| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,828,952 | C→A | 100% | T611T (ACG→ACT) | hypF ← | carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,828,952 | 0 | C | A | 100.0% | 550.3 / ‑6.7 | 189 | T611T (ACG→ACT) | hypF | carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base A (81/104); total (81/108) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAA > CP009273/2828807‑2829096 | gTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGt < 1:3260725/148‑1 (MQ=255) tgcctgccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtg > 2:2070927/1‑148 (MQ=255) gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg > 1:2540363/1‑148 (MQ=255) gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg > 1:345790/1‑148 (MQ=255) cAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACAGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGgcg > 1:1877213/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcac > 2:1756176/1‑148 (MQ=255) tCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcaca > 1:2101701/1‑148 (MQ=255) ccACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGccc > 2:2280345/1‑148 (MQ=255) cACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCa < 2:3141209/148‑1 (MQ=255) cACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCa < 2:775102/148‑1 (MQ=255) aCTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAg > 2:474540/1‑148 (MQ=255) tgcCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccg < 1:3224687/148‑1 (MQ=255) tgcCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGACTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccg < 1:1464548/148‑1 (MQ=255) tgcCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGACTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccg < 1:1464431/148‑1 (MQ=255) gAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccgccgcc > 1:1640219/1‑148 (MQ=255) aaGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCAc > 1:1934467/1‑148 (MQ=255) aGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACt > 1:54643/1‑148 (MQ=255) gTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTg < 2:3040987/148‑1 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGc > 1:1274311/1‑148 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGc > 1:2924154/1‑148 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGc < 2:14126/148‑1 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGc < 1:1532235/148‑1 (MQ=255) tGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGc < 1:1622209/148‑1 (MQ=255) gggCGAGATCCAGGTGATGGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGTTGCGTCACGCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCGGGCGCACAGCCCATAGCCGCCGCCACTGc < 1:1237587/147‑1 (MQ=255) agaTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGa < 1:2726732/148‑1 (MQ=255) agaTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGa > 1:1363964/1‑148 (MQ=255) agaTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGa < 2:2015238/148‑1 (MQ=255) agaTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCGTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGa > 1:1360595/1‑148 (MQ=255) ttGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGc > 1:784545/1‑148 (MQ=255) ttGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGc < 2:2335325/148‑1 (MQ=255) aTTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCca > 1:1739093/1‑148 (MQ=255) tCCACCCGCGGCATTGTCACCGTATGCGTCACTCCGTGGCTTGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACg < 1:810162/148‑1 (MQ=255) tCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCCGAGCCGCCGCCAGTGCATCGAAAAAACGCCCACACg < 1:2468615/148‑1 (MQ=255) ccACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGa < 2:3310718/148‑1 (MQ=255) aCCCGCGGCATTGTCACGGGTTGCGTAAGTCGGTGGCTTGAGGCTGCTAGCGCATCCAGCGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAATGTGGCTGGCGCACAGCCAAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATg < 1:2116303/148‑1 (MQ=255) aCCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATg < 2:254246/148‑1 (MQ=255) aCCCGCGGAATTGACACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAGGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCAACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATg < 1:866474/148‑1 (MQ=255) cccGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGa > 2:561295/1‑148 (MQ=255) cccGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGa > 2:561342/1‑148 (MQ=255) gcgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGc < 1:535816/148‑1 (MQ=255) gcgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGc < 2:699073/148‑1 (MQ=255) cATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACTCCCACACGATGACGCCAgc > 1:486063/1‑148 (MQ=255) tGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAgcggc > 2:1977916/1‑148 (MQ=255) tCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGgcgc > 1:2581385/1‑148 (MQ=255) cACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGATGCCAGCGGcgcg < 2:1033671/148‑1 (MQ=255) cACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGcgcg > 2:1132406/1‑148 (MQ=255) cGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTa > 2:721131/1‑148 (MQ=255) tGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTc > 2:950226/1‑148 (MQ=255) gCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAGCGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTcc < 2:815176/148‑1 (MQ=255) gCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTcc < 2:3262161/148‑1 (MQ=255) cGTCACTCGGGGGCTTGTGGCTGCGAGGGCCTCCAGAGCAAACGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCTAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCa < 1:1155404/148‑1 (MQ=255) cTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTc > 2:2184748/1‑148 (MQ=255) tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 2:987662/148‑1 (MQ=255) tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 2:987265/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa < 2:403768/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa > 2:2247049/1‑148 (MQ=255) cGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAt < 2:2841667/148‑1 (MQ=255) cGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAt < 2:2094976/148‑1 (MQ=255) gTGGAATGCGGCTGCGAGCGCCTCAAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTAATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATg < 1:3122971/148‑1 (MQ=255) tGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATgg < 2:1298596/148‑1 (MQ=255) tGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATgg < 2:2101701/148‑1 (MQ=255) gAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCcgcg > 1:702992/1‑148 (MQ=255) gAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCCTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCcgcg > 1:1107051/1‑148 (MQ=255) aGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACCGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCgcgc < 2:1739093/148‑1 (MQ=255) 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cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc < 1:1244665/148‑1 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc < 2:2141747/148‑1 (MQ=255) cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGGGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc < 2:2226903/148‑1 (MQ=255) gcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTcc < 2:1196445/148‑1 (MQ=255) gcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTcc < 2:1862068/148‑1 (MQ=255) ccTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCa > 1:1547103/1‑148 (MQ=255) cgccAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAg > 2:1818719/3‑148 (MQ=255) cTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAg < 2:1667673/148‑1 (MQ=255) cAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCTAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGttt < 1:2254654/148‑1 (MQ=255) caAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGtt > 2:1273023/1‑148 (MQ=255) gCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGca > 1:1824896/1‑148 (MQ=255) ccGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTTGCTGTCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATTGCCCGAGCCAGCACGCACCAGTTTTGCTGTTGcaa > 1:30860/1‑147 (MQ=255) ccGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcac > 1:1706521/1‑148 (MQ=255) cGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcaca < 2:1125454/148‑1 (MQ=255) gCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCacac < 2:1547103/148‑1 (MQ=255) gCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCacac > 2:672177/1‑148 (MQ=255) cTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACt < 2:2286691/148‑1 (MQ=255) tCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTg > 1:1371637/1‑148 (MQ=255) cACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGc < 1:1862517/148‑1 (MQ=255) aCCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCt > 2:2688541/1‑148 (MQ=255) ccTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTg > 2:511544/1‑148 (MQ=255) ccTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTg < 2:773365/148‑1 (MQ=255) cTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGt < 2:492183/148‑1 (MQ=255) tCATAACTTAACGGGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGttt < 1:1232437/148‑1 (MQ=255) tAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCag > 1:639827/1‑148 (MQ=255) 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tAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTaa < 2:54643/148‑1 (MQ=255) | GTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAA > CP009273/2828807‑2829096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |