| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,684,948 | 0 | T | A | 7.5% | 557.5 / 25.6 | 185 | intergenic (‑249/+67) | glmY/purL | sRNA activator of glmS mRNA, glmZ processing antagonist/phosphoribosylformyl‑glycineamide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (104/67); new base A (10/3); total (115/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
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aaaaaaGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGttt < 2:2891301/148‑1 (MQ=255) aaaaaGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGtttt < 1:1039440/148‑1 (MQ=255) aaaGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATCGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTcc < 2:1382965/148‑1 (MQ=255) aGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGGTAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCgg > 1:2592599/1‑148 (MQ=255) aGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCgg > 1:2791336/1‑148 (MQ=255) aGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCgg < 1:1704501/148‑1 (MQ=255) aGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCgg < 1:2249136/148‑1 (MQ=255) cGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCGGATGCCa > 1:2675028/1‑148 (MQ=255) gAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCGGATGCCAgg > 1:1922242/1‑148 (MQ=255) gAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCGGATGCCAgg < 1:2348121/148‑1 (MQ=255) gTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCGGATGCCAGGAg < 1:1605773/148‑1 (MQ=255) | GTAAATCAGCCACTGTGTCGCTAAAAAGAGACAACTTAAGATAAACTTATTAGATAATATTAAAATCAATGAGTTAAGTGTCGCCAGAAAGCGACACGGCAAACCACCCATTGTCGTGATTTACAGACACAAAAAAGCTCCCGGAGTTGGGAGCTTATGATAGTGGTTGGTGCTTAATGCCGCATCCGGGCTGCAAAACCAATGGGCTGACGACTTACCCCAACTGCTTACGCGCATTGCGGAAAATGCGCATCCATGGGCCATCCTCGCCCCAGTTTTCCGGATGCCAGGAG > CP009273/2684801‑2685093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |