| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,116,964 | A→G | 100% | intergenic (‑21/+53) | dinI ← / ← pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydro‑orotase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,116,964 | 0 | A | G | 99.5% | 735.4 / ‑4.8 | 188 | intergenic (‑21/+53) | dinI/pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydro‑orotase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (83/103); total (85/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTG > CP009273/1116819‑1117106 | aCCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCt < 1:2340455/148‑1 (MQ=255)aCCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCt < 2:302616/148‑1 (MQ=255)aCCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCt < 2:302698/148‑1 (MQ=255) cGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTgg > 1:1285086/1‑148 (MQ=255) gATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGt < 2:1899769/148‑1 (MQ=255) tACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGtta < 2:2559279/148‑1 (MQ=255) tACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGtta < 1:2730630/148‑1 (MQ=255) aCGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttat < 2:874288/148‑1 (MQ=255) cGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttatt < 2:2105370/148‑1 (MQ=255) ggCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttatttat < 2:723691/148‑1 (MQ=255) ccTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATAc < 1:236066/148‑1 (MQ=255) ccTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGCGAAAGTTCGCCAGCCAGGGAGTCAAAACCCCCAGCTGGCAAAGGAGAAGTTTACGGGATGGTGACATCAATTAGAATAATACACCCCACTTGAAAATTGTGGTTTATtataa > 1:1203736/1‑147 (MQ=255) cTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACa < 2:443540/148‑1 (MQ=255) cTTCATAATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAAATCGCATAATAGCCACCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACa > 2:1390231/1‑148 (MQ=255) cATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGGTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGt < 2:1546555/148‑1 (MQ=255) ttATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaa > 2:3082535/1‑148 (MQ=255) tATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaaa < 1:3119299/148‑1 (MQ=255) tATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaaa < 1:1020562/148‑1 (MQ=255) tATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATAAAGGTaaa > 2:3156907/1‑148 (MQ=255) aTCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaaaa < 1:1000170/148‑1 (MQ=255) cAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATa > 1:225051/1‑148 (MQ=255) ggAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAg > 2:657633/1‑138 (MQ=255) cGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt < 1:463382/148‑1 (MQ=255) cATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGa < 1:1114517/148‑1 (MQ=255) aTACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTGTTCGCGATGGTGTCTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGTATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 1:1441859/1‑148 (MQ=255) tACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGaca > 1:750095/1‑148 (MQ=255) aTACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGa > 1:2031903/1‑148 (MQ=255) aTACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGa < 1:2595314/148‑1 (MQ=255) tACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAACATAACCTAATGACAACAGGaa > 2:2777425/1‑148 (MQ=255) aCGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCTGGGCGTCAATAGCACCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAg < 2:1203736/148‑1 (MQ=255) cggcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACACCAGGAAGc < 2:692289/148‑1 (MQ=255) cggcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGc < 2:692165/148‑1 (MQ=255) cggcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGc < 2:1020022/148‑1 (MQ=255) gcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTa < 1:1870694/148‑1 (MQ=255) aaaGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAtt < 1:1664536/148‑1 (MQ=255) aaaGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAtt < 1:1908924/148‑1 (MQ=255) aaGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttt < 1:2275618/148‑1 (MQ=255) aGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAtttt < 1:2449957/148‑1 (MQ=255) gTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttttt < 2:523034/148‑1 (MQ=255) gTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttttt < 2:1473028/148‑1 (MQ=255) gTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttttt < 2:523642/148‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTAt < 1:1955128/148‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGACGCTACGATTTTTATTg < 1:2332707/148‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTg < 1:672418/148‑1 (MQ=255) ccagccagGGCGTCAATAGCCCCATCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTTTGGTGTCTTCTATTCTCATAATAGCCCCCTGTTGAATTTGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGt < 1:1167988/148‑1 (MQ=255) agccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt < 1:1274095/148‑1 (MQ=255) gccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTa < 1:1787404/148‑1 (MQ=255) gccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTa < 1:641313/148‑1 (MQ=255) ccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTaa < 1:1576148/148‑1 (MQ=255) ggCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATTGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATAAGCTGGTTATTTATAAAGGTAAAATAACCTAATGACAAAAGGAAGCTACGAATTTTAATGTTTAACGGa > 2:2595890/1‑148 (MQ=255) ggCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCAAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGa > 1:2181972/1‑148 (MQ=255) tAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTa < 2:962530/148‑1 (MQ=255) gCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTAcc > 2:1575035/1‑148 (MQ=255) ccccAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCg > 1:2414086/1‑148 (MQ=255) cccAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGt < 2:320569/148‑1 (MQ=255) cAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAAAGGACCAGCGTACCGttt > 1:2658327/1‑148 (MQ=255) cAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATAAAGGTAAAATAACCAAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGttt > 1:2658177/1‑148 (MQ=255) gCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTcc < 1:384527/148‑1 (MQ=255) aaTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCg < 2:453111/148‑1 (MQ=255) aaTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCg < 2:1508752/148‑1 (MQ=255) aTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATATCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGa > 2:1133652/1‑148 (MQ=255) tGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAg > 1:536539/1‑148 (MQ=255) ggAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAgg > 2:1274823/1‑148 (MQ=255) gagaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGa < 2:2911568/148‑1 (MQ=255) gagaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGa < 1:2480625/148‑1 (MQ=255) gTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGc > 1:3292109/1‑148 (MQ=255) tttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCAc > 1:245771/1‑148 (MQ=255) tttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCAc > 1:375934/1‑148 (MQ=255) ttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGACTGGCAcc > 2:2265797/1‑148 (MQ=255) ttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCAcc < 1:1141327/148‑1 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgt < 2:1230561/148‑1 (MQ=255) tGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt < 2:1128587/148‑1 (MQ=255) tGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt < 1:796655/148‑1 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACTATTTTTATTGTTTAACGGACCAGAGTACAGTTTCACCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtc > 1:156253/1‑148 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtc > 1:70063/1‑148 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtc > 1:70069/1‑148 (MQ=255) tGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat > 2:776491/1‑148 (MQ=255) tGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat < 1:1415208/148‑1 (MQ=255) tGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat < 1:2935336/148‑1 (MQ=255) aCTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcatca < 2:23295/148‑1 (MQ=255) cTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcag > 2:3209997/1‑148 (MQ=255) ttCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagt > 2:2677243/1‑148 (MQ=255) cAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtca > 2:2420554/1‑148 (MQ=255) cAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtca > 2:2420438/1‑148 (MQ=255) cAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtca > 2:1656248/1‑148 (MQ=255) aTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATcagtcagt > 2:2242287/1‑148 (MQ=255) tCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGc > 1:418891/1‑148 (MQ=255) gCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGa < 1:1530858/148‑1 (MQ=255) cATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGAt < 1:3060358/148‑1 (MQ=255) ataataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATg < 1:2560509/148‑1 (MQ=255) aataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCt < 1:1820029/148‑1 (MQ=255) ataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCtt > 1:951169/1‑148 (MQ=255) ataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCtt > 1:1575749/1‑148 (MQ=255) taGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCttt > 1:706345/1‑148 (MQ=255) cccccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAg < 2:2567173/148‑1 (MQ=255) cccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCa > 2:2181810/1‑148 (MQ=255) ccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCaa < 1:472348/148‑1 (MQ=255) gTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCt > 1:700826/1‑148 (MQ=255) gTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCt > 1:59887/1‑148 (MQ=255) aaTATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTACAGCAACCTGTTg < 1:360258/148‑1 (MQ=255) | ACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTG > CP009273/1116819‑1117106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |