Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCA > CP009273/2225045‑2225331 | cTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCTAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTa > 1:1347981/1‑148 (MQ=255) gCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTaaa < 1:2408766/148‑1 (MQ=255) cTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAt < 2:1705465/148‑1 (MQ=255) cGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAttt > 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aaTGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGAGGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCATATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCa < 2:1474070/148‑1 (MQ=255) | CTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCA > CP009273/2225045‑2225331 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |