Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 518,820 | C→A | 90.1% | A35E (GCG→GAG) | rhsD → | Rhs family putative polymorphic toxin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 518,820 | 0 | C | A | 90.1% | 389.7 / 39.4 | 151 | A35E (GCG→GAG) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin |
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Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
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ggCGCGCCCACCGGCGTGGAGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCt < 2:3089466/148‑1 (MQ=255) gcgcgcCCACCGGCGTGGAGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTGTCTCCCGCAccaa > 1:862540/1‑146 (MQ=255) ccACCGGCGTGGAGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTAcagcag < 1:468296/148‑1 (MQ=255) ccACCGGCGTGGAGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTAcagcag < 1:468206/148‑1 (MQ=255) cACCGGCGTGGAGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACagcagc > 1:202799/1‑148 (MQ=255) 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tggagtgCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACagcagc > 2:1686064/1‑140 (MQ=255) | TAACACAGGGATATGAACAATAACTAAAAGGGCACTTTATATGAGCGGAAAACCAGCGGCGCGTCAGGGAGATATGACTCAGTATGGCGGTCCCATTGTCCAGGGTTCGGCAGGTGTAAGAATTGGCGCGCCCACCGGCGTGGCGTGCTCGGTGTGTCCGGGCGGGATGACTTCGGGCAACCCGGTAAATCCGCTGCTGGGGGCGAAGGTGCTGCCCGGCGAGACGGACCTTGCGCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGCTACCGGA > CP009273/518677‑518963 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |