| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,542,627 | T→G | 93.7% | I389M (ATT→ATG) | yfeW → | penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,542,627 | 0 | T | G | 93.7% | 649.8 / 15.1 | 174 | I389M (ATT→ATG) | yfeW | penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/3); new base G (62/101); total (70/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > CP009273/2542484‑2542771 | gCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGa < 1:108411/148‑1 (MQ=255) cACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATg > 1:275024/1‑148 (MQ=255) aCTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGt < 2:2769471/148‑1 (MQ=255) aCTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGt < 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gATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATaaaaa > 1:2355718/1‑148 (MQ=255) | GCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > CP009273/2542484‑2542771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |