| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,064,466 | C→A | 9.4% | pseudogene (326/552 nt) | yeeP → | pseudogene, CP4‑44 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family;Phage or Prophage Related; putative histone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,064,466 | 0 | C | A | 9.4% | 641.9 / 25.9 | 181 | pseudogene (326/552 nt) | yeeP | pseudogene, CP4‑44 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family;Phage or Prophage Related; putative histone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (92/71); new base A (12/6); total (104/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GTATTCAGCCTTCTCCTGCACAGGCACAGAATATTCGCGAAAAAACGGAGGCGGTATTCCGTCTGTTCCGGCCCGTACATCCGGTTGTGGCCGTATCGGCCCGCACCGGCTGGGAACTGGATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTGT > CP009273/2064319‑2064613 | gTATTCAGCCTTCTCCTGCACAGGCACAGAATATTCGCGAAAAAACGGAGGCGGTATTCCGTCTGTTCCGGCCCGTACATCCGGTTGTGGCCGTATCGGCCCGCACCGGCTGGGAACTGGATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAgc > 1:519813/1‑148 (MQ=255) tATTCAGCCTTCTCCTGCACAGGCACAGAATATTCGCGAAAAAACGGAGGCGGTATTCCGTCTGTTCCGGCCCGTACATCCGGTTGTGGCCGTATCGGCCCGCACCGGCTGGGACCTGGATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAgcg > 2:1912606/1‑148 (MQ=255) tATTCAGCCTTCTCCTGCACAGGCACAGAATATTCGCGAAAAAACGGAGGCGGTATTCCGTCTGTTCCGGCCCGTACATCCGGTTGTGGCCGTATCGGCCCGCACCGGCTGGGAACTGGATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAgcg < 1:3016912/148‑1 (MQ=255) tATTCAGCCTTCTCCTGCACAGGCACAGAATATTCGCGAAAAAACGGAGGCGGTATTCCGTCTGTTCCGGCCCGTACATCCGGTTGTGGCCGTATCGGCCCGCACCGGCTGGGAACTGGATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAgcg 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gATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGaca < 2:2224629/148‑1 (MQ=255) aTACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGacac > 2:1397910/1‑148 (MQ=255) aTACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGacac < 1:1744094/148‑1 (MQ=255) tGGTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGga > 2:1850490/1‑148 (MQ=255) ggTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGgag > 2:748776/1‑148 (MQ=255) tCAGTGCGCTCATGACAGAGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGagag < 1:1513705/148‑1 (MQ=255) tCAGTGCGCTCATGACAGAGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGagag < 1:3155655/148‑1 (MQ=255) tCAGTGCGCTCATGACAGAGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGATTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGcgag < 1:2697836/148‑1 (MQ=255) gTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGt > 1:2808915/1‑148 (MQ=255) tGCGCTCATGACAGAGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTc > 2:53036/1‑148 (MQ=255) cgcTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTg > 1:1825292/1‑148 (MQ=255) cTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTa > 2:780357/1‑148 (MQ=255) tCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTAt > 2:608872/1‑148 (MQ=255) aCAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGTCGGAGAGCGTCTGTATTGCct < 2:519813/148‑1 (MQ=255) aCAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCct < 1:1911954/148‑1 (MQ=255) aGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCctct < 2:2147953/148‑1 (MQ=255) gcgcTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGACCAGTTTACCGGTGCGGGGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTg > 2:3171620/1‑148 (MQ=255) gcgcTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTg < 2:113343/148‑1 (MQ=255) cgcTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTGt < 2:2572301/148‑1 (MQ=255) cgcTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTGt > 1:3108678/1‑148 (MQ=255) cgcTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTGt > 2:158744/1‑148 (MQ=255) | GTATTCAGCCTTCTCCTGCACAGGCACAGAATATTCGCGAAAAAACGGAGGCGGTATTCCGTCTGTTCCGGCCCGTACATCCGGTTGTGGCCGTATCGGCCCGCACCGGCTGGGAACTGGATACGCTGGTCAGTGCGCTCATGACAGCGCTTCCCGACCATGCCGCCAGTCCCCTGATGACCCGACTGCAGGACGAGCTGCGCACGGAATCTGTCCGGTCTCAGGCCCGTGAACAGTTTACCGGTGCGGTGGACCGGATATTTGACACGGCGGAGAGCGTCTGTATTGCCTCTGT > CP009273/2064319‑2064613 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |