| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,590,728 | C→A | 6.0% | D65Y (GAT→TAT) | livK ← | leucine transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,590,728 | 0 | C | A | 6.0% | 1046.0 / 23.3 | 274 | D65Y (GAT→TAT) | livK | leucine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (160/97); new base A (14/3); total (174/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CTTCATAGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACGTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGGTGTGTGAAATTGC > CP009273/3590581‑3590875 | cTTCATAGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATc > 1:2464571/1‑148 (MQ=255)cTTCATAGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATc > 1:2256569/1‑148 (MQ=255) aGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCtt > 1:289214/1‑148 (MQ=255) aGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCtt > 2:1047707/1‑148 (MQ=255) aGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCtt > 1:1891562/1‑148 (MQ=255) gATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTa < 2:592621/148‑1 (MQ=255) atatCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTaa > 2:1328148/1‑148 (MQ=255) atatCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTaa > 2:1692853/1‑148 (MQ=255) tatCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAAt < 2:1762114/148‑1 (MQ=255) tCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATAGCCCTTAATTc < 1:129476/148‑1 (MQ=255) cTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTcc > 1:3035343/1‑148 (MQ=255) cTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTcc > 1:62380/1‑148 (MQ=255) cTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTcc > 1:701278/1‑148 (MQ=255) aCGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTccccc < 1:342469/148‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGGGTAGCAGAAGAACACAGATGACCAAGAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGGTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCt < 2:1239414/148‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCt < 1:886825/148‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCt < 1:3725956/148‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCt < 1:2074958/148‑1 (MQ=255) ggCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGATGGCGAACGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACAAGTTTATCGCCCTAAATTCACCCTTTgg > 2:246367/1‑148 (MQ=255) gCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGc > 1:2842093/1‑148 (MQ=255) gCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGc > 2:928152/1‑148 (MQ=255) gCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATAGCCCTTAATTCCCCCTTTGGc > 2:797254/1‑148 (MQ=255) ggTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTa < 1:641699/148‑1 (MQ=255) gTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTaa < 2:2670190/148‑1 (MQ=255) gTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTaa < 2:758143/148‑1 (MQ=255) agaagaagaACACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATg > 1:2107180/1‑148 (MQ=255) gaagaagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGt < 2:3117420/148‑1 (MQ=255) gaagaagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGt > 2:1121676/1‑148 (MQ=255) gaagaagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGt < 2:2654864/148‑1 (MQ=255) aagaagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTc < 2:3669577/148‑1 (MQ=255) agaagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCt > 2:753968/1‑148 (MQ=255) agaagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCt > 2:1178925/1‑148 (MQ=255) aagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCTTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTAAATTCCCCCTTTGTCATTAATGTCttt > 1:2640045/1‑148 (MQ=255) aagaaCACAGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCttt > 1:3202889/1‑148 (MQ=255) cacaGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTg < 2:3367692/148‑1 (MQ=255) aGATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATAGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTATTGTCTTTAATTGCCt > 2:3206159/1‑148 (MQ=255) gATGACCAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTg > 2:836079/1‑148 (MQ=255) cAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGAcgcgc > 1:464186/1‑148 (MQ=255) cAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGAcgcgc > 2:2893504/1‑148 (MQ=255) cAATAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGAcgcgc > 2:984699/1‑148 (MQ=255) aaTAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGAcgcgcg > 1:1168578/1‑148 (MQ=255) aaTAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGAcgcgcg > 2:1898700/1‑148 (MQ=255) aTAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACgcgcgc > 1:9666/1‑148 (MQ=255) tAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGcc > 1:3776919/1‑148 (MQ=255) tAACTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGcc > 1:286587/1‑148 (MQ=255) aaCTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCg > 2:3301074/1‑148 (MQ=255) aaCTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCg > 1:2317010/1‑148 (MQ=255) aaCTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCg < 2:3226243/148‑1 (MQ=255) aaCTTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGGTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCg < 2:3654365/148‑1 (MQ=255) acttATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGt > 2:2168826/4‑148 (MQ=255) ttATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTa < 1:2013894/147‑1 (MQ=255) tATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTaa > 1:2579113/1‑148 (MQ=255) aTTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTaaa > 1:1119762/1‑148 (MQ=255) tttAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAAt > 1:1624982/1‑148 (MQ=255) ttACTGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAAtt < 2:1940571/148‑1 (MQ=255) ttAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAAtt > 1:1791429/1‑148 (MQ=255) tAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGAAGCGCGCCGTTAAATTc > 2:3500745/1‑148 (MQ=255) aTGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCa > 1:1419116/1‑148 (MQ=255) aTGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCa > 1:3811854/1‑148 (MQ=255) aTGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGAATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCa < 2:3709182/148‑1 (MQ=255) ccGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCatat > 2:1391267/1‑148 (MQ=255) ccGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCatat < 1:1050660/148‑1 (MQ=255) aTTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGccc < 1:3333958/148‑1 (MQ=255) aTTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGccc < 2:404255/148‑1 (MQ=255) ttAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGcccc > 1:1520263/1‑148 (MQ=255) tAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCa > 2:2638630/1‑148 (MQ=255) aaCGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCAc > 2:3692892/1‑148 (MQ=255) cGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTg > 1:2511936/1‑148 (MQ=255) aTTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTggg > 1:3700064/1‑148 (MQ=255) aTTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTggg > 1:1809503/1‑148 (MQ=255) aTTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTggg < 2:1459891/148‑1 (MQ=255) ttttGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCAATAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTCGGc > 2:351752/1‑148 (MQ=255) tgGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCgg < 2:2176591/148‑1 (MQ=255) tgGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCgg > 2:51720/1‑148 (MQ=255) aCCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCgg > 2:2353178/1‑148 (MQ=255) aCCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCgg < 2:3250049/148‑1 (MQ=255) cAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACAt < 1:1216608/148‑1 (MQ=255) cAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACAt < 2:3473562/148‑1 (MQ=255) aCGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATcg < 1:2683862/148‑1 (MQ=255) cGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATcgc > 1:1555815/1‑148 (MQ=255) cGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATcgc > 1:2764191/1‑148 (MQ=255) ggCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATcgcg < 1:1702018/148‑1 (MQ=255) ggCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATcgcg < 2:892800/148‑1 (MQ=255) tGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGa < 1:2956211/148‑1 (MQ=255) gCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTaa < 1:1310909/148‑1 (MQ=255) gtcgtcATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAata < 1:3119065/148‑1 (MQ=255) gtcATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCTATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCg < 2:2373800/148‑1 (MQ=255) gtcATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCg < 2:2773165/148‑1 (MQ=255) tcATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGt > 1:2388136/1‑148 (MQ=255) atTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGc > 2:3755666/1‑148 (MQ=255) atTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGc > 2:1867940/1‑148 (MQ=255) ttCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGcc < 1:1718297/148‑1 (MQ=255) cAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGgt < 1:2192109/148‑1 (MQ=255) aaCCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGgtg < 1:2168826/148‑1 (MQ=255) ccAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGgtgtg > 1:1282408/1‑148 (MQ=255) ccAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGgtgtg > 1:1262981/1‑148 (MQ=255) ccAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGgtgtg > 2:2812997/1‑148 (MQ=255) tttATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATCGCGGTGTGTGaa > 2:1529543/1‑148 (MQ=255) ttATAGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGGTGTGTGaaa > 1:3264174/1‑148 (MQ=255) aTCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGACATAGAGGTGTGTGAAAtt > 1:3474447/1‑148 (MQ=255) | CTTCATAGATATCTGACGCAGGCTGGGTAGAAGAAGAACACAGATGACCAATAACGTATTTAATGCCGTCATTAACGATTTTGTTGGCGACCGCAACGGCTTGTTTCGGGTCGCATGCGTCGTCATATTCCACGCCAACCAGTTTATCGCCCTTAATTCCCCCTTTGGCATTAATGTCTTTAATTGCCTGACGCGCGCCGTTAAATTCCATATCGCCCCACTGGGCAATCGGGCCGGACATCGCGCCGACAACGGCGACTTTAATATCGTCAGCCATAGCGGTGTGTGAAATTGC > CP009273/3590581‑3590875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |