| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP009273 | = 1317577 | 181 (0.840) | coding (101/882 nt) | yciV | PHP domain protein | |||||
Only 100 of 9531 total aligned reads displayed.
CGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTCA > CP009273/1317430‑1317724 | cGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCga < 1:2944100/148‑1 (MQ=255) ttATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtg > 2:558520‑M2/1‑146 (MQ=255) ttATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtg < 1:2258557‑M2/148‑3 (MQ=255) 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gCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaat > 1:2410042‑M2/1‑40 (MQ=255) gCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaat > 2:491295‑M2/1‑40 (MQ=255) gAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcgg < 2:3283716‑M2/148‑123 (MQ=255) aaGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggg < 2:3220793‑M2/148‑124 (MQ=255) aGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcgggg > 2:2688500‑M2/1‑24 (MQ=255) 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ttGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagag > 1:1000798‑M2/1‑20 (MQ=255) tGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcgg > 2:739100‑M2/1‑16 (MQ=255) tGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcgg < 1:1608409‑M2/148‑133 (MQ=255) gCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggt > 2:1092177‑M2/1‑15 (MQ=255) cAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtat > 2:1252618‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcgggttgcggattg < 1:1398904‑M2/148‑144 (MQ=255) tCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgg > 2:1694710‑M2/1‑4 (MQ=255) | CGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTCA > CP009273/1317430‑1317724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |