| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,665,772 | G→T | 100% | E123* (GAA→TAA) | hcaD → | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,665,772 | 0 | G | T | 95.3% | 353.3 / 8.2 | 130 | E123* (GAA→TAA) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/4); new base T (55/67); total (59/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGA > CP009273/2665627‑2665916 | tCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATaa < 2:2462073/148‑1 (MQ=255) cTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAAc > 2:2714552/1‑148 (MQ=255) cATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCCCGGCCGTTGCGTGTTGCACTGGGATAAccca > 1:3279500/1‑145 (MQ=255) aTTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgctg < 2:3263431/148‑1 (MQ=255) ttCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGGAGCTGGCCCCCTGCCGTTGCGTGATGCACTGGGATAACgctgc > 1:207482/1‑148 (MQ=255) tCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgctgc‑t < 2:2710073/148‑1 (MQ=255) tgtAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTAcc > 2:654717/1‑148 (MQ=255) gtAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGC‑TTTAccc > 1:2994441/1‑148 (MQ=255) aaCCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTa < 2:2729034/148‑1 (MQ=255) ccATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACg < 1:1813848/148‑1 (MQ=255) aTCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGACCCCAGCCGGTGCTTGATGCACTGGGCTAACGCTGC‑TTTAACCTACGcc > 1:1843254/1‑148 (MQ=255) cAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGACCCCGGCCCGTGCGTGATGCACTGGGGGAACGCTGC‑TGTTACCGACGccca > 1:2296058/1‑146 (MQ=255) aaaCGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGc < 1:509153/148‑1 (MQ=255) gCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGt < 2:743317/148‑1 (MQ=255) ggTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATg < 2:2544957/148‑1 (MQ=255) ggTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCGTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTGACCCTACGCCATGCCGGTGATg < 2:524406/148‑1 (MQ=255) ggTCGCGACACACGAGAGTGAGTGTTAACCACCGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATg < 2:2187071/148‑1 (MQ=255) gcgACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATgccgc < 2:304330/148‑1 (MQ=255) gcgACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATgccgc < 1:1138368/148‑1 (MQ=255) gACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCa < 2:1879430/148‑1 (MQ=255) cacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGa < 1:2667508/148‑1 (MQ=255) cacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGa < 1:2663854/148‑1 (MQ=255) acacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGAc < 1:82330/148‑1 (MQ=255) acacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGAc < 1:1451997/148‑1 (MQ=255) cGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGGCGCGCGACCCCGGCCCGTGGTTGTTTGACAGGGGTTAAGCGGC‑GTTAACCAACGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAgcaagc > 1:317652/1‑143 (MQ=255) gagaGTTAGTGGTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCg < 2:2809781/148‑1 (MQ=255) agagTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCga < 2:2411037/148‑1 (MQ=255) gagTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCCGCGCGCCCGCTGCCGTTGGTTGATTCCCTGGGTTAACGCGGG‑TTTTACCTAAGCCCAGGCGGGGATGGCCCCCGACTgggcg > 1:1308320/1‑144 (MQ=255) ttAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAg < 1:2945308/148‑1 (MQ=255) ttAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAg < 1:2945262/148‑1 (MQ=255) ttAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAg < 1:2716629/148‑1 (MQ=255) tAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGt < 1:561333/148‑1 (MQ=255) tAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCCCTGCCGGTGCTTTATTCCCTGGGGTAACGCGGC‑GTTAACCAAAGCCAAACCCGTGATTCCGCCAGAAAGCGAGAAGt > 1:1395048/1‑148 (MQ=255) aGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGtt < 1:2527110/148‑1 (MQ=255) gtTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGGCGCGCGACCGCGGCCGGTGGGTGTTTCACGGGGATCAAGCTGC‑GTTTCCCCACGCCCAGCCCGGGGTGCCGCCCGACAGCGCGAACGTCTg > 1:2935673/1‑148 (MQ=255) aCCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCCGCTCGACCGCTGCCGTTGCGTGATGCCCTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCAACGCCAGGCCGGTGATGCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCTGCAGc > 2:817311/1‑148 (MQ=255) aCCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCCGCTCGACCGCTGCCGTTGCGTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCGACCCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGc > 2:1865742/1‑148 (MQ=255) cAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGACCGCTGCCGTTGCTTGTTGCACTGGGATAACCCTGC‑TTTACCCTACGCCAAGCCGGGGATGCCGCCCGACTGCGAGAAGTTGTGCAGccc > 2:3222927/1‑148 (MQ=255) ccGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGGTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGa < 1:121367/147‑1 (MQ=255) 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gCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGt < 1:102886/148‑1 (MQ=255) gCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATTCACTGGGATAACGCTGC‑GTTTACCAACCCCAAGCCGGTGATTCCGCCAGACAGCCAGAAGTTATGCAGCCCCAAACGTCAGGCGTg > 1:2178119/1‑148 (MQ=255) gCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGCTAACGCTGC‑GTTACCCTACGCCCAGCCGGTGATTCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCGGCAGCCCCAACCGTCAGTCGTg > 1:2178226/1‑148 (MQ=255) cACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGa < 2:2433163/148‑1 (MQ=255) cACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGGTGCTTGATTCACTGGGATAACCCTGC‑TTTAACCTACGCCATGCCCGTGATGACGCCAGACAGCGAGAACTTCTTCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGa > 2:129797/1‑148 (MQ=255) 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cTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCAACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGc > 1:3073320/1‑148 (MQ=255) ccGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAgcg < 1:2579453/148‑1 (MQ=255) cGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAgcgc < 1:2714552/148‑1 (MQ=255) cTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCa < 2:556546/148‑1 (MQ=255) cTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCa < 2:556181/148‑1 (MQ=255) cGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgca > 1:3123252/1‑148 (MQ=255) gTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcag < 1:2186685/148‑1 (MQ=255) ttGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGACCTGGCTGCCAGCGCCAcgcagc > 2:2025522/1‑148 (MQ=255) tGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTTGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcg > 2:2742518/1‑148 (MQ=255) tGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcg > 2:2748260/1‑148 (MQ=255) tGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcg > 1:3071183/1‑148 (MQ=255) cTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcgca > 1:2196484/1‑148 (MQ=255) cTTGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcgca > 1:1490408/1‑148 (MQ=255) ttGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcgcag < 1:1818040/148‑1 (MQ=255) ttGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcgcag < 1:1816781/148‑1 (MQ=255) ttGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgcagcgcag < 1:1304776/148‑1 (MQ=255) tGATGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGa < 1:2632659/148‑1 (MQ=255) aTGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATg > 2:710396/1‑148 (MQ=255) aTGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATg > 2:710423/1‑148 (MQ=255) tGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGt < 2:3279573/148‑1 (MQ=255) tGCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGt < 2:3279500/148‑1 (MQ=255) gCACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTa > 1:2586222/1‑148 (MQ=255) cACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTaa < 2:317652/148‑1 (MQ=255) cACTGGGATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTaa < 2:317687/148‑1 (MQ=255) gggATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTg > 2:771664/1‑148 (MQ=255) ggATAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTCTCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGa < 1:1515707/148‑1 (MQ=255) | TCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGC‑TTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGA > CP009273/2665627‑2665916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |