/148‑1 (MQ=255) gAACGCGCTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTc < 1:2931060/148‑1 (MQ=255) cgcTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATggg < 1:2517975/148‑1 (MQ=255) cgcTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATggg < 1:1473354/148‑1 (MQ=255) cTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgag < 2:1644628/148‑1 (MQ=255) cTCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgag < 2:1417047/148‑1 (MQ=255) tCAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGgaga < 2:1687924/148‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAt < 1:433050/148‑1 (MQ=255) | GGTTGATCCCGGCGGCGATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATGGGAGAT > CP009273/4245392‑4245680 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |