Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 2,266,590 | C→A | 7.6% | R250S (CGC→AGC) | yejA → | microcin C transporter YejABEF, periplasmic binding protein; ABC family |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,266,590 | 0 | C | A | 7.6% | 745.6 / 23.0 | 204 | R250S (CGC→AGC) | yejA | microcin C transporter YejABEF, periplasmic binding protein; ABC family |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
ACCCGCTCGCCACGCCTCCGCTTGCCAGTGGTCCGTACCGCGTTACGTCCTGGAAAATGGGGCAAAATATTGTCTATTCCCGTGTGAAAGATTACTGGGCAGCAAACTTACCGGTAAACCGTGGACGCTGGAATTTCGACACCATTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGATGAG > CP009273/2266444‑2266736 | aCCCGCTCGCCACGCCTCCGCTTGCCAGTGGTCCGTACCGCGTTACGTCCTGGAAAATGGGGCAAAATATTGTCTATTCCCGTGTGAAAGATTACTGGGCAGCAAACTTACCGGTAAACCGTGGACGCTGGAATTTCGACACCATTCg > 1:109673/1‑148 (MQ=255) cccGCTCGCCACGCCTCCGCTTGCCAGTGGTCCGTACCGCGTTACGTCCTGGAAAATGGGGCAAAATATTGTCTATTCCCGTGTGAAAGATTACTGGGCAGCAAACTTACCGGTAAACCGTGGACGCTGGAATTTCGACACCATTCGc > 2:163777/1‑148 (MQ=255) cccGCTCGCCACGCCTCCGCTTGCCAGTGGTCCGTACCGCGTTACGTCCTGGAAAATGGGGCAAAATATTGTCTATTCCCGTGTGAAAGATTACTGGGCAGCAAACTTACCGGTAAACCGTGGACGCTGGAATTTCGACACCATTCGc > 2:1435126/1‑148 (MQ=255) cTCGCCACGCCTCCGCTTGCCAGTGGTCCGTACCGCGTTACGTCCTGGAAAATGGGGCAAAATATTGTCTATTCCCGTGTGAAAGATTACTGGGCAGCAAACTTACCGGTAAACCGTGGACGCTGGAATTTCGACACCATTCGCTACg < 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aTTTCGACACCATTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATAcat > 2:1939372/1‑148 (MQ=255) acCTTTCGCTACTATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAg < 1:2041297/148‑1 (MQ=255) acCATTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGTTTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAg < 1:2041390/148‑1 (MQ=255) acCATTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAg > 2:3187863/1‑148 (MQ=255) acCAGTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAg < 1:3282315/148‑1 (MQ=255) ccATTCGCTACTATTATTACCTCGATGATAATGTCGCATTTGAAGCTTTTAAAGCAGGTGCATTTTATTTGCGTATGTAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGa < 1:1435126/148‑1 (MQ=255) ccATTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGa > 1:2322129/1‑148 (MQ=255) aTTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGATg > 1:1769519/1‑148 (MQ=255) ttCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGATGa > 2:2437192/1‑148 (MQ=255) ttCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGATGa < 2:3120012/148‑1 (MQ=255) tCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTCTGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGATGAg > 2:2440799/1‑148 (MQ=255) | ACCCGCTCGCCACGCCTCCGCTTGCCAGTGGTCCGTACCGCGTTACGTCCTGGAAAATGGGGCAAAATATTGTCTATTCCCGTGTGAAAGATTACTGGGCAGCAAACTTACCGGTAAACCGTGGACGCTGGAATTTCGACACCATTCGCTACGATTATTACCTCGATGATAATGTCGCCTTTGAAGCGTTTAAAGCAGGTGCCTTTGATTTGCGTATGGAAAACGACGCCAAAAACTGGGCCACGCGTTATACCGGTAAAAATTTCGATAAAAAATACATCATCAAAGATGAG > CP009273/2266444‑2266736 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |