Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,796,526 | 0 | A | T | 17.4% | 888.3 / 165.9 | 344 | I324I (ATT→ATA) | waaB | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (159/125); new base T (33/27); total (192/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 |
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
AATTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGACAAG > CP009273/3796379‑3796673 | aaTTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGa > 1:1180731/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGaa > 1:3279642/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTAACTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGaa < 1:1546395/148‑1 (MQ=255) 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aTGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATc > 2:3167136/1‑148 (MQ=255) aTGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATc > 1:2093476/1‑148 (MQ=255) aTGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATc > 2:3526782/1‑148 (MQ=255) aTGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATc < 2:1064162/148‑1 (MQ=255) tGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATcc > 2:1679548/1‑148 (MQ=255) 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gAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGACaa > 1:1622746/1‑148 (MQ=255) gAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGACaa > 1:572396/1‑148 (MQ=255) | AATTAAGAAACTCAGTTTCCTGGAAAAACACCTGCTGCATTATTTCCTCCGGGAAATAGCAGAAATAATTACCTTATGTAATCTATCGTAATACTTCGATTGGTAAAATTCATCGATCGACGCAGGAATTTTTTCATGTTCGATATGAATTTCACCTGCTATATATTTATTTAGAAGAGTTACAAAACCAGCAATATCTCCCGGTTGATACAGATGGCCATTGACATCAGGTTGAATAATGTCAGCAGGCCCGGAGACACAATCGGCACTGATACAAGGAATCCCCCACGACAAG > CP009273/3796379‑3796673 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |