Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 186,279 | 0 | A | T | 11.8% | 574.1 / 58.2 | 194 | noncoding (81/136 nt) | tff | novel sRNA, function unknown |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.19e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAATTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGCACATATTCCGGGGTGCCCTTTGGGGTCGGTAATATGGGATACGTGGAGGCATAACCCCAACTTTTATATAGAGGTTTTAATCATGGCAACTGTTTCCATGCGCGACATGCTCAAGGCTGGTGTTCACTTCGGTCACCAGACCCGTTA > CP009273/186132‑186425 | cGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAGTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGca < 1:396865/148‑1 (MQ=255) cGTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAGTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGca > 1:771411/1‑148 (MQ=255) gTCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAGTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGcac > 2:1091369/1‑148 (MQ=255) tCTGATGCTGTACACAGCGCCAACAGTTATTGGTGTCCACGACGTATTTGTGGTATAAAGCGCGCCGGACTTCCGATCCATTTCGTATACACAGACTGGACGGAAGCGACAATCTCACTTTGTGTAACAACACACACGTATCGGcaca > 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |