Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,010,999 | 0 | C | A | 16.5% | 538.1 / 64.9 | 192 | intergenic (+84/‑172) | pqiC/rmf | DUF330 family putative lipoprotein/ribosome modulation factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (86/74); new base A (15/17); total (101/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
GCTGGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGG‑TTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTCACATTTTTTGTACAACCGACATGCCCGTGTAGCTCACAAATATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGACGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCACATTTAGTAATCACTGTTTTCTTTTCCACC > CP009273/1010852‑1011144 | cTGGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGG‑TTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCct < 1:2275152/148‑1 (MQ=255) tGGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGG‑TTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCctc < 2:3090419/148‑1 (MQ=255) ggCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGG‑TTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCctct > 2:3227284/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |