| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,659,594 | C→A | 91.7% | L267L (CTC→CTA) | csiE → | stationary phase inducible protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,659,594 | 0 | C | A | 91.7% | 485.1 / 37.4 | 180 | L267L (CTC→CTA) | csiE | stationary phase inducible protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/8); new base A (92/73); total (99/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GGTTCCCGATCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCTTTCTGA > CP009273/2659450‑2659740 | ggTTCCCGATCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGcc < 1:2159550/148‑1 (MQ=255) cGATCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCg > 2:737179/1‑148 (MQ=255) gATCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGt > 2:2444481/1‑148 (MQ=255) aTCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGtt < 2:3009304/148‑1 (MQ=255) aTCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGtt < 2:3009353/148‑1 (MQ=255) aTCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGtt > 2:596167/1‑148 (MQ=255) ccATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTaa < 1:387149/148‑1 (MQ=255) aTTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAAt > 1:1061031/1‑148 (MQ=255) ttGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATc > 2:1515957/1‑148 (MQ=255) cGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCa > 2:2624028/1‑148 (MQ=255) ggATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgt > 1:1478826/1‑148 (MQ=255) ggATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgt < 2:245847/148‑1 (MQ=255) ggATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgt < 1:2568315/148‑1 (MQ=255) ggATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgt < 2:20132/148‑1 (MQ=255) gATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgtt < 1:2613726/148‑1 (MQ=255) aTGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgttt < 1:1622476/148‑1 (MQ=255) gcgcATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgtttgt < 2:2647909/148‑1 (MQ=255) cgcATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAgtttgtt > 1:254406/1‑148 (MQ=255) cATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGtttgtttg < 1:2965361/148‑1 (MQ=255) cATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGtttgtttg > 2:1081428/1‑148 (MQ=255) aTCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGc < 2:1379541/148‑1 (MQ=255) cAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCa > 1:1473535/1‑148 (MQ=255) aGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCAt < 2:712417/148‑1 (MQ=255) aGCGGGACAGACAAGTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCAt < 2:710882/148‑1 (MQ=255) cGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCg > 1:2338667/1‑148 (MQ=255) ggACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGt > 1:2511927/1‑148 (MQ=255) ggACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGt < 2:2431964/148‑1 (MQ=255) ggACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGt < 2:2582139/148‑1 (MQ=255) gacagacaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTa > 1:1927334/1‑148 (MQ=255) acagacaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTAt > 2:1783951/1‑148 (MQ=255) cagacaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTAtt < 1:677680/148‑1 (MQ=255) agacaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTg < 2:3268650/148‑1 (MQ=255) acaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGat < 1:21742/148‑1 (MQ=255) acaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGat < 1:21070/148‑1 (MQ=255) acaATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGat < 2:1820675/148‑1 (MQ=255) caATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGata > 2:2264149/1‑148 (MQ=255) caATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGata > 2:285547/1‑148 (MQ=255) caATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGata < 1:1515957/148‑1 (MQ=255) aTTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGataat < 1:1105418/148‑1 (MQ=255) aTTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGataat > 2:1293833/1‑148 (MQ=255) ttGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGataata > 2:1471682/1‑148 (MQ=255) gCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATAcc < 2:2247338/148‑1 (MQ=255) gCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATAcc < 1:2229428/148‑1 (MQ=255) tCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTCTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTg < 1:776404/148‑1 (MQ=255) cAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGc > 1:412122/1‑148 (MQ=255) gTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCg > 2:2454959/1‑148 (MQ=255) aTCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAag > 1:1094841/1‑148 (MQ=255) aaaCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGt > 2:2882432/1‑148 (MQ=255) aaCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGtt > 2:351362/1‑148 (MQ=255) aaCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGtt > 2:3093554/1‑148 (MQ=255) aaCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGtt > 1:3001771/1‑148 (MQ=255) aCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTc > 1:234138/1‑148 (MQ=255) aCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTc > 1:2214881/1‑148 (MQ=255) aCGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTc > 1:2826332/1‑148 (MQ=255) tCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGcc < 2:2203189/148‑1 (MQ=255) cTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCa > 1:2393752/1‑148 (MQ=255) ggTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGa > 1:462707/1‑148 (MQ=255) ggTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGa > 1:2626706/1‑148 (MQ=255) aaaCCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTg > 2:2746417/1‑148 (MQ=255) aaaCCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTg > 2:2746398/1‑148 (MQ=255) aaCCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGt > 1:2655131/1‑148 (MQ=255) cATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTAcc > 2:509018/1‑148 (MQ=255) tttCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCAc > 2:1341652/1‑148 (MQ=255) tCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGc < 2:21874/148‑1 (MQ=255) gAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTgg > 1:1044296/1‑148 (MQ=255) aGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGACGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGt > 2:1911869/1‑148 (MQ=255) gCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTg > 1:100849/1‑148 (MQ=255) gCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTg < 2:2531893/148‑1 (MQ=255) aaTGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGcacca > 1:784738/1‑148 (MQ=255) tttttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCcgcgcg > 1:229839/1‑148 (MQ=255) ttttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcgg > 1:904474/1‑148 (MQ=255) ttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcggcg < 2:1061031/148‑1 (MQ=255) ttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcggcg > 2:2375455/1‑148 (MQ=255) ttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcggcg < 1:204619/148‑1 (MQ=255) ttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcggcg < 1:205509/148‑1 (MQ=255) ttATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcggcg < 1:1274813/148‑1 (MQ=255) atgatgAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCgcgctgcgct < 2:152866/148‑1 (MQ=255) atgatgAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCgcggcgat < 1:328865/148‑3 (MQ=255) tgatgaACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTg > 1:2253569/1‑148 (MQ=255) atgaACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGc < 1:1722510/148‑1 (MQ=255) aaCAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCgg < 2:1478826/148‑1 (MQ=255) aaCAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCgg > 1:3111532/1‑148 (MQ=255) aCAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGa < 1:596167/148‑1 (MQ=255) ggggTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGAttt > 1:950537/1‑148 (MQ=255) ggTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCAGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGa > 1:2316233/1‑148 (MQ=255) ttATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGaaa < 1:539925/148‑1 (MQ=255) tATGTGATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAg < 1:285547/148‑1 (MQ=255) gtgATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGa < 1:1000384/148‑1 (MQ=255) tgATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGaa > 1:792294/1‑148 (MQ=255) tgATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGaa > 1:1856633/1‑148 (MQ=255) gATCAGCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAAt < 1:3068751/148‑1 (MQ=255) gCTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGc > 2:2134020/1‑148 (MQ=255) cTTTATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCg < 2:2662162/148‑1 (MQ=255) tttATACCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGt < 2:2393752/148‑1 (MQ=255) aCCCACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATc > 2:2774798/1‑148 (MQ=255) cccACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCt < 1:1709498/148‑1 (MQ=255) cccACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCt < 1:2264155/148‑1 (MQ=255) cACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCttt < 2:2511927/148‑1 (MQ=255) cACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCttt > 1:2738851/1‑148 (MQ=255) cACCTAGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCttt > 1:3230564/1‑148 (MQ=255) | GGTTCCCGATCCATTGCGGGATGCGCATCAGCGGGACAGACAATTGCGTCAGTCTATCAAACGTCTGGTAAACCATTTTCGTGAGCTGGGAAATGTTCGTTTTTATGATGAACAGGGGTTATGTGATCAGCTTTATACCCACCTCGCCCAGGCGTTAAATCGCAGTTTGTTTGCCATCGGTATTGATAATACCCTGCCGGAAGAGTTCGCCAGACTGTACCCACGCCTGGTGCGCACCACCCGCGCGGCGCTGGCCGGATTTGAAAGTGAATACGGCGTCCATCTTTCTGA > CP009273/2659450‑2659740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |