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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,801,706 | 0 | C | A | 86.0% | 542.0 / 98.3 | 236 | pseudogene (32/1178 nt) | ygaY | pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
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Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TATCATGCCTACAAACCACATCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGCGCTGATCGTGCTGATGTCTATCGCCACCGGTCTGGCGGTAGCCAGTAACTATTACGCCCAGCCATTGCTCGACACCATCGCGCGTAACTTTTCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAGTTGGGCTA > CP009273/2801562‑2801850 | tATCATGCCTACAAACCACATCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGAGCt < 1:2095202/148‑1 (MQ=255) tCATGCCTACAAACCACATCGCACATTTCAACACTCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTGAGCCCGGAGCTGa < 2:2064164/148‑1 (MQ=255) tCATGCCTACAAACCACATCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGAGCTGa < 1:338201/148‑1 (MQ=255) tGCCTACAAACCACATCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGAGCTGATCg > 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caTCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGAGCTGATCGTGCTGATGTCTAt > 2:2769153/1‑148 (MQ=255) caTCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGAGCTGATCGTGCTGATGTCTAt > 2:1737656/1‑148 (MQ=255) caTCGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGATTAGCCCGGAGCTGATCGTGCTGATGTCTAt > 1:2918093/1‑148 (MQ=255) caTCGCACATTTCAACAATCGATCTTTCAGCCCATATTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATGACTAAACCTAATCATGAGCTTAGCCCGGAGCTGATCGTGCTGATGTCTAt < 1:2886394/148‑1 (MQ=255) cGCACATTTCAACAATCTATCTTTCATCCCATTTTCATCAACATCCGCTATTATTGATTTCCAGCTTAATCATCACCTGATGAACAAAAATAATCACTAAACCTAATGATGAGCTTAGCCCGGAGCTGATCGTGCTGATGTCTATCGc < 1:3098868/148‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |