Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 4,432,180 | A→T | 19.8% | intergenic (‑187/‑19) | msrA ← / → tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,432,180 | 0 | A | T | 19.8% | 416.1 / 104.6 | 187 | intergenic (‑187/‑19) | msrA/tamA | methionine sulfoxide reductase A/translocation and assembly module for autotransporter export, outer membrane subunit |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGAAAAAAGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACGTTCGTGCGCAGCTT > CP009273/4432033‑4432327 | tAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGAAAAAAgg < 1:546649/148‑1 (MQ=255) aaCAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGAAAAAAGGa < 1:588636/148‑1 (MQ=255) aCAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGAAAAAAGGat > 1:31690/1‑148 (MQ=255) aaGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGAAAAATGGatat < 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aGGGGCAGGAAAAATGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACg > 1:3289231/1‑148 (MQ=255) aGGGGCAGGAAAAATGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACg > 1:190158/1‑148 (MQ=255) ggggCAGGAAAAAAGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACGt < 2:2474350/148‑1 (MQ=255) gggCAGGAAAAAAGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACGtt > 1:143848/1‑148 (MQ=255) ggCAGGAAAAAAGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACGTTc < 1:2371969/148‑1 (MQ=255) 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aaGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACGTTCGTGCGCAGCt < 1:2392922/148‑1 (MQ=255) | TGTAACAAGAGGCGTATTTGCACACAATAACCACCGTGAATAGGTCTAAAGTAAAACATAAGAAATATTTGGGGTTTAGTCTGCTTTTTAATCCATATTACTGGATTTTTGTTAAGCCGTTTAACGGCGTTCCAGGGGCAGGAAAAAAGGATATTCAGGAGAAAATGTGCGCTATATCCGACAGTTATGCTGTGTAAGCTTACTCTGCTTAAGCGGATCTGCCGTCGCCGCGAACGTCCGTCTACAGGTCGAGGGGTTATCGGGACAGCTGGAAAAGAACGTTCGTGCGCAGCTT > CP009273/4432033‑4432327 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |