| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,346,030 | T→C | 18.6% | intergenic (‑177/‑96) | glpT ← / → glpA | sn‑glycerol‑3‑phosphate transporter/sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,346,030 | 0 | T | C | 18.6% | 513.3 / 109.7 | 220 | intergenic (‑177/‑96) | glpT/glpA | sn‑glycerol‑3‑phosphate transporter/sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (84/94); new base C (26/15); total (111/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.25e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GATTAACAGCCTGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCATTGGCGGCGGCG > CP009273/2345886‑2346177 | aCAGCCTGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAAATGCCGCACACATTATTAAATAAAATTTTAAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAAACACGGTTCACctt > 1:1813038/1‑148 (MQ=255) gCCTGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGa < 2:936425/148‑1 (MQ=255) ccTGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCTATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGaa < 2:204570/148‑1 (MQ=255) tGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAAtt < 2:2383127/148‑1 (MQ=255) tGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAAtt < 2:142198/148‑1 (MQ=255) tGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAAtt < 1:3086071/148‑1 (MQ=255) aTTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTAt < 2:3048162/148‑1 (MQ=255) aTTCAGTGAGAGAACCTGCCGTGTCTTGTGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCAAAAATTAAATGTTAATTGCCGCACACAATATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCAAGAAATAACCTTTAAATTTCGAAatat > 1:1572786/1‑148 (MQ=255) cAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAg < 2:2814189/148‑1 (MQ=255) tGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGa < 1:3226120/148‑1 (MQ=255) tGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGa < 2:12191/148‑1 (MQ=255) tGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGa < 1:587825/148‑1 (MQ=255) agaACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAatag < 1:799436/148‑2 (MQ=255) aCCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATgcg < 2:1407106/148‑1 (MQ=255) ccTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAAAATTCATAAATTAAATGTGAAATGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTAAAAAAAGTTAAAAATTACGCATGAAAACACCTTTAACTTTAGAATTATTAGCGAataatcgc > 1:1397757/1‑143 (MQ=255) gCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGaa < 2:65674/148‑1 (MQ=255) cGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGACTCTGCGCGAAAt > 2:3074926/1‑148 (MQ=255) cGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAAt > 2:3074899/1‑148 (MQ=255) gTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATc < 2:489201/148‑1 (MQ=255) gTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATc > 1:2722481/1‑148 (MQ=255) tCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCaaa > 2:2237902/1‑148 (MQ=255) tCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCaaa > 2:363873/1‑148 (MQ=255) cTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAAc < 1:116092/148‑1 (MQ=255) ttGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAACTGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTTGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCa > 1:1471175/1‑148 (MQ=255) ccGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGt < 1:780171/148‑1 (MQ=255) ccGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGt > 1:2089415/1‑148 (MQ=255) gcgATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGttt < 2:348527/148‑1 (MQ=255) gcgATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGttt < 1:922971/148‑1 (MQ=255) gcgATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGttt < 1:3303065/148‑1 (MQ=255) cgATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGtttt > 1:1070510/1‑148 (MQ=255) cgATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGtttt > 1:553044/1‑148 (MQ=255) gATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACAAATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAACTGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGttttt < 2:2706525/148‑1 (MQ=255) aTGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTa < 2:409127/148‑1 (MQ=255) aTGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTa < 2:647098/148‑1 (MQ=255) tGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTAc > 2:2509118/1‑148 (MQ=255) tGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTAc > 2:3245514/1‑148 (MQ=255) gTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTCCt > 2:1742520/1‑148 (MQ=255) gTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACt > 1:111472/1‑148 (MQ=255) tAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTAt > 1:338626/1‑148 (MQ=255) aGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATgg < 1:932883/148‑1 (MQ=255) aaaCATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTa > 1:1305219/1‑148 (MQ=255) aaaCATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTa > 1:1305248/1‑148 (MQ=255) cATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGACTATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAAt > 2:1985386/1‑148 (MQ=255) ttCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATgg > 2:265601/1‑148 (MQ=255) ttCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATgg < 1:1287552/148‑1 (MQ=255) tCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGt < 2:2789674/148‑1 (MQ=255) taaattaaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTaaa > 2:550826/1‑148 (MQ=255) aaattaaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTaaaa < 2:48226/148‑1 (MQ=255) aattaaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTaaaaa < 2:804782/148‑1 (MQ=255) ttaaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAAc > 2:1342956/1‑148 (MQ=255) ttaaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAAc > 1:2704054/1‑148 (MQ=255) taaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACg < 1:1540358/148‑1 (MQ=255) taaatGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACg < 1:3206214/148‑1 (MQ=255) taaatGTGAAGTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACg < 1:1540321/148‑1 (MQ=255) ttGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCagag > 1:2413970/1‑148 (MQ=255) tGCCTCAAACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAgg < 1:2040626/148‑1 (MQ=255) cGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAATCAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGAt > 1:627177/1‑148 (MQ=255) cacacaTTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATaa > 2:1332133/1‑148 (MQ=255) cacaTTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCGTCACTTTCGAATGATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTCCACTGGCTAAAAGGTAAAAAACGAACTACAGAGGGAGAACa > 2:211635/1‑148 (MQ=255) acaTTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAACTGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCTAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACaa < 1:1692317/148‑1 (MQ=255) acaTTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACaa > 2:287515/1‑148 (MQ=255) acaTTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACaa > 1:23863/1‑148 (MQ=255) attattAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATg > 1:1572446/1‑148 (MQ=255) ttattaAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGa < 1:2613735/148‑1 (MQ=255) tattaAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGaa > 1:2072407/1‑148 (MQ=255) attaAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGaaa < 1:1858315/148‑1 (MQ=255) ttaAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGaaaa < 1:1316622/148‑1 (MQ=255) ttaAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGaaaa < 1:2819392/148‑1 (MQ=255) ttaAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGaaaa < 1:2628542/148‑1 (MQ=255) taAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAAc < 1:461603/148‑1 (MQ=255) taAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAAc > 2:1047772/1‑148 (MQ=255) aaTAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTc > 1:2268257/1‑148 (MQ=255) aTAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTcg < 2:3215585/148‑1 (MQ=255) tAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGTATAACAATGAAAACTcgc > 2:1780065/1‑148 (MQ=255) aaGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACTTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTAGGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTcgcg < 2:2004409/148‑1 (MQ=255) aaGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTcgcg < 2:334804/148‑1 (MQ=255) aaGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTcgcg > 1:1605328/1‑148 (MQ=255) ataTTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACTTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGa < 1:2859950/146‑1 (MQ=255) aGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGa < 1:2509118/148‑1 (MQ=255) cAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCaa > 2:2836497/1‑148 (MQ=255) aaTGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCa > 2:1482848/1‑148 (MQ=255) ttGTTCAAAATGACTAATGAAATCAGTTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCTAAATCAAACAATTATTTTTTTTACTATGGATAAATGTTAAAAAACGAACTTCAGTGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCaa < 1:2081022/147‑1 (MQ=255) tGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAg > 2:2531339/1‑148 (MQ=255) gTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGt > 1:2748758/1‑148 (MQ=255) gTTCAAAATGACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGt > 1:831014/1‑148 (MQ=255) tCAAAATGACGAATGAAATCACTTTTCACTTTCTAATTATGAGCTAATATGCGCTAAATAAAAAAATTAATTTTTTTACTTTGGATAATTGTTAAAAAACTAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGa < 1:2839810/148‑1 (MQ=255) aaaaTGACGCATTAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCTAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTTTGGCTAAATGTTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACg < 1:2914717/148‑1 (MQ=255) aTGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGa > 2:741700/1‑148 (MQ=255) tGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGAt > 1:3071090/1‑148 (MQ=255) gACGCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGAtt > 1:2348857/1‑148 (MQ=255) gCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATc < 2:1839396/148‑1 (MQ=255) gCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATc < 2:1316196/148‑1 (MQ=255) gCATGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATc < 2:3144302/148‑1 (MQ=255) cATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCa < 2:2762366/148‑1 (MQ=255) tGAAATCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCAtt > 1:2684046/1‑148 (MQ=255) gAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCATTg < 1:2161461/148‑1 (MQ=255) aaaTCACTTTTCACTTTCTAATTATGAGCTAATAGGCGCTAAAAAAAACAATTAATGTTTTTACTTTGGATAAATGTAAAAAAACGAACTTCAGAGGTATAACAATCAAAACCCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCATTgg < 1:661475/148‑1 (MQ=255) aaaTCACGCTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCATTgg > 2:1667640/1‑148 (MQ=255) aaTCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCATTggc > 1:3244896/1‑148 (MQ=255) agTTTCACTTACCAATTATGAGCGAATATGAGCGAAATAAAACAATTAATGTTTTTACTATGGCTAAAGGTTAAAAAACGAACTTAAGAGGGATAACAATGAAAACTCTCTACTCGCAATCAAGTGACGTGATGATCATTtgaggcgt > 2:588138/2‑147 (MQ=255) | GATTAACAGCCTGATTCAGTGAGAGAACCTGCCGTTTCTTGAGTTGCCGCGATGTTAAGAAAACATTCATAAATTAAATGTGAATTGCCGCACACATTATTAAATAAGATTTACAAAATGTTCAAAATGACGCATGAAATCACGTTTCACTTTCGAATTATGAGCGAATATGCGCGAAATCAAACAATTCATGTTTTTACTATGGCTAAATGGTAAAAAACGAACTTCAGAGGGATAACAATGAAAACTCGCGACTCGCAATCAAGTGACGTGATTATCATTGGCGGCGGCG > CP009273/2345886‑2346177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |