Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,869,697 | G→A | 7.8% | A46V (GCG→GTG) | yeaM ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,869,697 | 0 | G | A | 7.8% | 798.5 / 37.1 | 231 | A46V (GCG→GTG) | yeaM | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (115/98); new base A (11/7); total (126/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGTCCGAA > CP009273/1869551‑1869843 | gggTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGt > 2:1114393/1‑148 (MQ=255) ggTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTa < 2:1718825/148‑1 (MQ=255) ggTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTa > 2:88006/1‑148 (MQ=255) ggTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTa > 1:1489567/1‑148 (MQ=255) cGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAg < 1:2900224/148‑1 (MQ=255) tAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTg > 2:1879643/1‑148 (MQ=255) acagaaaacagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTcc < 2:862402/148‑1 (MQ=255) gaaaacagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCttt > 1:755591/1‑148 (MQ=255) gaaaacagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCttt > 1:1362042/1‑148 (MQ=255) aaaacagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTg > 2:1556701/1‑148 (MQ=255) aaaacagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTg < 2:2564138/148‑1 (MQ=255) acagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCgg < 2:2161950/148‑1 (MQ=255) acagaGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCgg < 2:43967/148‑1 (MQ=255) atatttCAGCATAAGATGTTACTTGATTGATAATAACCACCCAGAACGGTATCCAAACAGCATATTGTGGCCGCACCATCCACAAAGCATTTTAAACCGTACAGGAAATTGCACAATGTATCGCCAGTATAAGCTGTCCTTTGAGGTg > 2:2922218/5‑148 (MQ=255) agagTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTg < 1:2608061/148‑1 (MQ=255) agTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTCTGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCCTTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCACCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCt > 2:1856936/1‑148 (MQ=255) agTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCt > 1:528516/1‑148 (MQ=255) aGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGt > 2:18263/1‑148 (MQ=255) gCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTa > 1:2795555/1‑148 (MQ=255) cATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTAc < 1:1161320/148‑1 (MQ=255) cATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTAc > 1:194741/1‑148 (MQ=255) tAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAgg > 2:1120577/1‑148 (MQ=255) tAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAgg < 2:2519757/148‑1 (MQ=255) aGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGa < 1:2494657/148‑1 (MQ=255) tGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTg < 2:56249/148‑1 (MQ=255) gTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTgg > 2:2835518/1‑148 (MQ=255) ttACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGt > 1:1266972/1‑148 (MQ=255) ttACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGt < 1:2217367/148‑1 (MQ=255) ttACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATAGTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGt < 1:445370/148‑1 (MQ=255) aCTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTa < 2:759955/148‑1 (MQ=255) cTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTaa > 2:1645457/1‑148 (MQ=255) cTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTaa < 1:2992842/148‑1 (MQ=255) cTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTaa < 2:416051/148‑1 (MQ=255) ttGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAAc > 1:1820492/1‑148 (MQ=255) tGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCACCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACt > 1:2145633/1‑148 (MQ=255) ttGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCAt < 2:1500341/148‑1 (MQ=255) tGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATc < 2:2925356/148‑1 (MQ=255) tGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATc < 2:3019107/148‑1 (MQ=255) tGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATc > 1:88831/1‑148 (MQ=255) aTGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGtt < 1:307911/148‑1 (MQ=255) tGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTc < 1:2019215/148‑1 (MQ=255) tGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACAGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGATc > 1:2933607/1‑148 (MQ=255) gTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTcc > 2:2370957/1‑148 (MQ=255) ccACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGc > 2:1077921/1‑148 (MQ=255) cACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCg < 2:1376789/148‑1 (MQ=255) cccgcccgGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGa > 2:511848/1‑148 (MQ=255) ccgcccgGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGaa < 1:1106873/148‑1 (MQ=255) cgGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACaa < 2:3202558/148‑1 (MQ=255) gTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACaaaa < 1:1621970/148‑1 (MQ=255) aaaCCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGAc > 2:2109735/1‑148 (MQ=255) aaaCCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGAc > 2:9286/1‑148 (MQ=255) aCCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACcg > 2:124082/1‑148 (MQ=255) aCCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACcg > 1:511459/1‑148 (MQ=255) aCCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACcg > 1:545356/1‑148 (MQ=255) gCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCgg > 2:1354703/1‑148 (MQ=255) cATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGc < 1:1535888/148‑1 (MQ=255) tatTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCACCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCtt > 2:2289152/1‑148 (MQ=255) atTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTc < 2:1292522/148‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCa < 2:2092375/148‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGCAACATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGTTTAAATCATCCGTTCCGGCGTGAATAAAAAATGCGACCGCGGCTTCa < 1:217249/148‑1 (MQ=255) tgtgGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCAt > 2:2992093/1‑148 (MQ=255) gtgGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATg < 2:610488/148‑1 (MQ=255) tgGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATgg < 1:531330/148‑1 (MQ=255) ggggcACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACCGTTATTTGCACCTTGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATTTACAGGATTGGTTAACTCATCCGTTCCGGGGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGgtg < 1:616444/146‑1 (MQ=255) cACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTgtcgg > 2:1919673/1‑148 (MQ=255) cATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTgtcggtcg > 2:2022005/1‑148 (MQ=255) cATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTgtcggtcg > 2:1273401/1‑148 (MQ=255) tCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTATTTGCACCATTTAGCACCAGTTTCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTTATGTACTGGACTGGTTAACTCAGCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCggg < 1:1054902/148‑1 (MQ=255) acaAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTc > 2:225948/1‑148 (MQ=255) caAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCa > 2:2862771/1‑148 (MQ=255) aaaGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCAt < 1:2958610/148‑1 (MQ=255) aaGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATa > 2:214857/1‑148 (MQ=255) aaGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATa < 1:1607772/148‑1 (MQ=255) aGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCACCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAg > 2:2424771/1‑148 (MQ=255) aTTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCa > 1:775101/1‑148 (MQ=255) aTTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCACCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCa < 2:2363754/148‑1 (MQ=255) tttCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCAtt > 1:1388401/1‑148 (MQ=255) tttCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCAtt > 1:164558/1‑148 (MQ=255) tttCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCAtt > 1:2076217/1‑148 (MQ=255) ccACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTgag < 1:2717249/148‑1 (MQ=255) ccGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGAtt < 2:721039/148‑1 (MQ=255) cGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCGATTGAGATTc > 2:2306235/1‑148 (MQ=255) cGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTc > 2:1699616/1‑148 (MQ=255) cGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTc > 2:1694135/1‑148 (MQ=255) cGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTc > 1:1724479/1‑148 (MQ=255) tACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCaa > 1:1115790/1‑148 (MQ=255) tACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCaa > 1:638324/1‑148 (MQ=255) gTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCtgt > 2:1339385/1‑148 (MQ=255) aaTTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGc < 2:2723261/148‑1 (MQ=255) gCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGcatca < 1:2477082/148‑1 (MQ=255) cACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGcatcat > 1:3307446/1‑148 (MQ=255) aCCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCAtt < 2:509915/148‑1 (MQ=255) aCCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCAtt < 1:1578704/148‑1 (MQ=255) aCCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCAtt < 1:3216493/148‑1 (MQ=255) ccATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCAttt < 1:1833936/148‑1 (MQ=255) tGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGt < 2:2717438/148‑1 (MQ=255) gTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGTc < 2:2792369/148‑1 (MQ=255) gcgcCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGTCCGa < 1:2305019/148‑1 (MQ=255) cgcCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGTCCGaa < 1:1645457/148‑1 (MQ=255) cgcCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGTCCGaa < 1:1077703/148‑1 (MQ=255) | CGCTGGGTTCGATAAACAGAAAACAGAGTTCAGCATTAGCTGTTACTTGATTGCTATGTTCCACCCCGCCCGGTATCCAAACCGCATATTGTGGCGGCACCATCCACAAAGCATTTTCCACCGTACAGGTAATTGCACCATGTAGCGCCAGTATCAGCTGTCCTTTGCGGTGCTGATGTACAGGACTGGTTAACTCATCCGTTCCGGCGTGAATACAAAATGCGACCGCGGCTTCATGGTGTCGGTCGGGTTCATAGCCATTGAGATTCAACCTGTGCATCATTTTGTCCGAA > CP009273/1869551‑1869843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |