Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,409,935 | G→T | 36.1% | A570A (GCG→GCT) | pta → | phosphate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,409,935 | 0 | G | T | 36.1% | 247.5 / 145.7 | 163 | A570A (GCG→GCT) | pta | phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/49); new base T (29/30); total (84/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
CCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACC > CP009273/2409788‑2410080 | ccgtccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGACCAGCTGGCAGAAATcgcg > 1:3309004/1‑148 (MQ=255) ccgtccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATcgcg > 1:1170926/1‑148 (MQ=255) tccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGAtt > 2:3159030/1‑148 (MQ=255) cgccgcTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCa < 2:1121232/148‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTc < 1:1872170/148‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCg > 2:356765/1‑148 (MQ=255) tGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGc < 1:211361/148‑1 (MQ=255) gCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCt > 2:739550/1‑148 (MQ=255) aGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGa < 2:1415780/148‑1 (MQ=255) aGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGa < 2:1118670/148‑1 (MQ=255) cTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGAtt > 1:1920799/1‑148 (MQ=255) aTCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg > 1:2873764/1‑148 (MQ=255) aTCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg < 2:1170926/148‑1 (MQ=255) aTCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCg > 2:911616/1‑148 (MQ=255) tCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGc > 1:1294694/1‑148 (MQ=255) aaaaCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTg < 2:2804564/148‑1 (MQ=255) cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc < 1:1003991/148‑1 (MQ=255) cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc > 1:3171773/1‑148 (MQ=255) cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc > 1:3077499/1‑148 (MQ=255) cTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGAGTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGc < 1:2545103/148‑1 (MQ=255) tGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGcc < 2:1380012/148‑1 (MQ=255) ccGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCg < 2:241362/148‑1 (MQ=255) gggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGt < 1:1205373/148‑1 (MQ=255) ggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTa < 1:86978/148‑1 (MQ=255) gCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt < 1:3190233/148‑1 (MQ=255) gCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt > 1:2148507/1‑148 (MQ=255) cAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATc > 1:1597476/1‑148 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa < 2:1207420/148‑1 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa > 2:2366098/1‑148 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa < 2:675759/148‑1 (MQ=255) cTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGaa < 2:2479708/148‑1 (MQ=255) cTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGaa < 2:821749/148‑1 (MQ=255) cccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAAcc > 1:1197215/1‑148 (MQ=255) ccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcg < 2:83536/148‑1 (MQ=255) cTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgc > 2:2131667/1‑148 (MQ=255) gTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg < 1:3215361/148‑1 (MQ=255) gTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg < 1:3215517/148‑1 (MQ=255) gTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcgcg < 1:1926010/148‑1 (MQ=255) tATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGt < 1:671745/148‑1 (MQ=255) tATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGt > 2:2194478/1‑148 (MQ=255) tCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTg < 1:1545099/148‑1 (MQ=255) cTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTCTCGAACCGCGCGTTGc > 1:351141/1‑148 (MQ=255) ttCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCt < 2:1916210/148‑1 (MQ=255) ccGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTAt < 2:1008811/148‑1 (MQ=255) cGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGACCAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATg > 1:133507/1‑148 (MQ=255) gtTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGctc > 2:1601215/1‑148 (MQ=255) tcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCtctc > 2:200563/1‑148 (MQ=255) tcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCtctc > 2:1903589/1‑148 (MQ=255) cATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAc < 2:523446/148‑1 (MQ=255) cATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAc < 2:523297/148‑1 (MQ=255) ctgctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCa > 1:2768925/1‑148 (MQ=255) gctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCAcc > 2:1044021/1‑148 (MQ=255) gcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCAGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGt > 2:2253002/1‑148 (MQ=255) ccGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTa < 1:2438504/148‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc < 2:2389547/148‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc < 2:446219/148‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc > 1:1690739/1‑148 (MQ=255) aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc < 2:1570437/148‑1 (MQ=255) aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt > 2:2128818/1‑148 (MQ=255) aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt > 2:1612336/1‑148 (MQ=255) aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt < 1:626336/148‑1 (MQ=255) aCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCt > 2:424355/1‑148 (MQ=255) cAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTg < 2:1294694/148‑1 (MQ=255) aGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTgg < 1:2140445/148‑1 (MQ=255) tttccgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAATTCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGGTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTCCTTCTGGTGc > 2:963287/1‑148 (MQ=255) ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa > 2:898736/1‑148 (MQ=255) ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa > 2:900776/1‑148 (MQ=255) ttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGc > 1:980135/1‑148 (MQ=255) acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGa < 2:1351838/148‑1 (MQ=255) gACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAg > 1:754171/1‑148 (MQ=255) tgtgCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGaaa > 1:940967/1‑148 (MQ=255) tgtgCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGaaa > 2:2401936/1‑148 (MQ=255) gCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAg > 2:3030688/1‑148 (MQ=255) gCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAg < 1:3141183/148‑1 (MQ=255) tCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTcg < 2:2873764/148‑1 (MQ=255) aCCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGa < 1:603414/148‑1 (MQ=255) ccGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAg < 1:3077052/148‑1 (MQ=255) ggATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCa > 1:1713688/1‑148 (MQ=255) gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa < 2:2140715/148‑1 (MQ=255) gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa > 1:1111303/1‑148 (MQ=255) tCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACt > 1:1153185/1‑148 (MQ=255) tCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACt > 1:2946904/1‑148 (MQ=255) ccGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTc > 2:2667437/1‑148 (MQ=255) ccGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTc < 1:1722171/148‑1 (MQ=255) cGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCg < 1:367605/148‑1 (MQ=255) cGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCg < 1:3227038/148‑1 (MQ=255) gACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGt < 1:2101932/148‑1 (MQ=255) gCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGaa > 1:2157269/1‑148 (MQ=255) ggCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGaaaaa < 2:3228775/148‑1 (MQ=255) gCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCACCTCGTCTGGCGCAGGAAAAAc > 1:2035602/1‑148 (MQ=255) gCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAAc > 1:241297/1‑148 (MQ=255) aGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCTGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGAAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGt < 1:794353/148‑1 (MQ=255) aGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGt < 2:2749328/148‑1 (MQ=255) gAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTc > 1:1495274/1‑148 (MQ=255) aaaTCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcc > 1:508849/1‑148 (MQ=255) aTCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctg > 1:1299446/1‑148 (MQ=255) tCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctga > 1:2645382/1‑148 (MQ=255) tCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctga > 1:2756236/1‑148 (MQ=255) cgctATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctgac > 2:1826021/1‑148 (MQ=255) gcgATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctgacc < 1:3184756/148‑1 (MQ=255) | CCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACC > CP009273/2409788‑2410080 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |