| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3744959 = | 201 (0.930) | 262 (1.210) | 131/274 | NT | 58.5% | coding (270/741 nt) | yiaT | putative outer membrane protein |
| ? | CP009273 | = 3752673 | 170 (0.780) | coding (549/1845 nt) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor | |||||
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
ATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCC > CP009273/3752526‑3752820 | ggCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggt > 2:1473418‑M2/1‑145 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggta < 2:1649611‑M2/148‑5 (MQ=255) tCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGt < 2:2120640/148‑1 (MQ=255) tGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATGGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaa > 1:1121622‑M2/1‑136 (MQ=255) tGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattc < 1:2450544‑M2/148‑16 (MQ=255) tGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATc > 1:2930752/1‑148 (MQ=255) ggCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattcc > 2:737445‑M2/1‑132 (MQ=255) gCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATcgc > 1:1521165/1‑148 (MQ=255) gCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATcgc > 2:3260773/1‑148 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATcgcg < 1:3244874/148‑1 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATcgcg < 2:3485619/148‑1 (MQ=255) gTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTGAAATCCGTACCGGTTCCGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcgg > 1:3745830‑M2/1‑127 (MQ=255) ttttGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggc > 2:3177825‑M2/1‑126 (MQ=255) cATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACt < 1:1460736/148‑1 (MQ=255) cAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATGTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgc > 1:22133‑M2/1‑115 (MQ=255) acacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggcta > 2:1568361‑M2/1‑105 (MQ=255) acacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggcta > 1:74560‑M2/1‑105 (MQ=255) cacGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCTCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTg < 2:74995/148‑1 (MQ=255) acGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaag < 2:1544781‑M2/148‑46 (MQ=255) cGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagt < 1:2292766‑M2/148‑47 (MQ=255) tCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTcgcg > 2:1397834/1‑148 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGt > 1:2968890/1‑148 (MQ=255) gTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttt < 1:3383643‑M2/148‑54 (MQ=255) tttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttt < 2:1764171‑M2/148‑55 (MQ=255) tttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttt < 1:3330957‑M2/148‑55 (MQ=255) tttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcattttt < 1:3509211‑M2/148‑55 (MQ=255) ttatttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCg > 2:3748327/1‑148 (MQ=255) tttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttca < 2:536879‑M2/148‑59 (MQ=255) tttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCa > 1:3637880/1‑148 (MQ=255) ttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCaa < 1:1328307/148‑1 (MQ=255) taCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcact > 2:1024418‑M2/1‑88 (MQ=255) taCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcact > 1:3468496‑M2/1‑88 (MQ=255) cacCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcacttt < 2:1206780‑M2/148‑63 (MQ=255) acCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGa > 1:1744103/1‑148 (MQ=255) ccAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGaa < 2:1420816/148‑1 (MQ=255) cAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcg > 2:2812270‑M2/1‑83 (MQ=255) cAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAg < 2:3778236/148‑1 (MQ=255) aGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcga > 1:3766288‑M2/1‑82 (MQ=255) gTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggaagcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgac < 1:3417081‑M2/148‑68 (MQ=255) tCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAg < 1:2062635/148‑1 (MQ=255) aGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacaga > 1:2804683‑M2/1‑78 (MQ=255) aGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacaga > 1:890597‑M2/1‑78 (MQ=255) gCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaa > 2:1105801‑M2/1‑77 (MQ=255) gCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACGTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaa > 2:2718167‑M2/1‑77 (MQ=255) ccAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaat > 2:3723803‑M2/1‑76 (MQ=255) ccAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaat < 1:1089563‑M2/148‑73 (MQ=255) cAGAGTGTATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCt < 2:940882/148‑1 (MQ=255) cAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggcgaagttcatttttttcactttgcgacagaata < 2:809012‑M2/148‑74 (MQ=255) gagTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaa > 2:3318857‑M2/1‑73 (MQ=255) agTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaa < 1:3112591‑M2/148‑77 (MQ=255) aaTCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaaccta < 1:606271‑M2/148‑81 (MQ=255) tCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaac < 1:1979923‑M2/148‑83 (MQ=255) tCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaac < 1:445729‑M2/148‑83 (MQ=255) tCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAggg > 2:3131638/1‑148 (MQ=255) ccTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtg < 1:3254652‑M2/148‑86 (MQ=255) cTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtgg > 2:2360569‑M2/1‑62 (MQ=255) tACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggt > 2:249474‑M2/1‑61 (MQ=255) ccTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCAt > 1:539584/1‑148 (MQ=255) 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aGCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagc > 1:1873408‑M2/1‑21 (MQ=255) gCCCGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcg > 2:2529328‑M2/1‑20 (MQ=255) gCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGc < 1:92873/148‑1 (MQ=255) cccGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcgg < 2:2589820‑M2/148‑130 (MQ=255) cGGCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaa > 2:1611870‑M2/1‑17 (MQ=255) ggCACCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaat < 1:1777895‑M2/148‑133 (MQ=255) aCCTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgc > 2:2736623‑M2/1‑13 (MQ=255) ccTTTTACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgcc > 2:365481‑M2/1‑12 (MQ=255) ccTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaa > 1:259010/1‑148 (MQ=255) cTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaaa < 2:2655804/148‑1 (MQ=255) ttttACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgcctt > 2:597111‑M2/1‑10 (MQ=255) ttACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgccttcg > 1:1410475‑M2/1‑8 (MQ=255) tACGGTAggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgccttcgt > 2:3463152‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTa < 1:3554048/148‑1 (MQ=255) ggtaggtagggtcaaattccagcggcatccaggatgcggtcaggctaagttcatttttttcactttgcgacagaataaaacctaacgtggtctgacgaacataaaaagtatcaccttcataactaatcagcggaattgccttcgtatt > 1:3818704‑M2/1‑4 (MQ=255) ggTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTAt < 2:2234397/148‑1 (MQ=255) aaaTGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTcc < 1:3004680/148‑1 (MQ=255) | ATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTATTCC > CP009273/3752526‑3752820 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |