Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,034,769 | A→G | 5.8% | T6T (ACA→ACG) | cbdB → | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,034,769 | 0 | A | G | 5.8% | 543.8 / 19.7 | 171 | T6T (ACA→ACG) | cbdB | cytochrome bd‑II oxidase, subunit II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/94); new base G (7/3); total (74/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TCATGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGC > CP009273/1034622‑1034915 | tCATGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACa > 2:1409623/1‑148 (MQ=255) cATGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACAt < 1:1026435/148‑1 (MQ=255) cATGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACAt < 1:943403/148‑1 (MQ=255) aTGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAGCAtt < 1:2651074/148‑1 (MQ=255) tGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTg < 1:324045/148‑1 (MQ=255) tGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTg < 1:2254971/148‑1 (MQ=255) gATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTgc > 2:272323/1‑148 (MQ=255) gATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTgc > 2:272318/1‑148 (MQ=255) aTCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTgcg > 2:65938/1‑148 (MQ=255) aTCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTgcg < 2:390766/148‑1 (MQ=255) gggCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCAt < 2:2498495/148‑1 (MQ=255) ggCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATc > 1:1866077/1‑148 (MQ=255) ggCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATc > 2:14337/1‑148 (MQ=255) tttACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCtgg < 2:2986676/148‑1 (MQ=255) ttACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACGTTGCGCTTCATCtggt > 1:2115845/1‑148 (MQ=255) acacCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCtggtgg < 2:1893174/148‑1 (MQ=255) cacCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGgc < 2:2066112/148‑1 (MQ=255) cacCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGgc > 1:2769902/1‑148 (MQ=255) cccTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGgctg < 1:674559/148‑1 (MQ=255) cccTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGgctg > 1:62979/1‑148 (MQ=255) cccTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGgctg > 1:2985609/1‑148 (MQ=255) gTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGa < 1:89162/148‑1 (MQ=255) cTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTg < 1:1153832/148‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGt > 1:1557311/1‑148 (MQ=255) cGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGa > 1:2207926/1‑148 (MQ=255) ccGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACGTTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATc < 2:2187962/148‑1 (MQ=255) ccGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATc < 1:1895257/148‑1 (MQ=255) ccGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATc < 2:327819/148‑1 (MQ=255) ccGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATc < 2:327806/148‑1 (MQ=255) gAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCt > 2:2223007/1‑148 (MQ=255) gAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCt < 1:1847403/148‑1 (MQ=255) tCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACGTTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCtggtg < 1:963137/148‑1 (MQ=255) tCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCtggtg < 2:540502/148‑1 (MQ=255) tCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCtggtg < 2:539035/148‑1 (MQ=255) cTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACGTTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCtggtgg > 1:1267467/1‑148 (MQ=255) cTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCtggtgg > 1:220341/1‑148 (MQ=255) tACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTggtggt < 1:393287/148‑1 (MQ=255) aCCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTc < 2:1987618/148‑1 (MQ=255) aCCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTc < 2:3048113/148‑1 (MQ=255) aCCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTc < 2:635608/148‑1 (MQ=255) ccTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCt > 1:1391296/1‑148 (MQ=255) ccTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCt > 1:1004145/1‑148 (MQ=255) tGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATg < 2:318968/148‑1 (MQ=255) tGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACAGTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATg < 2:1700850/148‑1 (MQ=255) aaaTATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGAtctc < 2:2523106/148‑1 (MQ=255) atatGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCg < 2:3080940/148‑1 (MQ=255) atatGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCg < 2:3082167/148‑1 (MQ=255) tatGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGa > 1:2057542/1‑148 (MQ=255) ccGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGAt > 2:871273/1‑148 (MQ=255) tGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGAc < 1:1206543/148‑1 (MQ=255) gggCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACAt > 2:1384853/1‑148 (MQ=255) ggCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATg < 2:737698/148‑1 (MQ=255) ccGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATggg < 2:2487676/148‑1 (MQ=255) aGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGAt < 1:2672720/148‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCtt > 2:2355012/1‑116 (MQ=255) cgcgATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCtt < 1:2355012/116‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCg > 1:965237/1‑148 (MQ=255) cgcgATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCg > 1:352091/1‑148 (MQ=255) aacaacCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCg < 1:956139/148‑1 (MQ=255) caacCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCt > 2:1900516/1‑148 (MQ=255) aacCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACGTTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCtg > 2:653052/1‑148 (MQ=255) aacCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACGTTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCtg > 2:545463/1‑148 (MQ=255) aacCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCtg < 1:2189312/148‑1 (MQ=255) cGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCtggtg > 1:2853991/1‑148 (MQ=255) aCGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTCGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGgc < 2:1633854/148‑1 (MQ=255) aCAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatg < 1:1262847/148‑1 (MQ=255) cAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatga > 2:2239293/1‑148 (MQ=255) aGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatgat > 2:2099740/1‑148 (MQ=255) ggggTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatgatg < 2:1351526/148‑1 (MQ=255) ggggTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatgatg < 1:2321071/148‑1 (MQ=255) ggggTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatgatg < 1:3129144/148‑1 (MQ=255) ggggTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatgatg < 1:3128449/148‑1 (MQ=255) ggggTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCGTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAatgatg < 1:44995/148‑1 (MQ=255) gggTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAaggatga > 2:2978974/1‑148 (MQ=255) tAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAAtgatgatga < 2:824501/148‑1 (MQ=255) tAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAAtgatgatga < 2:826613/148‑1 (MQ=255) aaaGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGaa < 2:1329499/148‑1 (MQ=255) aGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACg < 2:1862936/148‑1 (MQ=255) ggAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGc < 2:2546409/148‑1 (MQ=255) agaAAATCATTATTGATTAAGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCg > 2:3069437/1‑148 (MQ=255) gaAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCgg > 1:2464478/1‑148 (MQ=255) aaaaTCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGa < 1:2893859/148‑1 (MQ=255) aaaaTCATGTGTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGa > 2:2030358/1‑148 (MQ=255) aaTCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATa > 1:2596718/1‑148 (MQ=255) aTCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAg > 1:2071012/1‑148 (MQ=255) cATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTg > 2:917236/1‑148 (MQ=255) cATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTg > 2:1322485/1‑148 (MQ=255) aTGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGa < 2:1424308/148‑1 (MQ=255) aTGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGa < 2:198480/148‑1 (MQ=255) tttGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATaa < 2:2458226/148‑1 (MQ=255) ttGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATaaa < 1:2863036/148‑1 (MQ=255) gATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGTTAAACa < 2:1086181/148‑1 (MQ=255) gATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACa > 1:1686832/1‑148 (MQ=255) gATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACa < 2:1670212/148‑1 (MQ=255) aTTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAg < 1:272318/148‑1 (MQ=255) tATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCg > 2:3305243/1‑148 (MQ=255) tATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCg < 2:2823932/148‑1 (MQ=255) aaCATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGt < 1:65935/148‑1 (MQ=255) aaCATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGt < 1:65938/148‑1 (MQ=255) aCATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTg > 1:156635/1‑148 (MQ=255) | TCATGATCGTAGGGCTTTACACCCTGTTCTTAATCGCCGAAGTCTACCTGATGCAGAAATATGCCCGTCTGGGGCCGAGCGCGATGCAGAGTGAACAACCGACGCAGCAACAGGGGTAAAGGAGAAAATCATGTTTGATTATGAAACATTGCGCTTCATCTGGTGGCTGCTGATTGGCGTGATCCTGGTGGTCTTTATGATCTCCGACGGATTTGACATGGGGATCGGCTGTCTGCTGCCGCTGGTGGCGCGTAATGATGATGAACGCCGGATAGTGATAAACAGCGTTGGTGC > CP009273/1034622‑1034915 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |