Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 476,404 | G→T | 6.3% | intergenic (‑240/+306) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 476,404 | 0 | G | T | 6.3% | 865.0 / 20.5 | 237 | intergenic (‑240/+306) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (115/107); new base T (5/10); total (120/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
ACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAA > CP009273/476258‑476551 | aCTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGTAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGa > 2:1104206/1‑148 (MQ=255) aCTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGa < 2:900472/148‑1 (MQ=255) tataAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGAtt > 2:1837811/1‑148 (MQ=255) ataAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTa < 1:3262387/148‑1 (MQ=255) taAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGtattat < 1:340279/148‑1 (MQ=255) taAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTAt < 2:628527/148‑1 (MQ=255) aGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCg < 1:2472165/148‑1 (MQ=255) gCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGc > 2:1669347/1‑148 (MQ=255) ccACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGcc < 2:2048111/148‑1 (MQ=255) ctctTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGa < 1:818243/148‑1 (MQ=255) ctctTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGa > 1:1260755/1‑148 (MQ=255) ctctTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGa < 1:2787187/148‑1 (MQ=255) tctTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGAt > 1:2949122/1‑148 (MQ=255) ttGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGaa > 2:23992/1‑148 (MQ=255) aGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTg < 1:590048/148‑1 (MQ=255) cATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGacac > 2:1902674/1‑148 (MQ=255) cATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGacac < 1:1133623/148‑1 (MQ=255) tCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTa < 1:1100292/148‑1 (MQ=255) cGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTaa > 2:2911899/1‑148 (MQ=255) cGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTaa > 2:3025973/1‑148 (MQ=255) cATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATa > 2:102639/1‑148 (MQ=255) attattACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATAc > 1:1623983/1‑148 (MQ=255) tattaCGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAACTTGGTGACACTAATACCa > 2:2224411/1‑148 (MQ=255) tattaCGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCa < 1:2326607/148‑1 (MQ=255) attaCGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAg > 1:1765357/1‑148 (MQ=255) taCGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGa > 2:325740/1‑148 (MQ=255) aCGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGAt > 1:489751/1‑148 (MQ=255) gAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTg < 2:1486678/148‑1 (MQ=255) aaaaaTTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGc > 1:1063291/1‑148 (MQ=255) aaaaaTTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGc > 2:2972816/1‑148 (MQ=255) aaaaTTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGct < 1:2630169/148‑1 (MQ=255) aTTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTg > 2:2414497/1‑148 (MQ=255) tACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGaa < 1:2149953/148‑1 (MQ=255) cAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAata > 2:46174/1‑148 (MQ=255) aTTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATg < 2:2166081/148‑1 (MQ=255) aTTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATg < 1:1481092/148‑1 (MQ=255) aTTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATg < 1:1539657/148‑1 (MQ=255) tAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGAc > 2:1357614/1‑148 (MQ=255) tAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGAc > 1:2350049/1‑148 (MQ=255) aggaaggaAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACg < 2:1955798/148‑1 (MQ=255) ggaaggaaGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACga > 1:2533536/1‑147 (MQ=255) ggaaggaaGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGt > 2:1390103/1‑148 (MQ=255) gaaggaagCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGta > 2:2199744/1‑148 (MQ=255) aggaagCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGACTATGACGtaat > 1:2880638/1‑148 (MQ=255) ggaagCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGtaata > 1:1954563/1‑148 (MQ=255) gaagCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGtaataa < 1:2500500/148‑1 (MQ=255) gCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCg > 1:1848167/1‑148 (MQ=255) cGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGa > 1:268265/1‑148 (MQ=255) gggACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAg < 2:1296702/148‑1 (MQ=255) aCAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaa > 1:2938964/1‑148 (MQ=255) aCAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaa < 2:1568280/148‑1 (MQ=255) ggACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGTATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatga < 2:3212067/148‑1 (MQ=255) ggACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatga < 2:1900581/148‑1 (MQ=255) ggACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatga < 2:937103/148‑1 (MQ=255) gACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCGGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatgaa > 1:1170270/1‑148 (MQ=255) aCTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGgaatgaat > 2:424189/1‑148 (MQ=255) cACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATaaa > 2:3105636/1‑148 (MQ=255) cACTTTGTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATaaa < 2:2857506/148‑1 (MQ=255) tttttCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGaa < 2:265787/148‑1 (MQ=255) ttttCATACTAGCACGAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAAt < 2:1743514/148‑1 (MQ=255) ttCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGAGTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTa < 1:733810/148‑1 (MQ=255) aGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAaat < 2:2079470/148‑1 (MQ=255) tAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTa > 2:825790/1‑148 (MQ=255) tAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTa < 2:1267417/148‑1 (MQ=255) aaCCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTaa < 2:2334616/148‑1 (MQ=255) aCCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAg > 2:2175521/1‑148 (MQ=255) cccGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGa > 2:2265189/1‑148 (MQ=255) cGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAAt < 1:3025973/148‑1 (MQ=255) gcagGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGTATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGcc > 1:1730752/1‑148 (MQ=255) gcagGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGcc < 2:837347/148‑1 (MQ=255) cagGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCct > 1:2297293/1‑148 (MQ=255) tAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGTATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTaa < 2:561880/148‑1 (MQ=255) tAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGTATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTaa < 2:1457203/148‑1 (MQ=255) tAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTaa < 1:1639954/148‑1 (MQ=255) tAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTaa < 2:1170226/148‑1 (MQ=255) tAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTaa < 1:3211093/148‑1 (MQ=255) aaaGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGGATAGCCTCTAAAt > 2:2559513/1‑148 (MQ=255) aaGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATg > 2:2516994/1‑148 (MQ=255) gCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGAt > 1:2578233/1‑148 (MQ=255) ttGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGGTTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATgg < 2:2938964/148‑1 (MQ=255) tGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGa < 1:1902674/148‑1 (MQ=255) gAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGattatt > 2:3077581/1‑148 (MQ=255) aaCTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGAttatta > 2:1441584/1‑148 (MQ=255) aCTATTCATAACATTTCAGTATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTaa < 2:655053/148‑1 (MQ=255) cTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTaaa > 1:201566/1‑148 (MQ=255) cTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTaaa < 2:1218923/148‑1 (MQ=255) tATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAAt < 1:896937/148‑1 (MQ=255) tATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCATCTAAATGATTATGGATTATTAAAt < 2:1954563/148‑1 (MQ=255) aTTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATc < 1:1885492/148‑1 (MQ=255) ttCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCt < 2:2587780/148‑1 (MQ=255) ttCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCt > 1:1339824/1‑148 (MQ=255) tCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTa > 2:3050874/1‑148 (MQ=255) aTAACATTTCAGTATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTAtt > 1:3044322/1‑148 (MQ=255) tAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTa > 2:1073398/1‑148 (MQ=255) ttCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTa < 1:863429/148‑1 (MQ=255) tCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTAc < 1:2829287/148‑1 (MQ=255) cAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACt < 2:350855/148‑1 (MQ=255) ggATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTa < 1:46174/148‑1 (MQ=255) ggATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTa < 2:1633818/148‑1 (MQ=255) gATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTaa > 1:29797/1‑148 (MQ=255) | ACTATAAGCCACTCTTTGCAGGTTTTCATCGCATTATTACGAAAAATTACAATTAGGAAGGAAGCGGGACAGGACTCACTTTTTCATACTAGCACTAACCCGCAGCAGGTAAAAGCAGTTTGCTCGAACTATTCATAACATTTCAGGATTATCGCCAGATGAAATTGGTGACACTAATACCAGGATTGCTCTGAATATGACGTAATAACCGAGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAA > CP009273/476258‑476551 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |