Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,410,964 | A→C | 100% | I390L (ATC→CTC) | ulaA → | L‑ascorbate‑specific enzyme IIC permease component of PTS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,410,964 | 0 | A | C | 99.6% | 855.9 / ‑5.4 | 212 | I390L (ATC→CTC) | ulaA | L‑ascorbate‑specific enzyme IIC permease component of PTS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (127/84); total (128/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CATCCTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGATCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCGGTATCGCCTTTATGGCCGTCATCATTGTA > CP009273/4410822‑4411107 | cATCCTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGaa > 1:2927043/1‑148 (MQ=255) tCCTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAAt < 2:3463008/148‑1 (MQ=255) ccTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATc > 1:3473811/1‑148 (MQ=255) ccTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTAGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATc > 1:793837/1‑148 (MQ=255) cTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCt < 2:1712767/148‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCttt < 1:78587/148‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCttt < 1:1398970/148‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTg < 2:2147429/148‑1 (MQ=255) cGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTc < 1:740542/148‑1 (MQ=255) ggCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCt < 2:1631596/148‑1 (MQ=255) gCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTg > 1:1267080/1‑148 (MQ=255) gCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTg > 1:2752678/1‑148 (MQ=255) gCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGATCGAAATCTTTGGTTGCGTCTg > 2:2543577/1‑148 (MQ=255) ctcctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTgg > 2:937190/1‑148 (MQ=255) ctcctcGATCCTGAGTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTgg < 2:2574894/148‑1 (MQ=255) cctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGc > 2:3423020/1‑148 (MQ=255) cctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGc > 2:3422940/1‑148 (MQ=255) ctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCg > 2:227330/1‑148 (MQ=255) ctcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTCGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGACAGGTGAAGGGGATGCTCGAAATCTTGGGTTGCGTCTCGGCg > 2:2154907/1‑148 (MQ=255) tcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCgg < 2:2421649/148‑1 (MQ=255) tcGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCgg < 1:3529305/148‑1 (MQ=255) tCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGaa > 2:1990487/1‑148 (MQ=255) ccTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGaaa > 1:2094622/1‑148 (MQ=255) ccTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGaaa > 2:10341/1‑148 (MQ=255) ccTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGaaa > 2:2732421/1‑148 (MQ=255) tGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACt > 2:3585294/1‑148 (MQ=255) attattCCTGGCTTTATCCCGTTGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTCACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGTTGGGGATGCGCGAAATCTTTGGTGGCGTGTGGGCGGTGAAACTCa > 2:2215081/1‑148 (MQ=255) attattCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCa < 1:270861/148‑1 (MQ=255) ttattCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCAc < 2:2793086/148‑1 (MQ=255) ttCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCgg > 2:1532616/1‑148 (MQ=255) ttCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCgg > 1:1968869/1‑148 (MQ=255) tCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGt > 2:1503245/1‑148 (MQ=255) tCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGt > 2:2195492/1‑148 (MQ=255) cTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCTCTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTAt < 1:2506766/148‑1 (MQ=255) cTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTAt < 2:1830571/148‑1 (MQ=255) ggCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGa > 1:3657036/1‑148 (MQ=255) gCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAg < 1:1742663/148‑1 (MQ=255) cTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGt > 1:1510351/1‑148 (MQ=255) cTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGACACCATCGGCGTGTTCGCAAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATATGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAAACTTTGGTTCCGTCAGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGt > 1:1230175/1‑148 (MQ=255) ttATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGc < 2:760005/148‑1 (MQ=255) aTCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCt > 1:897269/1‑148 (MQ=255) tGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATggg > 1:588073/1‑148 (MQ=255) tGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATggg > 1:2795907/1‑148 (MQ=255) gTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGc > 1:3260204/1‑148 (MQ=255) ttcttcTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCa > 1:3247855/1‑148 (MQ=255) ttcttcTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCa < 1:2946653/148‑1 (MQ=255) ttcttcTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCa > 1:2675585/1‑148 (MQ=255) ttctCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATgg < 1:1008652/148‑1 (MQ=255) ttctCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATgg < 1:3819634/148‑1 (MQ=255) tAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGAGTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGAc > 2:550134/1‑148 (MQ=255) aaCGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACt > 1:1202783/1‑148 (MQ=255) aaCGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACt < 2:2704346/148‑1 (MQ=255) aaCGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACt > 1:2922004/1‑148 (MQ=255) aCGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTg > 1:2383212/1‑148 (MQ=255) aCGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATGTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTg > 2:2005584/1‑148 (MQ=255) gCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGt > 2:2061524/1‑148 (MQ=255) caccaTCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCg > 1:2039502/1‑148 (MQ=255) caTCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGAtt < 2:2639895/148‑1 (MQ=255) tCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTTCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCt > 1:2917659/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTTCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCt > 1:3739635/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTACGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCt < 2:781113/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTTTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTg > 1:955579/1‑148 (MQ=255) cGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGCTGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTg > 2:1077181/1‑148 (MQ=255) cGGCGTGTTCGCTAACCACATCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTg > 1:953459/1‑148 (MQ=255) ggCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTTGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTgg < 2:2821623/148‑1 (MQ=255) tgtTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAcc > 2:3362275/1‑148 (MQ=255) tgtTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAcc > 2:1461063/1‑148 (MQ=255) gtTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCCTGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAccg > 2:3636600/1‑148 (MQ=255) cGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAccgccg < 1:1773101/148‑1 (MQ=255) cGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAccgccg < 1:1806477/148‑1 (MQ=255) cGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCAccgccg < 1:528886/148‑1 (MQ=255) gCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCga < 1:1281562/148‑1 (MQ=255) cTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCgat > 1:3576013/1‑148 (MQ=255) tAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCgatg < 2:167947/148‑1 (MQ=255) aaCCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCgatga > 1:226665/1‑148 (MQ=255) aCCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCgatgat < 2:325681/148‑1 (MQ=255) cTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCaa > 1:1003850/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCaa < 1:663174/148‑1 (MQ=255) gcggcTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGctt < 1:778410/148‑1 (MQ=255) cggcTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGcttc < 2:885651/148‑1 (MQ=255) gcTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGcttctt < 1:2601826/148‑1 (MQ=255) ggCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTtctc < 2:2017379/148‑1 (MQ=255) gCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTcc > 1:2441685/1‑148 (MQ=255) tGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATc < 2:1321998/148‑1 (MQ=255) 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ggATGCTCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTATACATCGGTATCGCCTTTATGGCCGTCCTCATTGt > 1:668552/1‑148 (MQ=255) | CATCCTGGTCGCCTGCGGCTCCTCGATCCTGATTATTCCTGGCTTTATCCCGATGTTCTTCTCTAACGCCACCATCGGCGTGTTCGCTAACCACTTCGGCGGCTGGCGTGCGGCGCTGAAGATTTGTCTGGTGATGGGGATGATCGAAATCTTTGGTTGCGTCTGGGCGGTGAAACTCACCGGTATGAGTGCCTGGATGGGCATGGCGGACTGGTCGATTCTGGCACCGCCGATGATGCAAGGCTTCTTCTCCATCGGTATCGCCTTTATGGCCGTCATCATTGTA > CP009273/4410822‑4411107 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |