| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 4,354,610 | A→T | 9.2% | W84R (TGG→AGG) | dsbD ← | fused thiol:disulfide interchange protein: activator of DsbC/conserved protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,354,610 | 0 | A | T | 9.2% | 549.6 / 36.1 | 182 | W84R (TGG→AGG) | dsbD | fused thiol:disulfide interchange protein: activator of DsbC/conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (65/100); new base T (11/6); total (76/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.82e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
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aCTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATc > 2:807834/1‑148 (MQ=255) cTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCa < 2:1864213/148‑1 (MQ=255) cTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGACCGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCa < 2:2621923/148‑1 (MQ=255) aTCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCaaaa < 2:1664143/148‑1 (MQ=255) tCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGAGTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCAAAAGCaa > 1:771278/1‑148 (MQ=255) 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cAGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCAAAAGCAAAGGCtt < 2:72911/148‑1 (MQ=255) aGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCAAAAGCAAAGGCTTg > 1:2257906/1‑148 (MQ=255) | TTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCACGTCGGCAATTTTCGCGTGTTCCGGCGTAATGCGGATCTGTTTACGGTAGAGGTAGTAACCGTCTTTGATCTGCCAGGTCAGATTAAGGTCATGTTGGTTTTGCTGAAAATCAAAAGCAAAGGCTTG > CP009273/4354463‑4354757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |