| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 108,648 | Δ1 bp | 100% | coding (439/744 nt) | zapD ← | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 108,648 | 0 | G | . | 97.8% | 908.8 / 8.3 | 174 | coding (439/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base . (73/97); total (76/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTC > CP009273/108501‑108790 | ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAATGTTGCCGACTGTCGAATAAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg > 1:3746370/1‑148 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg < 1:1529551/148‑1 (MQ=255) cGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggt > 1:2945820/1‑147 (MQ=255) ttATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtag > 2:2808983/1‑145 (MQ=255) ttATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtag > 1:3463182/1‑145 (MQ=255) ttATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtag < 1:3192658/148‑4 (MQ=255) ttATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCAAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtag > 1:1928928/1‑145 (MQ=255) tATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtaga < 2:1394620/148‑5 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCAGGCTGTCGCGCTGCTCCTgggtatatgc > 2:1755089/1‑141 (MQ=255) aaaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaa > 1:1001645/1‑148 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaaa < 2:1340375/148‑1 (MQ=255) aaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAt < 1:1762782/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGTAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCCGCCACAt > 1:860932/1‑148 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTCAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg > 2:2226264/1‑148 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCTATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg < 2:3332044/148‑1 (MQ=255) aaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtg > 2:2226259/1‑148 (MQ=255) ccATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAAtgtg < 1:3550606/148‑1 (MQ=255) aTTCTGGGTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGTTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTTGCTGTCGGGCTGCGACT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCa < 1:3180384/148‑1 (MQ=255) aTTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCa > 1:2288536/1‑148 (MQ=255) aTTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCa < 1:3623282/148‑1 (MQ=255) ttCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCaa > 1:2819947/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCaa < 1:1014780/148‑1 (MQ=255) ttCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCaa > 1:1867184/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCaa > 2:3467890/1‑148 (MQ=255) cAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATg < 2:3630287/148‑1 (MQ=255) ggCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTa < 2:2925483/148‑1 (MQ=255) cTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAgg < 1:3204395/148‑1 (MQ=255) tGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGt > 1:2591180/1‑148 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa < 1:3393236/148‑1 (MQ=255) tttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaaa < 2:1053779/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 2:3025325/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 2:1559059/148‑1 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa > 2:689293/1‑148 (MQ=255) ttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaaa > 2:3151810/1‑148 (MQ=255) aaGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCa < 1:66358/148‑1 (MQ=255) gggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCaa > 1:823503/1‑148 (MQ=255) gggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAAc < 2:1597403/148‑1 (MQ=255) gggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAg < 1:2517255/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCt < 2:143299/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCt < 2:1316918/148‑1 (MQ=255) cTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTg > 1:1252391/1‑148 (MQ=255) cTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTg > 1:787561/1‑148 (MQ=255) ggCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTggg > 2:3717576/1‑148 (MQ=255) ggCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTggg > 2:791075/1‑148 (MQ=255) ggCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTggg > 2:2707398/1‑148 (MQ=255) gCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGa < 1:890083/148‑1 (MQ=255) gAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATg < 2:2580684/148‑1 (MQ=255) gAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATg < 2:1227852/148‑1 (MQ=255) aTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCt > 2:1654187/1‑148 (MQ=255) ttAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTc > 2:1923712/1‑148 (MQ=255) ttAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTc > 1:1334075/1‑148 (MQ=255) tCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCg < 2:2866168/148‑1 (MQ=255) tCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCg < 2:922068/148‑1 (MQ=255) tCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCg > 1:2237700/1‑148 (MQ=255) ccAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGc < 1:690594/148‑1 (MQ=255) ccATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGc > 1:2658139/1‑148 (MQ=255) tGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCAcc > 1:978935/1‑148 (MQ=255) tGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCAcc > 1:2007902/1‑148 (MQ=255) ggTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCa > 2:1194073/1‑148 (MQ=255) ggTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCa > 2:919435/1‑148 (MQ=255) ggTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCa > 2:1486978/1‑148 (MQ=255) gTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCag < 2:1725543/148‑1 (MQ=255) tAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCaga > 2:389625/1‑148 (MQ=255) aGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGc > 1:163983/1‑148 (MQ=255) tGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCATCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACAAGAGCaa > 1:3175955/1‑148 (MQ=255) gCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGTATGCTAAGTCGCTGACGCACCAGAGCAAt < 1:11480/148‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAAt > 2:2432487/1‑148 (MQ=255) tGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaa < 2:2046234/148‑1 (MQ=255) tGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCaa < 1:406346/148‑1 (MQ=255) ggTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAAc > 2:2118282/1‑148 (MQ=255) tGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGa < 2:1841342/148‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGAt < 2:3504485/148‑1 (MQ=255) aGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATc < 1:1634710/148‑1 (MQ=255) aGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATc < 2:2358894/148‑1 (MQ=255) gCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCt < 2:496324/148‑1 (MQ=255) gCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCt < 2:2416579/148‑1 (MQ=255) cGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCtt < 2:1180771/148‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCACATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCa < 2:1501754/148‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCa < 1:1403025/148‑1 (MQ=255) ggCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGa > 1:2387853/1‑148 (MQ=255) cTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGaaa < 1:2477555/148‑1 (MQ=255) gCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAACTTg > 2:3231515/1‑148 (MQ=255) gCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTg > 2:3231180/1‑148 (MQ=255) aaTCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGcc < 1:3174106/148‑1 (MQ=255) 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cgcgCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAAt < 1:3366925/148‑1 (MQ=255) | CACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTC > CP009273/108501‑108790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |