| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,485,034 | 0 | C | A | 9.5% | 788.9 / 37.0 | 228 | intergenic (‑64/‑125) | gapC/cybB | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment)/cytochrome b561 |
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Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTT > CP009273/1484889‑1485181 | cTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCgg > 2:1409253/1‑148 (MQ=255) aTGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGa > 2:211355/1‑148 (MQ=255) aTGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGa < 2:1590716/148‑1 (MQ=255) aTGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGa < 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aaaaTTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAg < 2:2056532/148‑1 (MQ=255) ttGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAgg < 1:1332248/148‑1 (MQ=255) ttGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAgg < 2:3200655/148‑1 (MQ=255) ttGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAgg > 1:685536/1‑148 (MQ=255) tGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGa < 2:2278200/148‑1 (MQ=255) 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CTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTT > CP009273/1484889‑1485181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |