| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 176,864 | C→T | 8.7% | L381L (CTA→TTA) | dgt → | deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 176,864 | 0 | C | T | 8.7% | 771.9 / 42.8 | 231 | L381L (CTA→TTA) | dgt | deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (103/106); new base T (4/16); total (108/123) | |||||||||||
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Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAG > CP009273/176718‑177011 | tttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt > 1:2050471/1‑148 (MQ=255) tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtat < 1:1810571/148‑1 (MQ=255) ttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtata > 1:1346986/1‑148 (MQ=255) aTGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatata > 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aGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACt < 1:2159945/148‑1 (MQ=255) cGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACttt > 2:3142832/1‑148 (MQ=255) cGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACttt > 1:144447/1‑148 (MQ=255) gATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTa < 1:2834620/148‑1 (MQ=255) aTCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTAc < 1:2937979/148‑1 (MQ=255) tcttctTAATCTATATAATAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACt < 1:1857519/148‑1 (MQ=255) tcttctTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACt > 2:1090343/1‑148 (MQ=255) ttcttAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGa > 1:2092429/1‑148 (MQ=255) ttAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACt < 2:3138067/148‑1 (MQ=255) tAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTg > 1:3198339/1‑148 (MQ=255) aGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGt < 1:3209079/148‑1 (MQ=255) | TTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAG > CP009273/176718‑177011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |