| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 766,540 | A→C | 15.6% | intergenic (+473/‑374) | mngB → / → cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 766,540 | 0 | A | C | 15.6% | 534.9 / 109.0 | 246 | intergenic (+473/‑374) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (120/87); new base C (20/19); total (140/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
GTATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAAT > CP009273/766393‑766687 | gtATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGaa < 1:98275/148‑1 (MQ=255)gtATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGaa < 2:2570806/148‑1 (MQ=255) tATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGaaa > 1:1344058/1‑148 (MQ=255) tATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGaaa < 2:3005002/148‑1 (MQ=255) ttAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAcaca < 2:1220133/148‑1 (MQ=255) ttAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGATTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACa > 1:539009/1‑148 (MQ=255) tAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACAt < 2:1624310/148‑1 (MQ=255) aGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTa < 2:224503/148‑1 (MQ=255) aGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTa < 2:2669062/148‑1 (MQ=255) ccAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATa < 2:3159623/148‑1 (MQ=255) acAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATa < 2:1982152/147‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTANTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATaa > 1:1680615/1‑148 (MQ=255) aaaaaaaGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAAt < 2:2488356/148‑1 (MQ=255) aaaaaaGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAAtt < 1:2430395/148‑1 (MQ=255) aaGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTa < 2:1499697/148‑1 (MQ=255) aaTTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGa > 2:836498/1‑148 (MQ=255) aaTTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAAGTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGa < 1:1993974/148‑1 (MQ=255) ttAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAAt > 2:2608195/1‑148 (MQ=255) ggTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGat < 1:203225/148‑1 (MQ=255) gTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGata < 1:344428/148‑1 (MQ=255) cAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATAtt < 2:735498/148‑1 (MQ=255) aCCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTa < 1:2696433/148‑1 (MQ=255) aCCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAAGTGCCAACCGAAAATAATTTCAGCCTTAGAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGTTATTTa < 1:1043369/148‑1 (MQ=255) gTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCa > 1:1195267/1‑148 (MQ=255) tGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCaa < 1:730762/148‑1 (MQ=255) gCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAAt > 1:1539777/1‑148 (MQ=255) tGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGTAATTGATATTTATCAATGt > 1:1244578/1‑148 (MQ=255) ttttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGtata < 1:1174148/148‑1 (MQ=255) tttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATaa < 1:1004247/148‑1 (MQ=255) ttCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCtt > 2:2883558/1‑148 (MQ=255) tctcTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGaa < 1:2385322/148‑1 (MQ=255) ctctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGTAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGaaa < 1:683992/148‑1 (MQ=255) tctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAAt < 2:3147135/148‑1 (MQ=255) tttATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGc < 2:40104/148‑1 (MQ=255) tATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCAt < 1:1407952/148‑1 (MQ=255) cTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaa > 1:975060/1‑148 (MQ=255) ttAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaaaa < 1:2830873/148‑1 (MQ=255) ttAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaaaa > 2:936478/1‑148 (MQ=255) ttGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAagag < 2:2866093/148‑1 (MQ=255) gCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGAt < 1:361693/148‑1 (MQ=255) aCCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAt > 1:1370668/1‑148 (MQ=255) aCCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAt < 1:860995/148‑1 (MQ=255) aCCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGCCCCCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAt < 2:276768/148‑1 (MQ=255) ccGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt > 1:3142709/1‑148 (MQ=255) ccGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt < 2:2006156/148‑1 (MQ=255) ccGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt > 1:2286272/1‑148 (MQ=255) ccGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt > 2:1726519/1‑148 (MQ=255) cGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTg < 2:3170164/148‑1 (MQ=255) aaaCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGtt > 1:141272/1‑148 (MQ=255) aaaCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGtt > 1:505644/1‑148 (MQ=255) aaCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtc > 2:558129/1‑148 (MQ=255) aCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtct < 2:225629/148‑1 (MQ=255) aCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtct > 1:2099842/1‑148 (MQ=255) cTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtctc > 2:2637035/1‑148 (MQ=255) tAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCg > 1:2608169/1‑148 (MQ=255) aaTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGa < 2:1353203/148‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGAt > 1:39970/1‑148 (MQ=255) aTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGAt < 2:1751102/148‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGAt > 1:155461/1‑148 (MQ=255) cAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCaaa < 1:3012536/148‑1 (MQ=255) ccTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTg > 1:2952507/1‑148 (MQ=255) ttATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGc < 1:2570041/148‑1 (MQ=255) ataACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTg > 1:1796904/1‑148 (MQ=255) taACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGa < 2:2848116/148‑1 (MQ=255) aCTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGaaa < 2:1145362/148‑1 (MQ=255) aCTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGaaa < 2:2876977/148‑1 (MQ=255) cTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAg > 2:685375/1‑148 (MQ=255) cacaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCgg > 1:2859536/1‑148 (MQ=255) tttAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAAtt < 1:1273628/148‑1 (MQ=255) tttAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAAtt > 1:2782460/1‑148 (MQ=255) ttAAACATACATGTCACTAAAGTTACCTTATTGACACCTGATTAACATAATTTGTAGGAATTTATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAAttt < 1:1749132/148‑1 (MQ=255) tAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTa > 2:1374679/1‑148 (MQ=255) aaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGc > 2:3128002/1‑148 (MQ=255) aaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGc > 2:1486782/1‑148 (MQ=255) aCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTCATTTAGCt > 2:2054326/1‑148 (MQ=255) tGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAAtt < 2:1247624/148‑1 (MQ=255) tGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGAATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAAtt > 2:129047/1‑148 (MQ=255) tCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGa < 1:2608231/148‑1 (MQ=255) cACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGAt > 2:598268/1‑148 (MQ=255) cACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGAt > 2:2402550/1‑148 (MQ=255) aCTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATc > 1:473925/1‑148 (MQ=255) aCTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATc > 2:1779830/1‑148 (MQ=255) cTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCa < 1:797097/148‑1 (MQ=255) cTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCa < 1:1779830/148‑1 (MQ=255) tAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCAc > 2:1003072/1‑148 (MQ=255) aaaGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCAcc > 1:803727/1‑148 (MQ=255) aGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGt > 2:3131104/1‑148 (MQ=255) ttACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCg > 1:2333330/1‑148 (MQ=255) ccTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaa > 1:1697509/1‑148 (MQ=255) ccTTATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaa > 1:22061/1‑148 (MQ=255) ccTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaa > 2:3289408/1‑148 (MQ=255) ttATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaaaa < 1:1512928/148‑1 (MQ=255) ttATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaaaa > 2:2313951/1‑148 (MQ=255) ttATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATAACCGTCGaacat > 2:2314658/1‑145 (MQ=255) tATTGACACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAAt > 2:1704121/1‑148 (MQ=255) aTTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATg > 1:3166785/1‑148 (MQ=255) ttGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTATAGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGTCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGACGAAAAATGc > 1:2548536/1‑148 (MQ=255) ttGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTCATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGc > 1:2201536/1‑148 (MQ=255) tGAAACATGATTAACATAATTTGTAGTAATTGATATTAATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCa > 2:637746/1‑148 (MQ=255) aaaCATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCaaa > 1:497307/1‑148 (MQ=255) | GTATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAAT > CP009273/766393‑766687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |