Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,557,309 | C→A | 19.8% | D9Y (GAT→TAT) | ddpX ← | D‑ala‑D‑ala dipeptidase, Zn‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,557,309 | 0 | C | A | 19.8% | 732.7 / 116.9 | 267 | D9Y (GAT→TAT) | ddpX | D‑ala‑D‑ala dipeptidase, Zn‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (110/104); new base A (28/25); total (138/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
GGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTG > CP009273/1557162‑1557456 | gggCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATc > 2:2865307/1‑148 (MQ=255) tGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAg > 1:1895921/1‑148 (MQ=255) tGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAg > 2:2470972/1‑148 (MQ=255) aTACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCgg > 2:385218/1‑148 (MQ=255) aTACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCgg > 1:2311131/1‑148 (MQ=255) tttCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTa < 2:3236678/148‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATc < 2:1824043/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGAc < 2:1365806/148‑1 (MQ=255) gcgcGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACAt > 2:2692007/1‑148 (MQ=255) gcgGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATaa < 1:1694863/148‑1 (MQ=255) gcgGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATaa < 1:1683980/148‑1 (MQ=255) ggTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAAc < 1:2290391/148‑1 (MQ=255) gTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACg > 1:707419/1‑148 (MQ=255) tAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACgg > 1:2953106/1‑148 (MQ=255) aTCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGtt > 2:2982624/1‑148 (MQ=255) tCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTc < 1:695752/148‑1 (MQ=255) tCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTc > 1:892244/1‑148 (MQ=255) tCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTc < 1:3193585/148‑1 (MQ=255) cATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTg > 2:1522167/1‑148 (MQ=255) ccTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGtat < 1:426395/148‑1 (MQ=255) ccTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGtat < 1:2091467/148‑1 (MQ=255) ccTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGtat > 1:141561/1‑148 (MQ=255) tgtgTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAg < 2:854683/148‑1 (MQ=255) gtAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACa < 1:1435193/148‑1 (MQ=255) tAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACaa > 2:753723/1‑148 (MQ=255) tAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACaa > 1:1084310/1‑148 (MQ=255) aCAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACaaaa > 1:2752133/1‑148 (MQ=255) gACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAATAAtt > 1:2635886/1‑148 (MQ=255) aCAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATtg > 1:2907730/1‑148 (MQ=255) cAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATtgc > 1:227759/1‑148 (MQ=255) cgcTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTgcgc < 1:259018/148‑1 (MQ=255) gcTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCt < 1:1522167/148‑1 (MQ=255) tGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTc > 2:712761/1‑148 (MQ=255) tGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTGATTTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGTCTAAATCTACCAGTTCGGTGGTATCAGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTTCGCTTTCCGc < 2:1230481/148‑1 (MQ=255) tGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGc > 2:2147647/1‑148 (MQ=255) gATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCt > 1:2985742/1‑148 (MQ=255) gATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCt > 1:1993460/1‑148 (MQ=255) gATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCt > 2:2774085/1‑148 (MQ=255) aaaTAGCTTTACCTGTGATGTTGTCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTAt > 1:1517433/1‑148 (MQ=255) aaaTAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTAt > 1:715624/1‑148 (MQ=255) aTAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGc < 2:2976796/148‑1 (MQ=255) tAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCa > 2:775052/1‑148 (MQ=255) gCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGa < 1:3135363/148‑1 (MQ=255) gCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGa < 1:2152298/148‑1 (MQ=255) gCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGa > 1:611421/1‑148 (MQ=255) cTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatg > 2:1467145/1‑148 (MQ=255) tgtgATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgc < 1:1062979/148‑1 (MQ=255) gtgAGGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgcc < 2:2541575/148‑1 (MQ=255) gATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgccat > 1:2542795/1‑148 (MQ=255) gATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgccat > 2:2846697/1‑148 (MQ=255) gATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgccat > 2:2846826/1‑148 (MQ=255) gATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTcatgccat > 2:1196265/1‑148 (MQ=255) gTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCatgccatgcc > 1:1750166/1‑148 (MQ=255) ttATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCg > 2:2961248/1‑148 (MQ=255) tATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCgg > 2:1666651/1‑148 (MQ=255) tCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGa < 1:672113/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGa < 1:1556001/148‑1 (MQ=255) cAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGAt > 1:1010455/1‑148 (MQ=255) aGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATa < 1:1126993/148‑1 (MQ=255) aGCGCAGGCGTATTTCAATTAGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATa > 2:609129/1‑148 (MQ=255) gcgcAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATaa < 1:2722354/148‑1 (MQ=255) cgcAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAg < 2:1066923/148‑1 (MQ=255) cgcAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAg < 2:2722478/148‑1 (MQ=255) aGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAgcgc < 2:1895921/148‑1 (MQ=255) ggCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGcc > 2:645965/1‑148 (MQ=255) tATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTATATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGaa < 2:3187318/148‑1 (MQ=255) tATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGaa > 2:2775924/1‑148 (MQ=255) tttCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATg < 1:1560347/148‑1 (MQ=255) tttCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATg > 2:2239162/1‑148 (MQ=255) ttCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGc > 2:1473005/1‑148 (MQ=255) ttCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGc > 1:2451405/1‑148 (MQ=255) tCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCt < 2:2100836/148‑1 (MQ=255) cAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTg < 2:2893364/148‑1 (MQ=255) cAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTg > 1:2036077/1‑148 (MQ=255) aTTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGc < 1:1477312/148‑1 (MQ=255) gATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTaa < 2:3122173/148‑1 (MQ=255) gATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTaa < 2:1084310/148‑1 (MQ=255) aTCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTaaa < 1:385218/148‑1 (MQ=255) tctcCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAg > 1:3313600/1‑148 (MQ=255) ctcCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGt < 1:1272171/148‑1 (MQ=255) cAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTtat > 2:2412271/1‑148 (MQ=255) gggAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATAtttttt > 2:2602152/1‑148 (MQ=255) ggAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTa > 2:2522155/1‑148 (MQ=255) ggAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTa > 2:484043/1‑148 (MQ=255) ggAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTa > 2:56738/1‑148 (MQ=255) gAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTaa > 2:2943996/1‑148 (MQ=255) gAAGATTACGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTaa > 2:1580482/1‑148 (MQ=255) gATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACtt < 2:1911802/148‑1 (MQ=255) aTTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACttt < 1:1323550/148‑1 (MQ=255) tACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTg < 1:3019911/148‑1 (MQ=255) tACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTg < 2:2311131/148‑1 (MQ=255) cGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGAt < 1:1634411/148‑1 (MQ=255) cGGCTAAATAAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGAt < 1:2933995/148‑1 (MQ=255) gCTAAATCAACCAGCTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCa < 2:508900/148‑1 (MQ=255) cTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCaa < 2:2029823/148‑1 (MQ=255) taaataaaCCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAAc < 1:2692007/148‑1 (MQ=255) tAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAAc < 1:2881456/148‑1 (MQ=255) tCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATTTTTTTTAACTTTTGATCAACAttt < 1:517878/148‑1 (MQ=255) tCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACAttt > 2:1403880/1‑148 (MQ=255) tCAACCAGTTCGGAGGTATCCGACATAAACCGTTCCTGAATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTACGCTTATGCAGATCTCATGCCAAGCCGCCATAATCGCCAGAATGCTGTCTTAAAGTTATATTTTTTAAATTTTGATCAACAttt > 1:24312/1‑148 (MQ=255) | GGGCGATGCTGATACTTTTCGCCAGCGCGGTAATCGCATCCTTGTGTAACAGACAACGCGCTTGCTGATAAATAGCTTTACCTGTGATGTTATCAGCGCAGGCGTATTTCAATTCGATCTCCAGATCAGGGAAGATTACGGCTAAATCAACCAGTTCGGTGGTATCCGACATAAACGGTTCCTGTATAAGACAAAAATTGCTGCGCTTTCCGCTTATGCAGATCTCATGCCATGCCGGGATAAGCGCCAGAATGCTGGCTTAAAGTTATATTTTTTAACTTTTGATCAACATTTG > CP009273/1557162‑1557456 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |