Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 1,108,291 | G→T | 10.1% | R658L (CGC→CTC) | opgH → | membrane glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,108,291 | 0 | G | T | 10.1% | 617.3 / 30.8 | 178 | R658L (CGC→CTC) | opgH | membrane glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (84/76); new base T (7/11); total (91/87) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GGAAGTGCTTTTTTCCGTGCTGCTGGCTCCGGTACGCATGCTGTTCCATACGGTCTTCGTTGTCAGCGCGTTCCTTGGCTGGGAAGTGGTGTGGAATTCACCGCAGCGTGATGATGACTCCACTTCCTGGGGTGAAGCGTTCAAACGCCACGGCTCACAGCTGCTGTTAGGGTTAGTGTGGGCTGTTGGGATGGCGTGGCTGGATCTGCGTTTCCTGTTCTGGCTGGCACCGATTGTCTTCTCGTTGATCCTGTCACCGTTTGTTTCGGTGATTTCCAGCCGTGCCACCGTTGG > CP009273/1108145‑1108438 | aaGTGCTTTTTTCCGTGCTGCTGGCTCCGGTACGCATGCTGTTCCATACGGTCTTCGTTGTCAGCGCGTTCCTTGGCTGGGAAGTGGTGTGGAATTCACCGCAGCGTGATGATGACTCCACTTCCTGGGGTGAAGCGTTCAAACGCCa > 1:240084/1‑148 (MQ=255) aaGTGCTTTTTTCCGTGCTGCTGGCTCCGGTACGCATGCTGTTCCATACGGTCTTCGTTGTCAGCGCGTTCCTTGGCTGGGAAGTGGTGTGGAATTCACCGCAGCGTGATGATGACTCCACTTCCTGGGGTGAAGCGTTCAAACGCCa > 1:240062/1‑148 (MQ=255) aaGTGCTTTTTTCCGTGCTGCTGGCTCCGGTACGCATGCTGTTCCATACGGTCTTCGTTGTCAGCGCGTTCCTTGGCTGGGAAGTGGTGTGGAATTCACCGCAGCGTGATGATGACTCCACTTCCTGGGGTGAAGCGTTCAAACGCCa > 2:1991836/1‑148 (MQ=255) gCTTTTTTCCGTGCTGCTGGCTCCGGTACGCATGCTGTTCCATACGGTCTTCGTTGTCAGCGCGTTCCTTGGCTGGGAAGTGGTGTGGAATTCACCGCAGCGTGATGATGACTCCACTTCCTGGGGTGAAGCGTTCAAACTCCACGGc > 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |