| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,432,031 | G→A | 85.9% | intergenic (‑38/‑168) | msrA ← / → tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,432,031 | 0 | G | A | 85.9% | 579.0 / 80.2 | 213 | intergenic (‑38/‑168) | msrA/tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/23); new base A (71/112); total (78/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CATTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGA > CP009273/4431886‑4432175 | cATTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGAtt > 2:2149781/1‑148 (MQ=255) aTTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTg < 2:860711/148‑1 (MQ=255) aTTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTg > 2:892815/1‑148 (MQ=255) aTTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTg > 1:864193/1‑148 (MQ=255) ttGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGt > 1:1822248/1‑148 (MQ=255) gAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTaa < 1:2554860/148‑1 (MQ=255) gACCGTTGACCGCATGGAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGTCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAag < 1:2549049/148‑1 (MQ=255) gACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAag < 1:102311/148‑1 (MQ=255) aCCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAaga > 1:2526952/1‑148 (MQ=255) aCCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAaga < 1:3137313/148‑1 (MQ=255) ccGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAagag < 1:671061/148‑1 (MQ=255) tGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGt > 2:101971/1‑148 (MQ=255) tGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGt > 2:767930/1‑148 (MQ=255) aCCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTAt > 1:267707/1‑148 (MQ=255) aCCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTAt > 1:267434/1‑148 (MQ=255) tGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGcac > 2:746431/1‑148 (MQ=255) gTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATa < 1:2921790/148‑1 (MQ=255) tGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATaa > 1:977901/1‑148 (MQ=255) gCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAacc < 1:2905092/148‑1 (MQ=255) gCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAacc < 2:231660/148‑1 (MQ=255) cTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAacca < 1:419967/148‑1 (MQ=255) cTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAacca > 2:415858/1‑148 (MQ=255) cATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa < 2:2579594/148‑1 (MQ=255) cATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGaa < 2:2884481/148‑1 (MQ=255) cGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAg > 1:221415/1‑148 (MQ=255) cGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAg < 2:2517274/148‑1 (MQ=255) cGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAg > 1:2082532/1‑148 (MQ=255) ggggTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAgg < 1:1661430/148‑1 (MQ=255) gggTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACGAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGt > 1:1110610/1‑148 (MQ=255) ggTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTc < 2:940174/148‑1 (MQ=255) gtgtTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCt < 2:2611440/148‑1 (MQ=255) gtTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTaa < 1:1973171/148‑1 (MQ=255) ttACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTaaa < 2:1448396/148‑1 (MQ=255) tCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTaaa < 2:125075/148‑1 (MQ=255) ccAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTaaaa > 2:749069/1‑148 (MQ=255) ccAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTaaaa > 2:1427309/1‑148 (MQ=255) ccAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTaaaa < 1:2684195/148‑1 (MQ=255) caggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAAc < 2:2541280/148‑1 (MQ=255) caggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTaaaaa < 2:1802925/148‑2 (MQ=255) ggcaggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACAt < 2:474909/148‑1 (MQ=255) aggGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAg < 2:669024/148‑1 (MQ=255) gCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGaaa < 2:399242/148‑1 (MQ=255) cATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTACAGTAAAACATAAGAAat < 1:1340421/148‑1 (MQ=255) cATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAat < 2:1914972/148‑1 (MQ=255) ggcggGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATAttt < 1:1037860/148‑1 (MQ=255) ggcggGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATAttt < 2:221255/148‑1 (MQ=255) gcggGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTg < 2:313735/148‑1 (MQ=255) gggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGt < 2:282702/148‑1 (MQ=255) gggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGt > 1:1257966/1‑148 (MQ=255) ggAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGtt < 2:2985751/148‑1 (MQ=255) gAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGttt < 1:1427148/148‑1 (MQ=255) gAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGttt < 1:2882930/148‑1 (MQ=255) aaCCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAg > 2:1197635/1‑148 (MQ=255) ccAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTc < 1:1810401/148‑1 (MQ=255) gATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGc > 2:534248/1‑148 (MQ=255) gATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAAGATTTGGGGTTTAGTCTGc > 2:2009194/1‑148 (MQ=255) aTGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCt > 2:1748765/1‑148 (MQ=255) tGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCtt < 2:359028/148‑1 (MQ=255) tGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCtt < 1:2298517/148‑1 (MQ=255) gCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCttt > 1:2396233/1‑148 (MQ=255) cTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCtttt < 1:3074944/148‑1 (MQ=255) cTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCtttt < 1:1708900/148‑1 (MQ=255) tttATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTaa > 1:2155726/1‑148 (MQ=255) ttATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAAt < 1:1884174/148‑1 (MQ=255) tATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATc < 2:113741/148‑1 (MQ=255) cAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCat > 1:2762670/1‑148 (MQ=255) cAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCat < 1:358304/148‑1 (MQ=255) aTAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATAtt < 2:1191647/148‑1 (MQ=255) aTAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATAtt < 2:469769/148‑1 (MQ=255) aTAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATAtt < 2:1191786/148‑1 (MQ=255) tAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTa > 2:2925989/1‑148 (MQ=255) tAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTa > 1:1552800/1‑148 (MQ=255) tCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGa < 1:1076609/148‑1 (MQ=255) tCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGa < 1:892815/148‑1 (MQ=255) cATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTTGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATTACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAt < 1:759873/148‑1 (MQ=255) tGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAttt < 2:1331680/148‑1 (MQ=255) tGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAttt < 1:1580990/148‑1 (MQ=255) tGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGAttt < 1:1014455/148‑1 (MQ=255) gtCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGt < 1:2128457/148‑1 (MQ=255) tCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGtt < 2:1730272/148‑1 (MQ=255) cGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTa > 2:3048776/1‑148 (MQ=255) cGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTa > 1:2025712/1‑148 (MQ=255) tctcCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGc > 1:570250/1‑148 (MQ=255) cccGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGt < 2:597972/148‑1 (MQ=255) aaTCGGTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACg < 1:746431/148‑1 (MQ=255) gTCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGtt > 2:572490/1‑148 (MQ=255) tCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTc < 1:3205986/148‑1 (MQ=255) tCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTc < 1:1185841/148‑1 (MQ=255) tCATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACAAAATAACCACCGTGAATAGGACAAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTAAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGTATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGTCGTTc > 1:3249719/1‑148 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGATTTTAACAAGAGTCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTcc < 1:39614/148‑1 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTcc < 1:3102461/148‑1 (MQ=255) cATTGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACAGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCCTATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTcc < 1:2127191/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGTTAAGATTGTAACAAGATTCGTATTTGCACTCTATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATATGAAATATTTTGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCa < 2:188999/148‑1 (MQ=255) ttGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAg < 2:32349/148‑1 (MQ=255) ttGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAg < 2:3271044/148‑1 (MQ=255) ttGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGACGTTTAACGGCGTTCCAg > 2:2392922/1‑148 (MQ=255) tGGGGTTAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAgg < 1:918708/148‑1 (MQ=255) tAAGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAgg > 2:1218956/1‑148 (MQ=255) aaGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGa > 2:310166/1‑148 (MQ=255) aaGATTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGa > 2:2578601/1‑148 (MQ=255) | CATTGAGTGACCGTTGACCGCATGCAGCGTGGCTACGGGCATCGGGGTGTTACGTCCAGGCAGGGCATCGGCGGGGGAAACCAGATGCTTTTTATCAAATAAACTCATGGTGTCGCTCTCCCGAAAATCGGTCATTGGGGTTAAGGTTGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGA > CP009273/4431886‑4432175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |