Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 475,805 | 0 | C | A | 100.0% | 726.0 / NA | 218 | A120A (GCG→GCT) | tomB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (122/96); total (122/96) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
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aatTCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATtc > 1:209094/1‑148 (MQ=255) tCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATtcgtc > 2:2507148/1‑148 (MQ=255) tCTAACAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATtcgtc > 2:2387424/1‑148 (MQ=255) aaCAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTAACAGACTTACGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATAACATAACAAATGAACAAAATAAATTTGTAAAACAGATATTCGTCGAt > 1:2015959/1‑148 (MQ=255) aCAAGATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATc > 2:1763730/1‑148 (MQ=255) gATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCt > 2:872383/1‑148 (MQ=255) gATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCt > 2:1286795/1‑148 (MQ=255) gATAAACTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCCCCATTTCTGAAGATCCTTCATATTAATACCATAACTAATGAACAACATAAATGTGTCAACCAGATATTCGTCGATCTGCt > 1:409055/1‑148 (MQ=255) aaCTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAAt < 1:1588199/148‑1 (MQ=255) aCTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATg > 2:441929/1‑148 (MQ=255) aCTAGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATg < 1:295951/148‑1 (MQ=255) | TAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGG‑TTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAGATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATG > CP009273/475660‑475949 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |