New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | CP009273 | = 1541018 | 244 (1.130) | coding (409/882 nt) | yddG | aromatic amino acid exporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
TTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATGGG > CP009273/1540871‑1541164 | ttCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTaa > 1:699110/1‑148 (MQ=255) ttCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTaa > 2:1913016/1‑148 (MQ=255) ttCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTaa > 1:3002465/1‑148 (MQ=255) tCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAac > 1:3458683/1‑148 (MQ=255) aagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcCCTAaca < 1:3521777‑M2/7‑1 (MQ=255) aTTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACAcc < 1:827261/148‑1 (MQ=255) aTTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACAcc > 1:2794406/1‑148 (MQ=255) ttAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAAggaag < 1:1833165‑M2/148‑6 (MQ=255) ttAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACAccc > 1:2170139/1‑148 (MQ=255) aTCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACa > 1:1665151/1‑148 (MQ=255) aTCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACa > 1:2649749/1‑148 (MQ=255) tCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAg < 1:1713368/148‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGa < 1:3137851/148‑1 (MQ=255) tgcgtATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCcg > 1:2730993/1‑148 (MQ=255) gcgtATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGccca > 2:1979453/1‑146 (MQ=255) gtATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCcgacg < 2:2830115/148‑1 (MQ=255) atttattCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAg > 2:756278/1‑148 (MQ=255) atttattCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAg < 2:1445277/148‑1 (MQ=255) atttattCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAg > 1:1795456/1‑148 (MQ=255) 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aGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTAc > 2:2194521/1‑148 (MQ=255) gCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCa < 2:2280922/148‑1 (MQ=255) cccAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCaa < 1:1394982/148‑1 (MQ=255) cAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAAcc < 1:3586762/148‑1 (MQ=255) aGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttca > 2:3036587‑M2/1‑97 (MQ=255) 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cagggacttgttcgcaccttcCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATAc > 1:2382568‑M2/22‑148 (MQ=255) aTGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATAccc > 2:118825/1‑148 (MQ=255) tGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCa > 1:1263093/1‑148 (MQ=255) tGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCa > 1:1941363/1‑148 (MQ=255) gacttgttcgcaccttcCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCAc > 2:2393375‑M2/18‑148 (MQ=255) gTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCAc > 2:1233862/1‑148 (MQ=255) cccATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCa < 1:1608622/148‑1 (MQ=255) ccaaTTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCAAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCa < 1:995676/145‑1 (MQ=255) cATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAAt < 1:596807/148‑1 (MQ=255) cATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAAt < 1:2696135/148‑1 (MQ=255) tGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATAGc < 1:719710/148‑1 (MQ=255) cACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCtg < 2:2935907/148‑1 (MQ=255) ccGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCtgat > 1:512034/1‑148 (MQ=255) gCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCtgatga < 1:2006698/148‑1 (MQ=255) tAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtt < 1:926662‑M2/148‑146 (MQ=255) tAACACCGAACAGACGCAGACGTGTTCTAATAATAATCAAGTTACAATGTTCAAGTTGGTTTTCTGACCATTAAAAAGAATTGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGTGCCACAGATAGTTCACCATAACCACTTCTATCTCCTGATGATgg < 2:1389/148‑1 (MQ=255) tAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATgg > 1:1987382/1‑148 (MQ=255) aaCACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATggg < 1:1979341/148‑1 (MQ=255) aaCACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATggg > 2:2743497/1‑148 (MQ=255) aaCACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATggg > 2:392834/1‑148 (MQ=255) aaCACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATggg < 2:1795456/148‑1 (MQ=255) | TTCCATTAAATCCGCGTGCGTATTTATTCGTTACTGTGCAATAGGCTGCCCAGATAAACGCACCAATGAACGCCAGGAAATAACTCAATGGGCTGGTGGTGATATTATTGATGATTTCATCATAATGTAACCCATTGTCACCGCCTAACACCCAACAGACGCCGACGAGGGCTAATAATAATCCAGGTACAATCAACCAGTTGGTTTTCTGACCATTAAACAGAATGGCAAAGAGAATTGTCAGGCTGGGCCACAGATAGTTCACCATACCCACTTCAATCGCCTGATGATGGG > CP009273/1540871‑1541164 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |