| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 816,152 | C→A | 10.3% | intergenic (+108/‑97) | ybhL → / → ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 816,152 | 0 | C | A | 10.3% | 748.4 / 41.1 | 223 | intergenic (+108/‑97) | ybhL/ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (92/108); new base A (10/13); total (102/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCC > CP009273/816007‑816299 | ccTGTTGTTGTTGCGGATCTGCGCCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCACCACTATCCCGGCCATGTGGCGGTATTTTTTTCTTACTAAACACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtt < 1:1759869/148‑1 (MQ=255) ccTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtt < 2:2688766/148‑1 (MQ=255) tGATGTTGTTGCGGATCTACGGCACCCGCCGTTAATTCATTTTCACCATCACTAACCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtttt < 2:1186067/148‑1 (MQ=255) tGATGTTGGTGCGGATCTTCGGAAACCGCCTTTAATTCTTTTACACCACCACTACCCCGGCCATGTGTCGGTATTTTTTTCTTAAAAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtttt < 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aGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAgg < 1:2445085/148‑1 (MQ=255) | TCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCC > CP009273/816007‑816299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |